| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 286,949 | Δ1 bp | coding (161/1611 nt) | yagH → | CP4‑6 prophage; putative xylosidase/arabinosidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 286,946 | 0 | C | . | 98.7% | 317.6 / ‑2.9 | 76 | coding (158/1611 nt) | yagH | CP4‑6 prophage; putative xylosidase/arabinosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (47/28); minor base G (0/1); total (47/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGATTGTCGACTCGC > NC_000913/286808‑287077 | tACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCAcc > 1:420618/1‑140 (MQ=255)tACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCAcc > 2:453214/1‑140 (MQ=255) aCCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCAcccgttg > 2:465012/1‑136 (MQ=255) aCCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCAcccgttg > 1:232434/1‑136 (MQ=255) ccGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTgg > 2:649401/1‑140 (MQ=255) ccGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTgg > 2:365913/1‑140 (MQ=255) cTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACcg > 1:462866/1‑140 (MQ=255) cTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACcg > 1:319353/1‑140 (MQ=255) cTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACcg > 2:1169964/1‑140 (MQ=255) cTTCAACCCGGACCCGTCCCTGCGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACcg > 2:247167/1‑140 (MQ=255) aCCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCgtgt < 2:232434/140‑1 (MQ=255) ggACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGAt > 1:769246/1‑140 (MQ=255) gACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCgtgt < 1:581344/135‑1 (MQ=255) gACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCgtgt > 2:581344/1‑135 (MQ=255) tgCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTg < 2:1182854/131‑1 (MQ=255) tgCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTg > 1:1182854/1‑131 (MQ=255) ccAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCaa > 1:1254124/1‑140 (MQ=255) ccAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCaa > 2:1133149/1‑140 (MQ=255) aGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACt > 1:969286/1‑140 (MQ=255) gACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTcc < 2:211740/140‑1 (MQ=255) gACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTcc < 2:909252/140‑1 (MQ=255) ctacATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCcggcgg < 1:649401/140‑1 (MQ=255) ctacATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCcggcgg < 2:1082378/140‑1 (MQ=255) acATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCa < 2:420618/140‑1 (MQ=255) cATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCcgg < 1:964980/134‑1 (MQ=255) cATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCAt > 1:1369631/1‑140 (MQ=255) cATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCAt > 1:885254/1‑140 (MQ=255) cATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATACTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCcgg > 2:964980/1‑134 (MQ=255) aTCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATc > 2:999617/1‑140 (MQ=255) cGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTg > 2:88114/1‑140 (MQ=255) cGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTg > 2:1304002/1‑140 (MQ=255) cGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTg > 2:1226510/1‑140 (MQ=255) cGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTg > 2:482685/1‑140 (MQ=255) ccACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTggg < 1:573442/140‑1 (MQ=255) ccACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTggg > 2:9885/1‑140 (MQ=255) ccACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCATTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTggg > 2:422493/1‑140 (MQ=255) aCCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGgcg > 1:147121/1‑140 (MQ=255) aCCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGgcg > 1:811391/1‑140 (MQ=255) aCCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGgcg < 1:453214/140‑1 (MQ=255) ccTCGACCTTCGAGTGGTTTCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGgcgc < 2:1389449/140‑1 (MQ=255) ccTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGgcgc > 1:432045/1‑140 (MQ=255) ccTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGgcgc > 2:658054/1‑140 (MQ=255) tCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCg > 2:1265330/1‑140 (MQ=255) aCCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGc < 1:365913/140‑1 (MQ=255) aCCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGc > 1:764900/1‑140 (MQ=255) aCCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGc < 2:1369631/140‑1 (MQ=255) cGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAg < 1:247167/140‑1 (MQ=255) gAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGc > 1:459075/1‑134 (MQ=255) gAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGc < 2:459075/134‑1 (MQ=255) gTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGc > 1:502486/1‑140 (MQ=255) gTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGCGCCTGAGCTACGc > 2:764865/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGt < 1:1289789/140‑1 (MQ=255) tGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAAt > 1:1090823/1‑140 (MQ=255) tGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAAt > 2:1302819/1‑140 (MQ=255) tGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAAt > 1:514719/1‑140 (MQ=255) aTCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTgg < 1:1304002/140‑1 (MQ=255) aTCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTgg < 2:514719/140‑1 (MQ=255) aTCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTgg < 1:482685/140‑1 (MQ=255) tCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgc < 1:1169964/140‑1 (MQ=255) cTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgct > 2:832519/1‑140 (MQ=255) cTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgct > 2:460683/1‑140 (MQ=255) tACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgctg < 1:1133149/140‑1 (MQ=255) ccACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgctgct < 1:676124/140‑1 (MQ=255) cGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgctgct > 1:1342404/1‑133 (MQ=255) cGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGgctgct < 2:1342404/133‑1 (MQ=255) cGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACAcc > 1:1238639/1‑140 (MQ=255) cGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACAcc < 2:462866/140‑1 (MQ=255) cGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACAcc > 1:120744/1‑140 (MQ=255) cGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCCGGCTGCTCTACAcc < 1:1265330/140‑1 (MQ=255) gTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCg > 2:749168/1‑140 (MQ=255) tGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGa > 1:578593/1‑140 (MQ=255) tGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGa < 1:1226510/140‑1 (MQ=255) aaaaaCTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAg > 2:108263/1‑140 (MQ=255) aaaaaCTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAg > 2:401397/1‑140 (MQ=255) aaaaaCTGGTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGG‑CATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGa > 1:612561/1‑140 (MQ=255) aaCTGGTCGCTGGTCAGC‑GCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGAtt < 1:764865/140‑1 (MQ=255) gTCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGATTGTCGa > 1:1360846/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGG‑CATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGATTGTCGACt < 2:612561/140‑1 (MQ=255) cGCTGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGATTGTCGACt > 1:1287365/1‑140 (MQ=255) tGGTCAGCA‑CCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGATTGTCGACTCGc > 2:486876/1‑140 (MQ=255) | TACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGGCGGCATCTGGGCGCCGTGCCTGAGCTACGCCGACGGTAAATTCTGGCTGCTCTACACCGACGTGAAGATTGTCGACTCGC > NC_000913/286808‑287077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |