Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,045,892 | A→G | C237C (TGT→TGC) | yihG ← | putative acyltransferase YihG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,045,892 | 0 | A | G | 97.8% | 150.1 / NA | 45 | C237C (TGT→TGC) | yihG | putative acyltransferase YihG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (24/20); total (25/20) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAACACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCTGATGTTTTTCTTGCG > NC_000913/4045756‑4046019 | ggCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACCCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAgcac > 1:677360/1‑140 (MQ=255) cgcTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAg > 2:394671/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCg < 1:778943/140‑1 (MQ=255) tAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTa < 1:221368/140‑1 (MQ=255) ttGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAg > 2:317404/1‑140 (MQ=255) gTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCa < 2:557111/140‑1 (MQ=255) cATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACGGCGTAACATTAAGCAGt < 2:380587/140‑1 (MQ=255) aTGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATc < 1:745186/140‑1 (MQ=255) aGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAAt < 1:394671/140‑1 (MQ=255) cGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGt < 1:844686/140‑1 (MQ=255) aTGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTAc > 2:203143/1‑140 (MQ=255) aTGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTAc < 1:317404/140‑1 (MQ=255) tGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTAcc < 1:673211/140‑1 (MQ=255) gTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTAccc < 1:695456/140‑1 (MQ=255) aCTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGt < 1:637079/140‑1 (MQ=255) cTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTa < 2:614896/140‑1 (MQ=255) cGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACAttt > 1:160073/1‑140 (MQ=255) cGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACAttt > 1:413832/1‑140 (MQ=255) cGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACAttt > 1:78498/1‑140 (MQ=255) cGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACAttt > 2:728491/1‑140 (MQ=255) ccACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGcc < 2:367645/128‑1 (MQ=255) ccACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGcc > 1:367645/1‑128 (MQ=255) acaTGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAAtgcctgc > 2:911389/1‑140 (MQ=255) tGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTgccgc > 1:148892/1‑140 (MQ=255) aCAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTtgg > 1:664593/1‑140 (MQ=255) tCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGc > 1:128065/1‑140 (MQ=255) tCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGc > 1:520413/1‑140 (MQ=255) tCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGc > 1:923245/1‑140 (MQ=255) ccGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGca > 2:606999/1‑140 (MQ=255) gTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGcaacaa > 1:825880/1‑140 (MQ=255) cAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGt > 2:633074/1‑140 (MQ=255) aGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGtt > 1:714129/1‑140 (MQ=255) tttACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGtttt > 2:236233/1‑140 (MQ=255) gCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAag < 1:235567/140‑1 (MQ=255) cATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAagtggagt < 1:280279/140‑1 (MQ=255) tatCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAagtggagtgg > 2:526966/1‑140 (MQ=255) cGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGtt < 2:407317/140‑1 (MQ=255) cGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAACACAGCGTAACATTAAGCAGTTGATCGCCTTGTTTACCCAGAACATTTAGCGCCAGCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGGGGCAACAAATTTTGAAAAGTGGAGTGGGtt > 2:774546/1‑140 (MQ=255) aagaaCGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTg < 2:413832/140‑1 (MQ=255) agaaCGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGc > 2:99498/1‑140 (MQ=255) gaaCGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCt < 1:911389/140‑1 (MQ=255) gaaCGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCt < 1:728491/140‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTTATTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCTGATg > 1:835626/1‑140 (MQ=255) aTTGTCCGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCTGATGTTTTTCTTGCg > 1:52603/1‑140 (MQ=255) ccGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCTGATGTTTTTCTTg < 2:588964/133‑1 (MQ=255) ccGGATAGCACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCTGATGTTTTTCTTg > 1:588964/1‑133 (MQ=255) | GGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCCGCGTCAGTTTACCGCTTAACATATCGAAGAACGGCTGACGGTTATTGTCCGGATAACACAGCGTAACATTAAGCAGTTTATCGAATTGTTTACCCAGTACATTTAGCGCCATCGCAATGCCTGCCGCCTTTGGTGGCAACAAGTTTTGAAAAGTGGAGTGGGTTTGCTGATGTTTTTCTTGCG > NC_000913/4045756‑4046019 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |