BRESEQ :: Evidence

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      tACAAACAGCCTTACTCCTGATGCAACATATGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCg                                                                                                                                 <  1:987414/140‑1 (MQ=255)

          aaCAGCCTTACTCCTGATGCAACATATGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGa                                                                                                                             <  2:1229690/140‑1 (MQ=255)

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            cAGCCTTACTCCTGATGCAACATATGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATa                                                                                                                           >  2:1524171/1‑140 (MQ=255)

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                              aaCATATGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATg                                                                                                         <  2:322616/140‑1 (MQ=255)

                               aCATATGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATgg                                                                                                        >  1:939978/1‑140 (MQ=255)

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                                  tatGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTtc                                                                                                     <  2:232690/140‑1 (MQ=255)

                                   atGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGAGAGTTAATAATGGTtct                                                                                                    <  2:332146/140‑1 (MQ=255)

                                   atGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTtct                                                                                                    <  2:273064/140‑1 (MQ=255)

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                                                     aaCGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGaa                                                                                  <  1:672050/140‑1 (MQ=255)

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                                                     aaCGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGaa                                                                                  >  1:1293623/1‑140 (MQ=255)

                                                      aCGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAAt                                                                                 <  2:623668/140‑1 (MQ=255)

                                                         tgttgtTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTa                                                                              >  1:1313793/1‑140 (MQ=255)

                                                         tgttgtTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTa                                                                              >  2:39683/1‑140 (MQ=255)

                                                         tgttgtTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTa                                                                              >  2:136762/1‑140 (MQ=255)

                                                            tgttgATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAAt                                                                           <  2:646806/140‑1 (MQ=255)

                                                             gttgATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAAtt                                                                          >  2:779828/1‑140 (MQ=255)

                                                             gttgATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAAtt                                                                          <  1:570945/140‑1 (MQ=255)

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                                                                     cAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACt                                                                      >  1:413036/1‑136 (MQ=255)

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                                                                      aaGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGa                                                                 <  1:268376/140‑1 (MQ=255)

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                                                                           cTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTa                                                            <  2:1313793/140‑1 (MQ=255)

                                                                           cTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTa                                                            <  1:136762/140‑1 (MQ=255)

                                                                           cTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTa                                                            <  2:1215124/140‑1 (MQ=255)

                                                                               cAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGa                                                        >  1:55390/1‑140 (MQ=255)

                                                                                agagCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGAt                                                       >  1:1077854/1‑140 (MQ=255)

                                                                                   gCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGAttaa                                                    >  1:280556/1‑138 (MQ=255)

                                                                                   gCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTta                                                    <  2:739899/140‑1 (MQ=255)

                                                                                      gtgtATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTtaact                                                 >  2:1089336/1‑140 (MQ=255)

                                                                                       tgtATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTtaacta                                                >  1:636335/1‑140 (MQ=255)

                                                                                       tgtATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTtaacta                                                >  2:930097/1‑140 (MQ=255)

                                                                                        gtATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTtaactaa                                               <  1:779828/140‑1 (MQ=255)

                                                                                         tATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAGCTTCAGATACTATCGATTtaactaac                                              >  1:1135867/1‑140 (MQ=255)

                                                                                           tttAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTTAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACgg                                            <  1:119869/140‑1 (MQ=255)

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                                                                                                   aGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGGCAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTtaactaa                                               <  2:187180/129‑1 (MQ=255)

                                                                                                   aGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGtt                                          <  2:724200/134‑1 (MQ=255)

                                                                                                   aGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGtt                                          >  1:724200/1‑134 (MQ=255)

                                                                                                   aGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGc                                    >  1:1417809/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                   aGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGc                                    >  2:1309682/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                   aGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGc                                    >  1:849890/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                    gCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGA‑TTAACTAACGGTTCTTCGCTg                                  <  2:280556/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                         gAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACa                              <  2:303741/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                          aaTAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACAt                             >  2:888579/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                               cGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTg                        >  1:994875/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                 gTTCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGaa                      <  1:659859/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  ttCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAg                     >  1:1371431/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                   tCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGa                    <  2:1077854/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tCTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGa                    <  1:972088/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    cTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGAt                   >  2:487368/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                    cTGAATGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGAt                   >  1:129296/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                       aaTGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGc                <  2:160811/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       aaTGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGc                <  2:1371431/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       aaTGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGc                <  2:1162422/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                         tGGGATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTa              >  1:376290/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                           ggATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACg            <  2:974252/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                            gATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATgg                 >  2:136771/1‑134 (MQ=255)

                                                                                                                            gATACTACAGGTTGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGt           <  2:754807/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                            gATACTACAGGTTGATCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGt           <  1:1047997/140‑1 (MQ=255)

TGTTGCTACAAACAGCCTTACTCCTGATGCAACATATGAAAACAATGACTGGAAACGTGTTGTTGATGACAAGGTCTTCCAGAGCGGTGTATTTAACGTAGCGTTGAATAACGGTTCTGAATGGGATACTACAGGTCGTTCCATCGTTGATACCTTGACAGTTAATAATGGTTCTCAGGTTAATGTTTCGGAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGA  >  NC_000913/391372‑391644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 40 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`