Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,546,393 | C→T | A433V (GCA→GTA) | fimD → | type I fimbriae usher protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,546,393 | 0 | C | T | 99.1% | 368.1 / NA | 110 | A433V (GCA→GTA) | fimD | type I fimbriae usher protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (46/63); total (47/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCGCAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGT > NC_000913/4546257‑4546529 | gcgcAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACt > 1:512924/1‑140 (MQ=255) gcgcAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACt > 2:1131657/1‑140 (MQ=255) gcgcAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACt > 1:1418887/1‑140 (MQ=255) cgcAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTg < 1:685277/140‑1 (MQ=255) cgcAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTg < 2:317182/140‑1 (MQ=255) cagcagGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTggg < 2:559460/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 1:732200/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 2:1192061/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 2:519634/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct > 1:655646/1‑140 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 2:655646/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 1:195655/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 2:1353823/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 1:78207/140‑1 (MQ=255) agGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGct < 1:1131657/140‑1 (MQ=255) aaaaaCCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATTGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCtctgt < 2:1286174/140‑1 (MQ=255) aaaaaCCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCtctgt < 1:1344034/140‑1 (MQ=255) aaaCCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAGTTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTGCTGGGCGCtctgtct < 1:488552/140‑1 (MQ=255) aaCCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCtctgtctg < 2:1471160/140‑1 (MQ=255) tttttCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGatat < 1:376942/140‑1 (MQ=255) tCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGATCGCAACTGGCGGATCGTTAGCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACg < 2:432610/140‑1 (MQ=255) agTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGc < 2:66562/140‑1 (MQ=255) aTTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAAtt > 2:1182985/1‑140 (MQ=255) tACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTcc < 2:698016/140‑1 (MQ=255) cTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAgg < 2:1199837/130‑1 (MQ=255) cTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCcac > 2:429576/1‑140 (MQ=255) tCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCcaca > 1:856103/1‑140 (MQ=255) tCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCcaca < 2:1300301/140‑1 (MQ=255) tCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCcaca > 1:777666/1‑140 (MQ=255) cACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAAtt > 2:1478336/1‑133 (MQ=255) cACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCca < 1:316502/136‑1 (MQ=255) cACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCca > 2:316502/1‑136 (MQ=255) cACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACt > 2:1409169/1‑140 (MQ=255) cACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACt > 1:1176576/1‑140 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGc > 1:780589/1‑126 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGc < 2:780589/126‑1 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTc > 2:1003301/1‑140 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTc > 2:742027/1‑140 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTc > 2:1396271/1‑140 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGAGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTc > 1:965887/1‑140 (MQ=255) ttCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGAt < 1:742027/140‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATg < 1:429576/140‑1 (MQ=255) ggctggctGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACa < 2:333501/140‑1 (MQ=255) ggctggctGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACa < 1:1154202/140‑1 (MQ=255) ggctggctGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACa < 1:1003301/140‑1 (MQ=255) ctggctggACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGt < 2:1332852/140‑1 (MQ=255) ctggACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGc > 1:1042982/1‑140 (MQ=255) tggACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCa > 2:646131/1‑140 (MQ=255) ggtggAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATc > 1:612579/1‑140 (MQ=255) ggtggAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATc > 1:156385/1‑140 (MQ=255) ggtggAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATc < 1:1409169/140‑1 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 1:100652/1‑140 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 2:1048845/1‑140 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 2:1107049/1‑140 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 2:26397/1‑140 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 1:1020894/1‑140 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 1:543396/1‑140 (MQ=255) aaCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGc > 2:354157/1‑140 (MQ=255) aCGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCg > 1:209929/1‑140 (MQ=255) cGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGt > 2:61131/1‑140 (MQ=255) cGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGt > 2:1208841/1‑140 (MQ=255) cGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGt > 2:650756/1‑140 (MQ=255) gCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGtt < 1:205564/140‑1 (MQ=255) gCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGtt < 2:156385/140‑1 (MQ=255) gCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGtt < 1:1331178/140‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGtttt < 2:1042982/140‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGtttt < 1:1396271/140‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGtttt < 1:1113668/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTtct > 1:49200/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTtct < 1:1234338/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTtct < 2:512924/140‑1 (MQ=255) gATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATaa > 1:717965/1‑140 (MQ=255) aTCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCg > 2:251940/1‑140 (MQ=255) tCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGc < 1:1208841/140‑1 (MQ=255) tGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTtct < 2:749371/123‑1 (MQ=255) tGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTtct > 1:749371/1‑123 (MQ=255) tGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCa > 2:843382/1‑140 (MQ=255) tGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCa > 2:1419729/1‑140 (MQ=255) cTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAAt > 1:239825/1‑140 (MQ=255) cTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAAt > 2:1022992/1‑140 (MQ=255) tttAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGa > 1:926812/1‑140 (MQ=255) tttAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGa > 1:1331460/1‑140 (MQ=255) ttAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGaa > 1:267607/1‑140 (MQ=255) tAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAAt < 1:1182985/140‑1 (MQ=255) tAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAAt < 1:320687/140‑1 (MQ=255) ttCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGATAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAgg < 2:1020894/140‑1 (MQ=255) ttCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAgg < 1:735621/140‑1 (MQ=255) ttCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAgg < 2:209929/140‑1 (MQ=255) cGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCa < 2:442245/140‑1 (MQ=255) cGGTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCa < 1:1419729/140‑1 (MQ=255) gTATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACg < 1:61131/140‑1 (MQ=255) tATCGGGAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGa < 1:328769/140‑1 (MQ=255) gAAAAACATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTATATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTc > 2:168062/1‑140 (MQ=255) aaaCATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGt < 2:598907/140‑1 (MQ=255) aCATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTa < 1:1463527/140‑1 (MQ=255) aCATGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTa < 2:717965/140‑1 (MQ=255) tGGGGGTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTg < 1:251940/140‑1 (MQ=255) ggggTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATAtt > 2:1065/1‑129 (MQ=255) ggggTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATAtt < 1:1065/129‑1 (MQ=255) gggTACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt < 1:650756/140‑1 (MQ=255) | GCGCAGCAGGAAAAAACCCGCTTTTTCCAGAGTACATTACTCCACGGCCTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGT > NC_000913/4546257‑4546529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |