| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,369,301 | (T)6→7 | coding (178/465 nt) | yhcH ← | DUF386 domain‑containing protein YhcH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,369,295 | 1 | . | T | 98.6% | 242.7 / ‑3.6 | 69 | coding (184/465 nt) | yhcH | DUF386 domain‑containing protein YhcH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base T (34/34); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
TGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑TTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTGTAACG > NC_000913/3369163‑3369429 | tgctgcAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑ttttttt > 1:404314/1‑139 (MQ=255) gctgcAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑tttttttc > 1:379696/1‑138 (MQ=255) tgcAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAGTTCCGC‑tttttttctc > 2:775736/1‑136 (MQ=255) tgcAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑tttttttctc > 1:783550/1‑136 (MQ=255) tgcAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑tttttttctc > 2:196864/1‑136 (MQ=255) cAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGa > 1:771186/1‑140 (MQ=255) aaaGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGAc < 2:472504/140‑1 (MQ=255) gCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACggg < 2:404314/140‑1 (MQ=255) cTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGc > 2:518868/1‑140 (MQ=255) gATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGa > 1:278423/1‑140 (MQ=255) gATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGa > 2:325518/1‑140 (MQ=255) tcatcCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAg < 2:43231/140‑1 (MQ=255) catcCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAgt > 1:239581/1‑140 (MQ=255) tcCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGAtt > 2:170496/1‑134 (MQ=255) tcCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGAtt < 1:170496/134‑1 (MQ=255) tcCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAgtgt > 2:691619/1‑140 (MQ=255) tCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTaa > 2:326982/1‑140 (MQ=255) tggtggAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGa < 1:337455/130‑1 (MQ=255) tggtggAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGa > 2:337455/1‑130 (MQ=255) gAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTa > 1:88394/1‑131 (MQ=255) gAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTa < 2:88394/131‑1 (MQ=255) aaCTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGa < 1:627701/140‑1 (MQ=255) aCTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGAc < 2:440632/140‑1 (MQ=255) ctctTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACa < 2:771186/140‑1 (MQ=255) ctctTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACa < 1:325518/140‑1 (MQ=255) ctctTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACa < 2:115727/140‑1 (MQ=255) tCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCa < 1:326982/140‑1 (MQ=255) tCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCa < 2:278423/140‑1 (MQ=255) cacaCTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCAt < 2:265093/140‑1 (MQ=255) cacaCTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCAt > 2:244181/1‑140 (MQ=255) acacTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATa < 1:196864/140‑1 (MQ=255) acTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATaaa > 2:266850/1‑140 (MQ=255) aCGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCAt < 1:149695/133‑1 (MQ=255) aCGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCAt > 2:149695/1‑133 (MQ=255) cgcgCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGa > 2:41675/1‑125 (MQ=255) cgcgCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGa < 1:41675/125‑1 (MQ=255) cgcgCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATa < 1:287815/133‑1 (MQ=255) cgcgCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATa > 2:287815/1‑133 (MQ=255) cgcAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTg < 2:783550/140‑1 (MQ=255) aGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCg < 2:349379/140‑1 (MQ=255) aGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCg < 1:691619/140‑1 (MQ=255) gccaAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCg > 1:495793/1‑140 (MQ=255) gccaAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCg > 2:412142/1‑140 (MQ=255) gccaAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCg > 1:407256/1‑140 (MQ=255) aaCAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAAc > 1:803170/1‑140 (MQ=255) gAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGAcc < 1:266850/140‑1 (MQ=255) ttCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCt > 1:50914/1‑140 (MQ=255) tCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCtt > 2:518756/1‑140 (MQ=255) cACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑TTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCt > 1:830116/1‑140 (MQ=255) aCCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCt < 2:239581/140‑1 (MQ=255) cGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTg > 1:381184/1‑140 (MQ=255) cGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTg > 1:500463/1‑140 (MQ=255) aaCAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGCCTgg < 1:518868/140‑1 (MQ=255) gCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGc < 1:411952/140‑1 (MQ=255) gCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGc < 2:803170/140‑1 (MQ=255) gCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGc > 2:711268/1‑140 (MQ=255) cTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCt > 1:566899/1‑140 (MQ=255) cTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCt > 1:106512/1‑140 (MQ=255) atatCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATg > 1:683357/1‑140 (MQ=255) tatCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGc < 1:711268/140‑1 (MQ=255) tCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGt > 2:461054/1‑124 (MQ=255) tCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGt < 1:461054/124‑1 (MQ=255) aTGTATTGCTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCg < 2:683357/140‑1 (MQ=255) cTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAAcgcg < 1:56681/140‑1 (MQ=255) cTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAAcgcg > 1:649425/1‑140 (MQ=255) cTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAAcgcg > 2:128316/1‑140 (MQ=255) cTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAAcg > 2:435722/1‑138 (MQ=255) cTCGTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAAcg < 1:435722/138‑1 (MQ=255) gTGCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTcc > 1:325551/1‑140 (MQ=255) gCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTg > 2:551850/1‑140 (MQ=255) gCAATTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTg > 1:814172/1‑140 (MQ=255) aTTCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTGTaa < 1:465716/140‑1 (MQ=255) tCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTGTAACg < 2:106512/140‑1 (MQ=255) tCCGCTTTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTGTAACg < 2:814172/140‑1 (MQ=255) | TGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCACCGTTTAATAACAGCTGGATATCAATGTATTGCTCGTGCAATTCCGC‑TTTTTTCTCGACGGGCGATTGAGTGTTAAACGTCATGACATTCATAAAGATATTGTCGCCCTGTAATTCGTAACGACCCGGCGCTTTTTCTTGCGGTCTGGCAGCTAATGCCAGCGTTAACGCGTCCTGTAACG > NC_000913/3369163‑3369429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |