| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,449,264 | A→T | I207N (ATC→AAC) | rpsC ← | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,449,264 | 0 | A | T | 97.0% | 225.6 / ‑2.2 | 67 | I207N (ATC→AAC) | rpsC | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base T (30/35); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
TTTGTGCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGAT > NC_000913/3449128‑3449400 | tttGTGCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTtct < 2:868023/140‑1 (MQ=255)tttGTGCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTtct < 1:51042/140‑1 (MQ=255) tgtgCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAGCAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCg > 1:863089/1‑140 (MQ=255) tgtgCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCg < 1:1092667/140‑1 (MQ=255) tgtgCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCg > 1:1185136/1‑140 (MQ=255) ttttACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTg < 1:1080071/140‑1 (MQ=255) ttttACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTg > 1:400731/1‑140 (MQ=255) ttttACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTg > 1:86696/1‑140 (MQ=255) tACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAg < 1:787548/140‑1 (MQ=255) aaTTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCca < 1:285657/140‑1 (MQ=255) cGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAAc < 2:516004/140‑1 (MQ=255) cGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAAc < 1:791747/140‑1 (MQ=255) tGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGa > 2:68761/1‑140 (MQ=255) tGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGa > 1:945500/1‑140 (MQ=255) tGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGa < 1:981131/140‑1 (MQ=255) ggTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTTCGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGAt < 2:863089/140‑1 (MQ=255) gTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGAtt < 1:1224442/140‑1 (MQ=255) gTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGAtt < 2:63902/140‑1 (MQ=255) tGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTac < 2:223653/140‑1 (MQ=255) tGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTac < 1:375404/140‑1 (MQ=255) aaCATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACAcc > 1:522366/1‑140 (MQ=255) cAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAg > 1:1186515/1‑140 (MQ=255) aGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAgt > 1:1015643/1‑140 (MQ=255) aCGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAgtggtg > 2:62351/1‑140 (MQ=255) aCGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAgtggtg > 2:298162/1‑140 (MQ=255) gCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGtgtg < 1:62351/140‑1 (MQ=255) gCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGtgtg < 1:414769/140‑1 (MQ=255) cTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTgc > 1:836718/1‑140 (MQ=255) cTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTgc > 1:156609/1‑140 (MQ=255) cTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGC‑‑TTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGtgtg < 2:241306/137‑1 (MQ=255) cTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGC‑‑TTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGtgtg > 1:241306/1‑137 (MQ=255) ttACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCaga < 2:683142/140‑1 (MQ=255) gCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGGAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGgtgt > 2:729595/1‑140 (MQ=255) gCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGgtgt > 2:624499/1‑140 (MQ=255) gCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGgtgt > 2:78263/1‑140 (MQ=255) tACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAg > 2:896971/1‑140 (MQ=255) aCGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGt < 1:521029/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGt < 2:1186515/140‑1 (MQ=255) ctgctgctTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGgtgt < 1:231692/131‑1 (MQ=255) ctgctgctTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGgtgt > 2:231692/1‑131 (MQ=255) ctgctTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCagag > 1:154736/1‑124 (MQ=255) ctgctTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCagag < 2:154736/124‑1 (MQ=255) tttttAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGc < 2:86696/140‑1 (MQ=255) tttAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCAc < 2:1015643/140‑1 (MQ=255) ttAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACg < 1:297451/140‑1 (MQ=255) ggCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCag > 2:452381/1‑140 (MQ=255) gCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCaga < 1:1073654/140‑1 (MQ=255) gCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCaga > 2:951037/1‑140 (MQ=255) gCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCaga < 1:452381/140‑1 (MQ=255) gCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCaga < 2:522366/140‑1 (MQ=255) gAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAg < 2:1148418/129‑1 (MQ=255) gAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAg > 1:1148418/1‑129 (MQ=255) agcagcCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAgtgt > 1:1075267/1‑140 (MQ=255) agcagcCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAgtgt > 2:995218/1‑140 (MQ=255) agcagcCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAgtgt > 1:486170/1‑140 (MQ=255) agcagcCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAgtgt < 2:1075267/140‑1 (MQ=255) gcagcCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGtgtg < 2:279967/140‑1 (MQ=255) cGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGAc < 2:486170/140‑1 (MQ=255) gttCAACAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTcg > 1:1111913/1‑140 (MQ=255) aCAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTa < 2:1185136/140‑1 (MQ=255) aCAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTa < 2:1111913/140‑1 (MQ=255) aCAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTa < 1:78263/140‑1 (MQ=255) aCAGCAGCCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGCGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTa < 1:341219/140‑1 (MQ=255) gcagcCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCa > 2:906799/1‑140 (MQ=255) gcCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTc > 2:536019/1‑140 (MQ=255) gcCATACCACCCAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTc > 1:484609/1‑140 (MQ=255) ccAGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGCACCATTCGGTACGTGCg > 1:1011160/1‑140 (MQ=255) aGGTTCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGAt > 2:769913/1‑140 (MQ=255) | TTTGTGCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGAT > NC_000913/3449128‑3449400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |