| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,584,183 | A→G | V860A (GTG→GCG) | hsdR ← | type I restriction enzyme EcoKI endonuclease component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,584,183 | 0 | A | G | 97.6% | 282.7 / ‑2.5 | 82 | V860A (GTG→GCG) | hsdR | type I restriction enzyme EcoKI endonuclease component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (35/45); total (36/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
CGCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCT > NC_000913/4584048‑4584316 | cGCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCgg > 1:1045107/1‑140 (MQ=255) gCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGa > 2:286365/1‑140 (MQ=255) ggAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGc > 1:930657/1‑140 (MQ=255) gAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCa > 2:12664/1‑140 (MQ=255) gAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCa > 1:1290025/1‑140 (MQ=255) ccaccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCg < 2:1090817/140‑1 (MQ=255) ccaccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCg < 1:865844/140‑1 (MQ=255) ccaccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCg < 1:766376/140‑1 (MQ=255) accaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGAc < 2:862921/140‑1 (MQ=255) ccaGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACg < 1:609496/140‑1 (MQ=255) ttgttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTCCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGctct < 2:1223860/140‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCa < 2:1190474/140‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCa < 1:880878/140‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCa < 1:580573/140‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCa < 2:706136/140‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCg < 2:1146520/140‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCg > 2:416045/1‑140 (MQ=255) tGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGt > 1:1284026/1‑140 (MQ=255) ggCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTg < 2:12680/140‑1 (MQ=255) ggCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTg < 2:1288747/140‑1 (MQ=255) ggCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTg > 1:141780/1‑140 (MQ=255) ggCTGTACTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTg > 2:1260565/1‑140 (MQ=255) gCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGc < 2:769333/140‑1 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGc > 2:724138/1‑132 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGc < 1:724138/132‑1 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:1075148/140‑1 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:1126315/140‑1 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:1203839/140‑1 (MQ=255) tgCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa > 1:11299/1‑140 (MQ=255) cTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGa > 2:1328218/1‑140 (MQ=255) cAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGc > 2:481779/1‑125 (MQ=255) cAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGc < 1:481779/125‑1 (MQ=255) cAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCg > 1:839669/1‑140 (MQ=255) cAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCg > 1:49843/1‑140 (MQ=255) aaCTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGaca < 2:444497/140‑1 (MQ=255) aCTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGacac < 1:105319/140‑1 (MQ=255) cGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATAGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGATGTCGACCCTCTCGAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTc > 2:1236832/1‑140 (MQ=255) gCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCaa > 1:445775/1‑140 (MQ=255) aTCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCaaaaa > 2:556631/1‑140 (MQ=255) tCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTaaa < 2:668126/140‑1 (MQ=255) cGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAg > 2:430976/1‑140 (MQ=255) gATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTgg < 2:11299/140‑1 (MQ=255) aTTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGt > 1:289262/1‑140 (MQ=255) taGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTAtt > 1:342785/1‑140 (MQ=255) gTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCAc < 1:393902/140‑1 (MQ=255) ttCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCt < 2:342785/140‑1 (MQ=255) ttCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCt < 2:1045107/140‑1 (MQ=255) tCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTc > 1:140798/1‑140 (MQ=255) tCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGGGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTc > 2:1392731/1‑140 (MQ=255) tCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTACACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTc > 1:316435/1‑140 (MQ=255) tGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTcc < 2:295967/139‑1 (MQ=255) tGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTcc > 1:295967/1‑139 (MQ=255) tCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCa < 1:1392731/140‑1 (MQ=255) cGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCAt > 2:110710/1‑140 (MQ=255) ggTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATa > 2:844691/1‑140 (MQ=255) ttCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGcgcg < 2:141780/140‑1 (MQ=255) tCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGt > 1:688159/1‑140 (MQ=255) tGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGgcg < 2:289262/140‑1 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGgcgc > 2:82052/1‑140 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGgcgc < 1:1236832/140‑1 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGgcgc < 1:1183298/140‑1 (MQ=255) cAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGc > 2:541148/1‑140 (MQ=255) cAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGc > 1:358910/1‑140 (MQ=255) aGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGcc < 2:140798/140‑1 (MQ=255) aGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGcc > 2:1039426/1‑140 (MQ=255) tGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCAt < 2:964835/140‑1 (MQ=255) gCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATc > 2:983166/1‑140 (MQ=255) gCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATc < 2:316435/140‑1 (MQ=255) gCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATc < 1:286365/140‑1 (MQ=255) aGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTg < 1:12664/140‑1 (MQ=255) gTTCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGt < 1:541148/140‑1 (MQ=255) tCCACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTc > 2:304927/1‑140 (MQ=255) ccACCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCg > 1:221986/1‑140 (MQ=255) aCCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTa < 1:882186/140‑1 (MQ=255) aCCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTa < 2:688159/140‑1 (MQ=255) aCCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTa < 1:491198/140‑1 (MQ=255) aCCTTCGGGCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTa < 1:1039426/140‑1 (MQ=255) gggCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAAt > 2:373849/1‑140 (MQ=255) ggCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATg < 1:1260565/140‑1 (MQ=255) ggCGCACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGACATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATg < 2:839669/140‑1 (MQ=255) gcACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCgg < 1:249695/140‑1 (MQ=255) gcACCACCGCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCgg < 1:1042577/140‑1 (MQ=255) accaccgccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCt < 2:1284026/140‑1 (MQ=255) | CGCTGGAGCTTCGCCACCAGTTGTTCATGGCTGTGCTCGGCAAAACTGCGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCATCTGTTCGTACAGAATGCGGCT > NC_000913/4584048‑4584316 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |