| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,774,533 | G→A | G249S (GGT→AGT) | ydiB → | shikimate dehydrogenase/quinate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,774,533 | 0 | G | A | 98.7% | 277.9 / ‑6.8 | 79 | G249S (GGT→AGT) | ydiB | shikimate dehydrogenase/quinate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (43/35); minor base C (0/1); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGGGTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGAC > NC_000913/1774404‑1774664 | gTGGGTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAAc > 1:370801/1‑140 (MQ=255) tGGGTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACg > 2:770355/1‑140 (MQ=255) gggTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGa < 2:255101/140‑1 (MQ=255) gggTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGa > 2:282271/1‑140 (MQ=255) gggTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGa < 1:37271/140‑1 (MQ=255) ccTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACg > 1:166103/1‑140 (MQ=255) cTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACgg > 2:373968/1‑140 (MQ=255) agaATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtg < 2:83930/140‑1 (MQ=255) tgaatCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgt > 2:407882/1‑140 (MQ=255) aatCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgttg < 1:373968/140‑1 (MQ=255) atCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtgttgttgt > 2:943205/1‑140 (MQ=255) ttGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCa < 2:370801/140‑1 (MQ=255) ttGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCa < 1:407882/140‑1 (MQ=255) tGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCaa > 2:197263/1‑140 (MQ=255) aaTGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtg < 1:304021/123‑1 (MQ=255) aaTGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAtg > 2:304021/1‑123 (MQ=255) gATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGa < 1:681521/140‑1 (MQ=255) atatCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGaa < 1:770355/140‑1 (MQ=255) atCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCACATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGa < 1:240366/137‑1 (MQ=255) atCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCACATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGa > 2:240366/1‑137 (MQ=255) tCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAgggg < 2:992742/132‑1 (MQ=255) tCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAgggg > 1:992742/1‑132 (MQ=255) tCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGaa < 2:200083/137‑1 (MQ=255) tCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGaa > 1:200083/1‑137 (MQ=255) tCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAg > 2:430804/1‑140 (MQ=255) cAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGt < 1:594098/140‑1 (MQ=255) cAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGt > 2:35783/1‑140 (MQ=255) aGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGtt < 2:263110/140‑1 (MQ=255) tCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGAATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTca > 2:783803/1‑140 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAtt > 2:85460/1‑140 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAtt > 2:905574/1‑140 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAtt > 1:736286/1‑140 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACAtt > 2:159799/1‑140 (MQ=255) aCATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTAt > 1:581438/1‑140 (MQ=255) tCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGa < 2:581438/140‑1 (MQ=255) ccGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGAc > 1:515055/1‑140 (MQ=255) gggACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTg > 2:846115/1‑140 (MQ=255) ggACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTgg > 1:310053/1‑140 (MQ=255) gACTTCTGGTCACTGAGTGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGc > 1:851271/1‑140 (MQ=255) gACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGa > 1:334418/1‑135 (MQ=255) gACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGa < 2:334418/135‑1 (MQ=255) cTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGa > 2:386091/1‑140 (MQ=255) cTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGa > 1:687348/1‑140 (MQ=255) cACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTcc > 1:281207/1‑140 (MQ=255) cTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCct > 1:516964/1‑140 (MQ=255) aaTGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTg > 2:911707/1‑140 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 1:159799/140‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 2:230334/140‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 2:310053/140‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 1:510537/140‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 1:905574/140‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 2:515055/140‑1 (MQ=255) tGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 1:846115/140‑1 (MQ=255) gCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGaa > 1:881879/1‑140 (MQ=255) gCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTAAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGaa > 2:911699/1‑140 (MQ=255) cGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAat < 2:687348/140‑1 (MQ=255) gtgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAata > 2:692465/1‑140 (MQ=255) gtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATg > 1:835314/1‑140 (MQ=255) cccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAAc < 1:692465/140‑1 (MQ=255) cccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAAc < 1:35783/140‑1 (MQ=255) cGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAg < 2:960119/140‑1 (MQ=255) cATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa < 2:832791/125‑1 (MQ=255) cATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGa > 1:832791/1‑125 (MQ=255) cATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGt > 1:474042/1‑140 (MQ=255) atatGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTc > 2:311811/1‑140 (MQ=255) atatGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTc > 2:739802/1‑140 (MQ=255) atatGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTc > 1:211668/1‑140 (MQ=255) tGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTCGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGTCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg < 2:881879/140‑1 (MQ=255) tGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg < 1:783803/140‑1 (MQ=255) gACGAAGTTATTGCAGCAGGCACAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTGGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATgg > 2:878708/1‑140 (MQ=255) cGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTaaa > 2:812644/1‑128 (MQ=255) cGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTaaa < 1:812644/128‑1 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGt < 1:282271/140‑1 (MQ=255) agcagGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGa < 1:386091/140‑1 (MQ=255) agGCGCAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAg > 2:178521/1‑140 (MQ=255) gcgcAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGc < 1:739802/140‑1 (MQ=255) gcgcAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGc < 1:943205/140‑1 (MQ=255) gcgcAACAAGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGc > 2:621533/1‑140 (MQ=255) aacaaGCTAGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGAc < 2:851271/140‑1 (MQ=255) | GTGGGTATGAAACCCCTTGAGAATGAATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGAC > NC_000913/1774404‑1774664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |