| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,594,132 | (C)8→9 | pseudogene (3955/5422 nt) | yneO ← | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,594,124 | 1 | . | C | 97.0% | 228.8 / ‑0.4 | 67 | pseudogene (3963/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (30/35); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
ATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCC > NC_000913/1593992‑1594256 | atcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑ccccc‑cc > 1:240437/1‑140 (MQ=255) tcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑ccccc‑ccc < 1:825922/140‑1 (MQ=255) ggCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑ccccc‑ccccag > 1:132485/1‑137 (MQ=255) aTTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCAt > 1:119266/1‑140 (MQ=255) aTTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCAt < 1:145956/140‑1 (MQ=255) aTTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCAt < 1:934576/140‑1 (MQ=255) ggTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCat > 2:952668/1‑140 (MQ=255) taGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCa > 1:44114/1‑140 (MQ=255) aGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCAc > 1:889369/1‑140 (MQ=255) ttGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCt > 1:27689/1‑140 (MQ=255) ttGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCt > 1:474088/1‑140 (MQ=255) tGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGTCATAACGTTCATATCACCTg < 1:672154/140‑1 (MQ=255) tAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAgtgg < 2:119266/140‑1 (MQ=255) aaCGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAgtggt > 2:495707/1‑140 (MQ=255) tACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCCGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 1:815472/140‑1 (MQ=255) tCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACa > 2:361846/1‑140 (MQ=255) tCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACa < 1:541111/140‑1 (MQ=255) ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACa < 1:727266/135‑1 (MQ=255) ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACa > 2:727266/1‑135 (MQ=255) ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATcaca > 1:937954/1‑140 (MQ=255) ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATcaca > 2:141924/1‑140 (MQ=255) tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:269121/140‑1 (MQ=255) ttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:495707/140‑1 (MQ=255) ttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 2:889369/140‑1 (MQ=255) ttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 2:943070/140‑1 (MQ=255) tCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGc < 2:137746/140‑1 (MQ=255) ccccccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCt > 2:507316/1‑140 (MQ=255) ccccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGt > 1:638914/1‑140 (MQ=255) ccccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGAGACATTTCCCGACATCACACCGCTGt > 1:498562/1‑140 (MQ=255) ccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGtt < 1:460382/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTAt < 1:141924/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTAt < 2:937954/140‑1 (MQ=255) tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTg > 1:14618/1‑134 (MQ=255) tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTg < 2:14618/134‑1 (MQ=255) tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATgg > 1:651405/1‑140 (MQ=255) ttCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTa < 2:638914/140‑1 (MQ=255) tCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTaa < 1:507316/140‑1 (MQ=255) ttGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAAtgtg < 1:952668/140‑1 (MQ=255) aaCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGtt > 2:574967/1‑122 (MQ=255) aaCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGtt < 1:574967/122‑1 (MQ=255) aaCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTg > 2:707637/1‑140 (MQ=255) aaCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑CCCCCGCCCAGGCATAACGTTCAGATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTg > 2:892982/1‑140 (MQ=255) ccGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGAc < 2:27689/140‑1 (MQ=255) ccGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGAc < 1:852883/140‑1 (MQ=255) ccGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGAc < 1:707637/140‑1 (MQ=255) tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACtt > 1:407378/1‑139 (MQ=255) tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACtt < 2:407378/139‑1 (MQ=255) tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTg > 1:832159/1‑140 (MQ=255) tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTg > 1:465025/1‑140 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTg > 1:451068/1‑138 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTg < 2:451068/138‑1 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:651405/140‑1 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc > 2:1001398/1‑140 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc > 2:874639/1‑140 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:663421/140‑1 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc > 2:663579/1‑140 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 1:783658/140‑1 (MQ=255) ccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTGCATATCTCCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:474088/140‑1 (MQ=255) cccccATTCTCCAGGGTGCCCCCGATAGTGGGTTTAGCGACCCCCCGGGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:943349/137‑1 (MQ=255) aGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCa < 2:132485/140‑1 (MQ=255) gccgccGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTc > 1:56062/1‑140 (MQ=255) ccgccgATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCat > 2:16662/1‑124 (MQ=255) ccgccgATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCat < 1:16662/124‑1 (MQ=255) ccgccgATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCg > 1:365869/1‑140 (MQ=255) cgccgATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATAtt < 2:748369/126‑1 (MQ=255) cgccgATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATAtt > 1:748369/1‑126 (MQ=255) aGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGaa < 1:874639/140‑1 (MQ=255) aGCGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAACGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTc > 2:605050/1‑140 (MQ=255) gCGACCCGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACCCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTATTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcc < 2:240437/140‑1 (MQ=255) cGACACGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTccc < 2:44114/140‑1 (MQ=255) acacGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTccccc < 2:308216/140‑1 (MQ=255) acGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGCGGTGCCATTTCCCGACTTCACACCGCTGTTATGGATATTATTGGGTTGACTTGCCATATTAATTGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTccccccc > 2:821868/1‑140 (MQ=255) cGCAGTGC‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccccc < 2:56062/140‑1 (MQ=255) | ATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑CCCCC‑CCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCC > NC_000913/1593992‑1594256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |