| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,451,262 | C→T | E35K (GAA→AAA) | rplB ← | 50S ribosomal subunit protein L2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,451,262 | 0 | C | T | 98.8% | 275.2 / ‑5.4 | 80 | E35K (GAA→AAA) | rplB | 50S ribosomal subunit protein L2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (37/42); total (37/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
GTTCAACAACTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACG > NC_000913/3451127‑3451400 | gTTCAACAACTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGc < 1:377424/140‑1 (MQ=255)gTTCAACAACTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGc > 1:1079233/1‑140 (MQ=255)gTTCAACAACTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGc > 1:1132983/1‑140 (MQ=255)gTTCAACAACTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGc > 1:339421/1‑140 (MQ=255) acaacTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCTTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACgg > 2:1034299/1‑140 (MQ=255) acTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAAc < 1:368118/135‑1 (MQ=255) acTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAAc > 2:368118/1‑135 (MQ=255) cTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCa < 1:133400/140‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCa < 2:1280906/140‑1 (MQ=255) gggATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAgg > 2:1339710/1‑140 (MQ=255) ggATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGt < 2:887666/140‑1 (MQ=255) gATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGtt < 2:969270/140‑1 (MQ=255) gATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGtt < 2:120688/140‑1 (MQ=255) aCCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGc > 2:442638/1‑140 (MQ=255) cGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGccc < 1:442638/140‑1 (MQ=255) cGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGccc < 2:986253/140‑1 (MQ=255) tttGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTtgt > 2:1402619/1‑140 (MQ=255) ttgttgCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGtt > 2:499935/1‑130 (MQ=255) ttgttgCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGtt < 1:499935/130‑1 (MQ=255) ttgttgCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTtgtg < 1:784001/140‑1 (MQ=255) ttgttgCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTtgtg < 1:484346/140‑1 (MQ=255) gCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCt < 2:1079233/140‑1 (MQ=255) gCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCt > 1:688448/1‑140 (MQ=255) gCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCt < 2:1038110/140‑1 (MQ=255) gCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCt < 1:358870/140‑1 (MQ=255) tttGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAg > 1:236906/1‑140 (MQ=255) ttGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAgg < 2:1132983/140‑1 (MQ=255) tGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAggg > 2:525821/1‑140 (MQ=255) tACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTa > 1:1463518/1‑140 (MQ=255) aCGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTaa > 1:442592/1‑140 (MQ=255) ggTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAGAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACt > 2:145881/1‑140 (MQ=255) tGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGcg < 2:804738/140‑1 (MQ=255) gCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGcga < 2:688448/140‑1 (MQ=255) ggCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGAccc > 2:16967/1‑140 (MQ=255) ggCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGAccc > 2:168074/1‑140 (MQ=255) ccaccGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGgaga > 2:806649/1‑140 (MQ=255) caccGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCg < 1:802239/135‑1 (MQ=255) caccGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCg > 2:802239/1‑135 (MQ=255) atatGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCgg > 1:438604/1‑140 (MQ=255) tatGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGt < 1:1402619/140‑1 (MQ=255) tatGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGt < 2:417788/140‑1 (MQ=255) aCGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGt > 1:665666/1‑136 (MQ=255) aCGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGt < 2:665666/136‑1 (MQ=255) aCGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTAc > 2:11859/1‑140 (MQ=255) aCGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTAc > 1:1037862/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACAtt > 1:1244662/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACAtt > 2:1474017/1‑140 (MQ=255) tgATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTaaca < 1:1272041/140‑1 (MQ=255) aCGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTg > 1:1003110/1‑140 (MQ=255) cGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGc < 1:1474017/140‑1 (MQ=255) cGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGc < 2:236906/140‑1 (MQ=255) cGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGc < 2:1463518/140‑1 (MQ=255) cGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGc < 2:1037862/140‑1 (MQ=255) cGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGc < 2:213868/140‑1 (MQ=255) cGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGc < 2:227946/140‑1 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACTACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 1:450023/140‑1 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGcta < 1:16967/140‑3 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa > 1:7441/1‑140 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 2:311722/140‑1 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 2:1244662/140‑1 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 1:168074/140‑1 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa > 2:1005925/1‑140 (MQ=255) gCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTCGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 1:1034299/140‑1 (MQ=255) ccATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa > 2:337939/1‑139 (MQ=255) ccATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 1:337939/139‑1 (MQ=255) ccATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCAt < 1:525821/140‑1 (MQ=255) aTTGTTGTTACGACCACCGGGTTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa > 2:601949/1‑137 (MQ=255) aTTGTTGTTACGACCACCGGGTTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCa < 1:601949/137‑1 (MQ=255) aTTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTg > 2:906025/1‑140 (MQ=255) aTTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTg > 1:1153030/1‑140 (MQ=255) ttgttACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTAtt < 1:1339710/140‑1 (MQ=255) gttACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTGTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTAc > 2:1322212/1‑140 (MQ=255) ttACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTAct > 2:265553/1‑140 (MQ=255) aCGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTActcc > 2:1079491/1‑140 (MQ=255) cGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTActcct < 2:442592/140‑1 (MQ=255) accGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGAc > 1:499490/1‑140 (MQ=255) accGGATTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGAc < 2:339421/140‑1 (MQ=255) aTTTGCTGTTTTTTTTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGCCCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACt < 1:806649/140‑1 (MQ=255) ttttttTCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGcgccgc > 2:1085432/1‑140 (MQ=255) tCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACg < 2:1003110/140‑1 (MQ=255) | GTTCAACAACTGCCGGGATACCGTCTTTGTTGCGTTTGAAGTCAACAATACGGTAAGCCTGCTTGTGGCCACCACCGATATGACGAGTGGTGATACGGCCATTGTTGTTACGACCACCGGATTTGCTGTTTTTTTCCAGCAACGGAGCAAAAGGTTTGCCCTTGTGCAGCTCAGGGTTAACCACTTTAACTACGTGGCGACGACCCGGAGATGTCGGTTTACATTTAACAACTGCCATTGTATTACTCCTCCGACTTACTCAGCGCCGCCAACG > NC_000913/3451127‑3451400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |