| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 88,279 | A→G | E84E (GAA→GAG) | cra → | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 88,279 | 0 | A | G | 99.0% | 336.4 / ‑4.6 | 98 | E84E (GAA→GAG) | cra | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (48/49); total (48/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
GGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCC > NC_000913/88144‑88413 | ggCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGcc > 1:196975/1‑140 (MQ=255)ggCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGcc < 1:383712/140‑1 (MQ=255) tggtgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGgcg > 2:1369860/1‑140 (MQ=255) ggtgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGgcgc < 1:371630/140‑1 (MQ=255) cGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCa < 1:233013/140‑1 (MQ=255) gTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGACACCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCaa < 2:1305423/140‑1 (MQ=255) tGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATTGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAAc < 2:46215/140‑1 (MQ=255) gAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACg < 1:556488/140‑1 (MQ=255) gAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACg < 2:563468/140‑1 (MQ=255) gAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACg < 2:1049766/140‑1 (MQ=255) gCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACggg > 1:1255965/1‑140 (MQ=255) cacaATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACgggg < 2:1390225/140‑1 (MQ=255) cacaATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACgggg < 2:417946/140‑1 (MQ=255) aTTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTAt < 1:1369860/140‑1 (MQ=255) ttACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACgggg < 2:165713/135‑1 (MQ=255) ttACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACgggg > 1:165713/1‑135 (MQ=255) accCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAActg > 1:754492/1‑140 (MQ=255) accCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAActg < 1:1021439/140‑1 (MQ=255) accCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTCGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAActg > 1:881935/1‑140 (MQ=255) cGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAActgctg > 2:422412/1‑140 (MQ=255) aaCGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGAt > 2:1076870/1‑140 (MQ=255) aaCGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGAt > 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cGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCt > 2:743343/1‑140 (MQ=255) tGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGc > 1:652604/1‑140 (MQ=255) cAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCa < 2:1337402/140‑1 (MQ=255) tGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCagaag < 1:1128703/140‑1 (MQ=255) gggCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCagaaga > 2:1039885/1‑140 (MQ=255) gggCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCagaaga > 1:450700/1‑140 (MQ=255) gCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATc > 2:892745/1‑140 (MQ=255) cGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGcc < 1:743343/140‑1 (MQ=255) tGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACa < 1:1121373/140‑1 (MQ=255) ggACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAg < 1:1388108/136‑1 (MQ=255) ggACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAg > 2:1388108/1‑136 (MQ=255) aCGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACg < 1:892745/140‑1 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< 1:1076870/140‑1 (MQ=255) cTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCa < 1:1439774/140‑1 (MQ=255) ttGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCAc > 1:994380/1‑140 (MQ=255) ttGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCAc < 1:224095/140‑1 (MQ=255) ttGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCAc > 1:231193/1‑140 (MQ=255) gtgATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCg > 1:1279468/1‑125 (MQ=255) gtgATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCg < 2:1279468/125‑1 (MQ=255) gtgATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCt > 1:766274/1‑140 (MQ=255) aTCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGa < 1:758061/131‑1 (MQ=255) aTCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGa > 2:758061/1‑131 (MQ=255) tCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGTATTGAGCACCTTTTa < 2:1435186/140‑1 (MQ=255) tCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTa < 2:1081743/140‑1 (MQ=255) cccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACa > 1:1423274/1‑140 (MQ=255) cccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACa < 2:231193/140‑1 (MQ=255) cccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACa < 2:671995/140‑1 (MQ=255) cccGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACa < 2:1103376/140‑1 (MQ=255) cGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGc > 1:1369279/1‑140 (MQ=255) tCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTAc > 2:469463/1‑134 (MQ=255) tCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTAc < 1:469463/134‑1 (MQ=255) tCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTc < 1:635596/140‑1 (MQ=255) tGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTa < 2:764542/131‑1 (MQ=255) tGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTa > 1:764542/1‑131 (MQ=255) ggAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAgg < 2:754492/140‑1 (MQ=255) gagaACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGt < 2:994380/140‑1 (MQ=255) agaACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGtt < 1:222672/140‑1 (MQ=255) agaACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGtt < 1:1184052/140‑1 (MQ=255) aaCACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGa > 1:364038/1‑140 (MQ=255) acCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGc < 2:274573/140‑1 (MQ=255) ataCCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCattatt > 2:1413364/1‑140 (MQ=255) aCCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGt > 1:646529/1‑140 (MQ=255) aCCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGt > 1:508133/1‑140 (MQ=255) aCCCGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGt > 2:945251/1‑140 (MQ=255) cccGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGtt > 2:624899/1‑140 (MQ=255) cccGCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGtt < 1:778019/140‑1 (MQ=255) gCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCg > 2:684170/1‑140 (MQ=255) gCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCg < 2:1444362/140‑1 (MQ=255) gCATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCg < 1:684170/140‑1 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGa < 1:276229/123‑1 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGa > 2:276229/1‑123 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATg < 2:441745/125‑1 (MQ=255) cATCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATg > 1:441745/1‑125 (MQ=255) aTCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGAc > 1:1367264/1‑140 (MQ=255) aTCGCTAACTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGAc > 1:477080/1‑140 (MQ=255) aaCTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGtt < 2:450700/140‑1 (MQ=255) aaCTATCTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGtt < 2:1367264/140‑1 (MQ=255) cTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGcctcc > 1:1206069/1‑140 (MQ=255) cTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGcctcc < 1:504750/140‑1 (MQ=255) cTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGcctcc > 1:589593/1‑140 (MQ=255) cTTGAGCGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGcctcc > 1:1101592/1‑140 (MQ=255) | GGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCC > NC_000913/88144‑88413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |