| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,207,942 | (G)7→8 | coding (442/630 nt) | ycfK → | e14 prophage; protein StfP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,207,935 | 1 | . | G | 98.4% | 223.4 / ‑3.3 | 64 | coding (435/630 nt) | ycfK | e14 prophage; protein StfP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (34/29); total (35/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 | |||||||||||
AGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGT > NC_000913/1207803‑1208065 | AGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑‑g‑gggggg < 1:160139‑M1/140‑1 (MQ=255)AGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑‑g‑gggggg > 2:669898‑M1/1‑140 (MQ=255) aGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑‑g‑gggggggat < 1:194811/140‑4 (MQ=255) cTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATa > 1:896068/1‑140 (MQ=255) aaTGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAg < 2:490978/140‑1 (MQ=255) tGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGtt < 2:381621/140‑1 (MQ=255) caACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTAtt > 1:59644/1‑140 (MQ=255) caACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTAtt > 2:597945/1‑140 (MQ=255) gCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCgg < 1:800771/140‑1 (MQ=255) cTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGt < 1:353045/140‑1 (MQ=255) tACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGtt < 2:851637/140‑1 (MQ=255) cGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTtaat < 2:852707/139‑1 (MQ=255) cGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTtaat > 1:852707/1‑139 (MQ=255) cACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGt < 2:832424/132‑1 (MQ=255) cACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGt > 1:832424/1‑132 (MQ=255) cACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTaataat > 2:37855/1‑140 (MQ=255) cACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTaataat > 2:266842/1‑140 (MQ=255) cACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTaataat > 2:137679/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 2:725170/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 1:566574/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 1:987755/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 1:114072/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 1:744130/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAAACATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 2:652949/1‑140 (MQ=255) ccGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGc < 2:987755/140‑1 (MQ=255) ttCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCtgtg > 1:479393/1‑140 (MQ=255) ataCCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttg > 1:558537/1‑140 (MQ=255) taCCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttg > 2:607934/1‑140 (MQ=255) ccGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGttgttg < 2:860911/140‑1 (MQ=255) ggTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCa < 2:160139/140‑1 (MQ=255) gTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaa > 1:755146/1‑140 (MQ=255) gTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaa > 2:262064/1‑140 (MQ=255) ttATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaaa < 2:114072/140‑1 (MQ=255) tATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAt > 1:194146/1‑140 (MQ=255) ttGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGa > 1:915909/1‑140 (MQ=255) gtggtATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACaa < 2:492468/140‑1 (MQ=255) tggtATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑‑GTGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAAt > 1:380567/1‑140 (MQ=255) aTTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCa > 1:794977/1‑140 (MQ=255) aTTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCa > 2:483374/1‑140 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:483374/140‑1 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 2:915909/140‑1 (MQ=255) aaTCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCAcc < 2:479393/140‑1 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa > 1:928678/1‑140 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa > 2:915503/1‑140 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa > 1:37997/1‑140 (MQ=255) cAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTAt < 1:915503/140‑1 (MQ=255) aGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATc > 1:879716/1‑140 (MQ=255) aaTCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcg > 1:338263/1‑129 (MQ=255) aaTCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcg < 2:338263/129‑1 (MQ=255) aaTCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAAt > 1:712733/1‑140 (MQ=255) ttCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGt > 2:868645/1‑140 (MQ=255) ttCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGt < 1:262064/140‑1 (MQ=255) gTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCa > 1:772206/1‑140 (MQ=255) tGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCaa > 2:701365/1‑140 (MQ=255) tGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCaa < 2:794977/140‑1 (MQ=255) tGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCaa < 2:558537/140‑1 (MQ=255) ggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACg < 1:725170/140‑1 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 1:868645/140‑1 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 2:744130/140‑1 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 1:701365/140‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 1:607934/140‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg < 2:712733/140‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg > 1:482505/1‑140 (MQ=255) ggAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggggg < 2:566574/140‑1 (MQ=255) aTCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCg > 1:688513/1‑140 (MQ=255) tCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGt < 2:322107/140‑1 (MQ=255) tCTGCCTCTG‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGt < 1:652949/140‑1 (MQ=255) | AGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATTGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑‑G‑GGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGT > NC_000913/1207803‑1208065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |