| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,527,597 | +G | intergenic (+445/‑293) | yncH → / → rhsE | DUF5445 domain‑containing protein YncH/RhsE protein in rhs element |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,527,594 | 1 | . | G | 98.6% | 257.7 / ‑3.4 | 72 | intergenic (+442/‑296) | yncH/rhsE | DUF5445 domain‑containing protein YncH/RhsE protein in rhs element |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (34/37); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
GAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCA‑GGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTTTATTACT > NC_000913/1527461‑1527728 | gAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCA‑ggggtg < 1:485548/140‑4 (MQ=255) cATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGt < 2:264911/140‑1 (MQ=255) cATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATCATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGTAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGt < 2:1091944/140‑1 (MQ=255) attattTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTa < 1:737328/140‑1 (MQ=255) attTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATATTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCg > 1:764689/1‑140 (MQ=255) tttCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGta < 2:483262/140‑1 (MQ=255) ttCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat < 1:1165721/140‑1 (MQ=255) ttCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat < 2:698624/140‑1 (MQ=255) ttCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGACAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat < 2:86110/140‑1 (MQ=255) aTGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTc > 1:372240/1‑140 (MQ=255) tttGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTtata > 1:281871/1‑140 (MQ=255) tGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACa < 2:281871/140‑1 (MQ=255) cTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACaaa < 2:369997/140‑1 (MQ=255) attatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat > 2:958702/1‑123 (MQ=255) attatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat < 1:958702/123‑1 (MQ=255) attatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACca > 2:634649/1‑140 (MQ=255) attatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACca > 1:976045/1‑140 (MQ=255) ttatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACa < 1:427845/134‑1 (MQ=255) ttatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACa > 2:427845/1‑134 (MQ=255) ttatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATAAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat > 2:1032565/1‑122 (MQ=255) ttatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATAAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGtat < 1:1032565/122‑1 (MQ=255) tatTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACcatcat < 2:286374/140‑1 (MQ=255) atTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCAtcatt < 1:1197031/140‑1 (MQ=255) ttCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCAtcattc > 1:1037955/1‑140 (MQ=255) atcaGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATcattcatt > 1:494533/1‑140 (MQ=255) aaTTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTc < 1:1008285/134‑1 (MQ=255) aaTTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTc > 2:1008285/1‑134 (MQ=255) aaTTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGAt < 1:264480/140‑1 (MQ=255) tttAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCa < 1:440764/133‑1 (MQ=255) tttAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCa > 2:440764/1‑133 (MQ=255) aataaATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTa < 2:494533/140‑1 (MQ=255) aTTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGaa < 2:1037955/140‑1 (MQ=255) aTTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGaa > 2:883072/1‑140 (MQ=255) ttCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAat > 1:1152970/1‑140 (MQ=255) tCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAAt > 1:323005/1‑125 (MQ=255) tCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAAt < 2:323005/125‑1 (MQ=255) tCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCA‑GGGATGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAatt > 2:182423/1‑140 (MQ=255) cTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAattat < 1:677312/140‑1 (MQ=255) tAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAattatt > 2:318153/1‑140 (MQ=255) atatCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGa < 1:923941/125‑1 (MQ=255) atatCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGa < 1:220013/125‑1 (MQ=255) atatCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGa > 2:220013/1‑125 (MQ=255) atatCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGa > 2:923941/1‑125 (MQ=255) tatCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTtgtg < 1:318153/140‑1 (MQ=255) tatCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTtgtg < 2:1152970/140‑1 (MQ=255) tCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGaa > 2:529578/1‑140 (MQ=255) tATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATaaaa > 2:452144/1‑140 (MQ=255) gtgtTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGAc > 2:533144/1‑134 (MQ=255) gtgtTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGAc < 1:533144/134‑1 (MQ=255) gtgtTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATg > 2:23400/1‑140 (MQ=255) gtgtTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATg > 1:610413/1‑140 (MQ=255) gtgtTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATg > 2:765329/1‑140 (MQ=255) tAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTAt < 2:36159/134‑1 (MQ=255) tAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTAt > 1:36159/1‑134 (MQ=255) aaCGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATAtt > 2:1206463/1‑140 (MQ=255) aaCGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATAtt > 1:1202551/1‑140 (MQ=255) acgacgTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTg > 1:509772/1‑140 (MQ=255) acgacgTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTg > 2:335945/1‑140 (MQ=255) cgacgTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTgg < 1:335945/140‑1 (MQ=255) acgTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGtt < 2:610413/140‑1 (MQ=255) ttAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGa < 1:1206463/140‑1 (MQ=255) ttAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGa > 2:1192057/1‑140 (MQ=255) aaTGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACttt < 1:276603/134‑1 (MQ=255) aaTGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACttt > 2:276603/1‑134 (MQ=255) aTGTGCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATc < 1:817923/140‑1 (MQ=255) tgtgCAGATCATGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCa > 1:677891/1‑140 (MQ=255) tGTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTttatt < 1:908552/140‑1 (MQ=255) gTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTttatta > 1:66591/1‑140 (MQ=255) gTTATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATCTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTttatta > 1:955057/1‑140 (MQ=255) ttATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTTTATTAc < 2:66591/140‑1 (MQ=255) tATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCTATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTTTATTACt < 2:764689/140‑1 (MQ=255) tATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTTTATTACt < 1:765329/140‑1 (MQ=255) tATCAGGGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTTTATTACt < 2:509772/140‑1 (MQ=255) | GAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCA‑GGG‑TGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTGGTTTGACTTTGCATATCAGGTTTTTTATTACT > NC_000913/1527461‑1527728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |