Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 2,375,828 | IS186 (–) +4 bp | coding (132‑135/963 nt) | menC ← | o‑succinylbenzoate synthase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2375828 = | 0 (0.000) | 48 (0.660) | 35/268 | 0.9 | 100% | coding (135/963 nt) | menC | o‑succinylbenzoate synthase |
? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 2375831 | 0 (0.000) | 67 (0.930) | 51/268 | 0.2 | 100% | coding (132/963 nt) | menC | o‑succinylbenzoate synthase |
? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
GCGCGCAGGTATACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2375955‑2375828 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG > NC_000913/2514273‑2514415 GCGCGCAGGTATACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCCCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGGAGGGGGGGGGGGGATCTCCCATAAGCGC > 2:1036314/1‑140 agacagGGTATACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCT < 1:239015/134‑1 GGTATACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:846613/140‑1 GTATACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAA < 1:359030/140‑1 TACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGTGCTAACTTAAGGG < 1:912042/140‑1 CGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGGGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:243432/1‑140 CTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCT < 1:688571/125‑1 CTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGGGGGGGGGGATCTCCCATAAGCGCT > 2:688571/1‑125 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGCGGGTTAAAAACCC‑CGACGGGCTGGATGTTTGCCTGGCGGAAGGCGAGCGCGGAAGGTGGGGGGGGGTCTCCCATAAGCGCGAACTTAAGGGTGGTGGT > 2:742296/1‑140 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGGGGGCGCGAAAGGGGGGGGGAGGTCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGg > 2:359030/1‑139 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGGAGGGGGGGGGGGGATCTCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGg > 2:846613/1‑139 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT < 2:660992/134‑1 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGGGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT > 1:660992/1‑134 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAAACCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGGGCGCGGAGGGGGGGGGGGGATCTCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGgctgtct > 2:239015/1‑133 GGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAAACCCCGACGGGGTGTATGTTTTCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGGGGGGGGGGATCTCCCATAAGTGCTAACTTTAGGGGTGTGGg > 2:912042/1‑139 TCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG < 2:535531/140‑1 TCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG < 2:588076/140‑1 CCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC < 1:742296/140‑1 CGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCCGCGTGAAGGGGAGGGCGGAGGGGGGGGGGGGATCTCCCCTAAGCGCGAACTTTAGGGTTGGGGGATTACGCCCGAGATGt > 2:59244/1‑139 TGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAAACCGCGACGGGCGGTTTGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGGAGGGGGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTGACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 2:1029415/1‑140 TCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG < 1:939329/140‑1 GCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG > 1:46317/1‑140 ACAGGC‑GGTTAAAAAACCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGGGCGCGAAGGGTGGGGGGGGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA > 1:491895/1‑140 AGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:802044/140‑1 AGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:413340/140‑1 C‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTC < 1:450992/140‑1 GGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG > 2:496754/1‑131 GGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 1:496754/131‑1 ATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:652611/140‑1 ATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC > 2:652611/1‑140 ATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:1148163/140‑1 ATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:46317/140‑1 ATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:243432/140‑1 TGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC < 1:713612/140‑1 TGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATA > 2:14279/1‑140 TGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC > 1:674941/1‑131 TGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:674941/131‑1 CGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTA > 1:22185/1‑140 GTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGG < 2:212706/137‑1 GTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGG > 1:212706/1‑137 CGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 1:1248874/140‑1 GGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATA < 2:885236/140‑1 TGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTT > 2:575897/1‑140 TGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTT < 1:61587/140‑1 GATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGT > 2:521449/1‑140 agCTCCCATAAGTGCTAACTTAAGGGTTGCGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTA > 2:624267/3‑140 ATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTA > 1:534876/1‑140 TCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGGCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAA > 2:1171418/1‑140 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 2:547095/140‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 1:537872/140‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 1:553213/140‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 1:1213883/140‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG > 1:777747/1‑140 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 1:335178/140‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 2:163472/140‑1 GCGCGCAGGTATACCGCTGGCAGATCCCCATGGACGCGGGGGTGGTTCTGCGCGACAGGC‑GGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2375955‑2375828 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG > NC_000913/2514273‑2514415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |