| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 268,471 | (C)5→6 | coding (490/864 nt) | ykfA ← | CP4‑6 prophage; putative GTP‑binding protein YkfA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 268,466 | 1 | . | C | 98.9% | 305.9 / ‑3.8 | 87 | coding (495/864 nt) | ykfA | CP4‑6 prophage; putative GTP‑binding protein YkfA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (43/43); total (43/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑CC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCA > NC_000913/268327‑268599 | tAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGt > 1:266310/1‑140 (MQ=255)tAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGt < 1:1081576/140‑1 (MQ=255)tAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGt < 1:607851/140‑1 (MQ=255) ccGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTATACGGACCCACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTCATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑cccca < 2:1090074/140‑3 (MQ=255) ccGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑cccca < 1:11074/140‑3 (MQ=255) ccGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑cccca > 1:832331/1‑138 (MQ=255) gCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑ccccacc > 1:1015127/1‑136 (MQ=255) gCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑ccccacc > 2:557256/1‑136 (MQ=255) gCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑ccccacc > 1:78226/1‑136 (MQ=255) cTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑cc‑ccccaccg > 2:734796/1‑135 (MQ=255) gCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑CCGCCCACCGCTgg < 1:218346/140‑1 (MQ=255) aaGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGcc > 2:20435/1‑140 (MQ=255) cccATTGTAGACGGACCGACACAGCACGCACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTgg < 2:206625/124‑1 (MQ=255) cccATTGTAGACGGACCGACACAGCACGCACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTgg > 1:206625/1‑124 (MQ=255) ccATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATcc > 1:155523/1‑140 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCg < 1:371233/140‑1 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCg > 1:180146/1‑140 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCg > 1:247745/1‑140 (MQ=255) aGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGc < 1:22494/140‑1 (MQ=255) gACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGAc > 1:899930/1‑135 (MQ=255) gACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGAc < 2:899930/135‑1 (MQ=255) ggACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGa < 1:1141083/131‑1 (MQ=255) ggACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGa > 2:1141083/1‑131 (MQ=255) ggACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGAt > 2:177816/1‑140 (MQ=255) gACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATa < 1:348229/140‑1 (MQ=255) gACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATa > 2:15795/1‑140 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaa > 1:274582/1‑140 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaa > 2:482168/1‑140 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaa > 1:166774/1‑140 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaa > 1:563697/1‑140 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATa > 1:1106413/1‑139 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATa < 2:1106413/139‑1 (MQ=255) ccGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaac > 2:570196/1‑140 (MQ=255) ccGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaac > 1:1168812/1‑140 (MQ=255) ccGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaac > 2:455040/1‑140 (MQ=255) gACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaacaa > 1:111331/1‑140 (MQ=255) acacAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATaacaaa < 2:301278/140‑1 (MQ=255) caGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAg < 1:947935/140‑1 (MQ=255) caGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAg < 1:20435/140‑1 (MQ=255) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAg < 2:295908/137‑1 (MQ=255) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAg > 1:295908/1‑137 (MQ=255) acacacCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCTCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCAcc < 2:273790/140‑1 (MQ=255) acacacCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCAcc < 2:78226/140‑1 (MQ=255) cacCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTa < 2:247745/140‑1 (MQ=255) cacCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTa < 1:1093688/140‑1 (MQ=255) cacCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTa < 1:539795/140‑1 (MQ=255) cacCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTa < 1:482168/140‑1 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTAt < 1:919521/140‑1 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTAt > 2:436369/1‑140 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTAt < 2:111331/140‑1 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTAt < 2:1015127/140‑1 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aTGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCgg > 2:695746/1‑140 (MQ=255) aTGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCgg > 1:521456/1‑140 (MQ=255) ggACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGta < 2:832331/140‑1 (MQ=255) cGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTa < 2:731488/129‑1 (MQ=255) cGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTa > 1:731488/1‑129 (MQ=255) ggCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACct > 2:72765/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) aTGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCtga < 2:563697/140‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCtgat < 1:570196/140‑1 (MQ=255) tGCAGAAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCtgat > 1:1010170/1‑140 (MQ=255) gcagcaGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCtgatg > 2:426871/1‑140 (MQ=255) agcagGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTgatgat < 2:166774/140‑1 (MQ=255) agcagGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTgatgat < 2:316929/140‑1 (MQ=255) agcagGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTgatgat < 1:426871/140‑1 (MQ=255) aggcagATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATaaa > 1:577892/1‑140 (MQ=255) aggcagATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATaaa > 2:293444/1‑140 (MQ=255) ggcagATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATaaaa < 2:27025/140‑1 (MQ=255) ttGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCAt > 1:635521/1‑140 (MQ=255) cGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCa < 1:293444/140‑1 (MQ=255) gCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCAcc > 2:226917/1‑140 (MQ=255) tatTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAg < 2:266310/140‑1 (MQ=255) ctgcGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCa > 2:484155/1‑140 (MQ=255) ctgcGCCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCa > 1:905831/1‑140 (MQ=255) gcgcCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATc > 1:591229/1‑140 (MQ=255) gcgcCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATc < 2:180146/140‑1 (MQ=255) cgcCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCg > 2:583411/1‑140 (MQ=255) cgcCGTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCg > 2:223860/1‑140 (MQ=255) gTGGACAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCt > 1:390245/1‑140 (MQ=255) cAACTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCCCCAATCCCCTGATGATAAAAATGTTCCCCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATc < 2:14905/140‑1 (MQ=25) aaCTGTCCC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCa < 1:627867/140‑1 (MQ=255) | TAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGT‑CC‑CCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCA > NC_000913/268327‑268599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |