Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 744,027 | A→G | Q145Q (CAA→CAG) | pxpB → | 5‑oxoprolinase component B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 744,027 | 0 | A | G | 98.2% | 191.3 / ‑4.4 | 56 | Q145Q (CAA→CAG) | pxpB | 5‑oxoprolinase component B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (29/26); total (30/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.45e-01 |
GTGGTCGCGGCGCATTGCGGGTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAACTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATACCTCACTCAGC > NC_000913/743902‑744162 | gtggtCGCGGCGCATTGCGGGTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACg < 2:299485/140‑1 (MQ=255) gtggtCGCGGCGCATTGCGGGTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACg < 2:29550/140‑1 (MQ=255) tggtCGCGGCGCATTGCGGGTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACgg > 1:352902/1‑140 (MQ=255) gcATTGCGGGTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAAc < 1:345855/140‑1 (MQ=255) ggTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTa < 2:632045/140‑1 (MQ=255) gTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTAc > 2:1075759/1‑140 (MQ=255) gAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTcc > 2:317727/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGtt < 1:1069490/140‑1 (MQ=255) tgAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGtt > 1:587862/1‑134 (MQ=255) tgAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGtt < 2:587862/134‑1 (MQ=255) ctcctcCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATcggcg > 2:196972/1‑140 (MQ=255) tcctccGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATcggcgg > 2:362939/1‑140 (MQ=255) ctccGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGc > 1:356150/1‑140 (MQ=255) ccGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCg < 2:352902/140‑1 (MQ=255) ccGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCg > 1:309492/1‑140 (MQ=255) ccGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCg < 1:317727/140‑1 (MQ=255) cGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGc > 2:154934/1‑140 (MQ=255) cGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAACTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGc > 1:414025/1‑140 (MQ=255) gAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGAc < 2:198649/140‑1 (MQ=255) tACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTgg > 1:175235/1‑140 (MQ=255) tACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTgg > 2:449/1‑140 (MQ=255) cGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTgggg > 2:224611/1‑138 (MQ=255) cGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGgtg > 1:182562/1‑140 (MQ=255) ggTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGttt > 1:131328/1‑140 (MQ=255) tCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTAt > 2:731976/1‑140 (MQ=255) cTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATc > 1:1120373/1‑140 (MQ=255) ggTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCg < 2:22892/140‑1 (MQ=255) ttAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTggg > 1:1019946/1‑139 (MQ=255) tttCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGcc > 2:773599/1‑140 (MQ=255) tttCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGcc > 2:195891/1‑140 (MQ=255) tttCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGcc > 1:1044544/1‑140 (MQ=255) ggCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGtggctg < 1:195891/140‑1 (MQ=255) ggCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGtggctg > 1:131153/1‑140 (MQ=255) cTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACGCACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTAGTGTTTATCCGCTGACACCCCGGGGtggctggc < 2:419695/140‑1 (MQ=255) cTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGtggctggc > 1:619586/1‑140 (MQ=255) gTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACCCACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGa < 2:124890/140‑1 (MQ=255) gTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGa < 2:619586/140‑1 (MQ=255) gTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGa < 2:175235/140‑1 (MQ=255) gTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGa < 2:182562/140‑1 (MQ=255) tctcGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTg > 1:920134/1‑140 (MQ=255) ctcGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTgg < 1:449/140‑1 (MQ=255) tcGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGt < 1:957723/140‑1 (MQ=255) tcGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGt < 1:196972/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTc < 2:1130663/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTc < 1:1018955/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTc < 1:154934/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTc < 1:1075759/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTc < 1:1075223/140‑1 (MQ=255) cGGGAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTACGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTc < 1:692692/140‑1 (MQ=255) gggAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGGGGCTGGCAGTTGATTGGTCa > 2:620622/1‑140 (MQ=255) ggAGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCCGACTGGGGGTTTTCCGCTGGCAACGCCGGGGGGCTGGGAGGTGATTGGTCAt > 2:1075223/1‑140 (MQ=255) aGTTTGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATAc < 1:679892/140‑1 (MQ=255) tttGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATACct < 2:309492/140‑1 (MQ=255) tGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATACctca > 2:140054/1‑140 (MQ=255) tGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGGTGATTGGGTATAActcc > 1:324932/1‑139 (MQ=255) tGCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGGGGGTGGCAGGTGGTTGGTCATACctcc > 2:850904/1‑139 (MQ=255) gCCGGAACAGCTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCAGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGGAACGCCGGGTGGGTGGCAGTTGATTTGTCATACctcac > 2:324094/1‑140 (MQ=255) aacagcTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATACCTCACTCAGc < 2:131328/140‑1 (MQ=255) aacagcTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATACCTCACTCAGc < 1:731976/140‑1 (MQ=255) | GTGGTCGCGGCGCATTGCGGGTTGAGCGAAAAACAGGTTGTTGAATTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGGAGTTTGCCGGAACAACTACACACGCCACGGCGCGCTGAACCGCGCTTACTCGTTCCGGCAGGTTCTGTCGGGATCGGCGGGCCGCAGACTGGTGTTTATCCGCTGGCAACGCCGGGTGGCTGGCAGTTGATTGGTCATACCTCACTCAGC > NC_000913/743902‑744162 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |