| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,934,952 | C→T | A392V (GCA→GTA) | rbsA → | ribose ABC transporter ATP binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,934,952 | 0 | C | T | 98.5% | 226.2 / NA | 67 | A392V (GCA→GTA) | rbsA | ribose ABC transporter ATP binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (35/31); minor base A (1/0); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAAAAGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGCAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAGAGATCTATCA > NC_000913/3934817‑3935084 | tAAAAGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAAtt < 1:497079/140‑1 (MQ=255)tAAAAGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAAtt > 2:96734/1‑140 (MQ=255) aaaaGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTg > 1:305512/1‑140 (MQ=255) aaaGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTgg < 2:831354/140‑1 (MQ=255) aaGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGt < 1:870255/140‑1 (MQ=255) gagaACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTaa > 1:37946/1‑133 (MQ=255) agaACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTg > 1:576324/1‑140 (MQ=255) aaCATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCt > 1:801906/1‑140 (MQ=255) gTCTCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGCAATTGGTCTGCTTTCCg > 2:488315/1‑140 (MQ=255) gTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCg > 2:12456/1‑140 (MQ=255) gcgctgcgctACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCa > 1:831472/1‑140 (MQ=255) cTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACCGGAAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTgg > 1:67899/1‑140 (MQ=255) ttCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGc > 1:562556/1‑140 (MQ=255) cAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGa < 2:831472/140‑1 (MQ=255) aGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGAt < 2:187784/140‑1 (MQ=255) gcTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGAt < 1:211884/134‑1 (MQ=255) gcTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGAt > 2:211884/1‑134 (MQ=255) gcTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcg > 1:976336/1‑140 (MQ=255) gcTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcg < 2:576324/140‑1 (MQ=255) gcTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcg > 2:596002/1‑140 (MQ=255) gcTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcg < 1:631641/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcgc > 2:73786/1‑140 (MQ=255) tGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcgcg < 2:479599/140‑1 (MQ=255) tGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcgcg < 1:96734/140‑1 (MQ=255) gcggcAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGt > 2:562273/1‑140 (MQ=255) gcAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCtg < 1:12456/140‑1 (MQ=255) gAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGacac > 1:736927/1‑140 (MQ=255) gAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGacac < 2:979126/140‑1 (MQ=255) gAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGacac < 2:67899/140‑1 (MQ=255) gCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcgcg > 2:772344/1‑125 (MQ=255) gCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCcgcg < 1:772344/125‑1 (MQ=255) gCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGcc < 1:596002/140‑1 (MQ=255) tGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCa < 1:71845/140‑1 (MQ=255) tGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCa < 1:509845/140‑1 (MQ=255) gCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCaa > 2:113046/1‑140 (MQ=255) ccGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCaaa > 1:165545/1‑140 (MQ=255) tGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAgtgt > 2:670975/1‑140 (MQ=255) cagcagGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGAt < 2:976336/140‑1 (MQ=255) cagcagGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGAt < 2:143427/140‑1 (MQ=255) ggCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtg < 2:875503/140‑1 (MQ=255) ggCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtg > 2:225615/1‑140 (MQ=255) ggCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtg < 2:305512/140‑1 (MQ=255) ggCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtg > 1:487456/1‑140 (MQ=255) gCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtga < 1:113046/140‑1 (MQ=255) cTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtgat < 1:276685/140‑1 (MQ=255) tgtgAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAgtgt < 1:446310/128‑1 (MQ=255) tgtgAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAgtgt > 2:446310/1‑128 (MQ=255) tgtgAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTtgatg > 1:123297/1‑140 (MQ=255) gtgaTTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCt > 1:932968/1‑140 (MQ=255) gtgaTTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCt > 1:844621/1‑140 (MQ=255) ttCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCg < 2:801906/140‑1 (MQ=255) cATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCg < 2:981603/138‑1 (MQ=255) cATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCg > 1:981603/1‑138 (MQ=255) cATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTg > 1:701608/1‑140 (MQ=255) tCTGTTTAATGTGGAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAg > 1:272860/1‑140 (MQ=255) ttAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTc > 1:173114/1‑140 (MQ=255) tgAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGcgcg < 2:844621/140‑1 (MQ=255) gAAAACTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGa > 2:929577/1‑140 (MQ=255) aaaCTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGaaa > 1:860059/1‑140 (MQ=255) aaaCTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGaaa > 1:524512/1‑140 (MQ=255) aaaCTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGaaa > 1:228906/1‑140 (MQ=255) aaaCTCCGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACACCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGaaa > 1:267137/1‑140 (MQ=255) ccGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAaga < 2:860059/140‑1 (MQ=255) cGTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAagag > 1:794192/1‑140 (MQ=255) gTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAgaga > 2:630009/1‑140 (MQ=255) gTCGATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAgaga < 2:524512/140‑1 (MQ=255) gATGGAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAGAGATCt < 1:27001/140‑1 (MQ=255) gAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAGAGATCTATCa < 1:488315/140‑1 (MQ=255) gAACAGGTAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAGAGATCTATCa < 2:165545/140‑1 (MQ=255) | TAAAAGAGAACATGTCGCTGACAGCGCTGCGCTACTTCAGCCGCGCTGGCGGCAGTTTGAAGCATGCCGATGAACAGCAGGCTGTGAGTGATTTCATTCGTCTGTTTAATGTGAAAACTCCGTCGATGGAACAGGCAATTGGTCTGCTTTCCGGTGGCAATCAGCAAAAAGTGGCGATTGCCCGCGGTCTGATGACACGCCCCAAAGTGTTGATCCTTGATGAACCTACCCGTGGCGTAGATGTCGGCGCGAAAAAAGAGATCTATCA > NC_000913/3934817‑3935084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |