Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 118,297 | C→T | G117S (GGC→AGC) | nadC ← | quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 118,297 | 0 | C | T | 98.4% | 220.6 / NA | 63 | G117S (GGC→AGC) | nadC | quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (34/28); minor base G (0/1); total (34/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGCTGAACGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCCCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAACACCTCTTCAACCCAGC > NC_000913/118160‑118431 | agCTGAACGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCg > 2:545617/1‑140 (MQ=255) aaCGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAAc > 2:354864/1‑140 (MQ=255) aaCGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAAc > 2:370583/1‑140 (MQ=255) aaCGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAAc > 1:377084/1‑140 (MQ=255) cGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAg < 1:1187672/140‑1 (MQ=255) cAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCa < 1:137649/140‑1 (MQ=255) ggCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCAcg < 1:94407/140‑1 (MQ=255) ggCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCAcg < 1:545617/140‑1 (MQ=255) gggTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCggg > 1:1262558/1‑140 (MQ=255) gggTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCggg > 1:624660/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGa > 1:822646/1‑140 (MQ=255) tGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCa > 1:204135/1‑140 (MQ=255) tGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCa > 1:25528/1‑140 (MQ=255) gcgcGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTc > 1:933923/1‑138 (MQ=255) gcgcGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTc < 2:933923/138‑1 (MQ=255) cgTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGtt < 2:481988/140‑1 (MQ=255) cgTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCGCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGtt < 1:934850/140‑1 (MQ=255) aTCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGa > 2:751272/1‑140 (MQ=255) aacTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGga < 2:344661/140‑1 (MQ=255) cGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGgattgat > 1:538718/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGgattgat > 2:413031/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGgattgat > 1:893177/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGgattgat < 1:370583/140‑1 (MQ=255) cGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGgattgat < 2:564238/140‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGc < 1:751272/140‑1 (MQ=255) tGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATtg > 1:882853/1‑140 (MQ=255) gCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATtga < 2:538718/140‑1 (MQ=255) ccTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATtgat > 1:1171512/1‑140 (MQ=255) ccAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACa < 2:121400/140‑1 (MQ=255) gCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCg < 2:452126/140‑1 (MQ=255) gCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCg < 2:25528/140‑1 (MQ=255) gCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCg < 2:1157354/140‑1 (MQ=255) aaTTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGcc < 2:951118/140‑1 (MQ=255) ttCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGTATTGATGACATCGCCGt > 2:953977/1‑140 (MQ=255) aCATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATc < 1:413031/140‑1 (MQ=255) cATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATcc > 1:477263/1‑140 (MQ=255) aTAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCca < 2:477263/140‑1 (MQ=255) aTAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCca < 2:204135/140‑1 (MQ=255) tAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCcac < 1:137012/140‑1 (MQ=255) tACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGa > 2:982291/1‑140 (MQ=255) cTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTa > 2:245177/1‑140 (MQ=255) cTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTa > 2:320149/1‑140 (MQ=255) cTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTa > 2:510446/1‑140 (MQ=255) ttACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGc < 2:886677/132‑1 (MQ=255) ttACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGc > 1:886677/1‑132 (MQ=255) aaCTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACAt > 1:776213/1‑140 (MQ=255) aCTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACAtc > 2:484080/1‑140 (MQ=255) aCTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACAtc > 2:519291/1‑140 (MQ=255) tCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACAtcgt > 1:806219/1‑140 (MQ=255) aGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGTATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGc < 1:953977/140‑1 (MQ=255) aGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGc < 2:110334/140‑1 (MQ=255) gTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAg > 1:234626/1‑140 (MQ=255) ttGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGtt > 1:922042/1‑140 (MQ=255) ttGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGtt > 1:753887/1‑140 (MQ=255) tGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTg < 1:982291/140‑1 (MQ=255) caAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATa < 2:1262558/140‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATaaa > 1:923067/1‑140 (MQ=255) aaTTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAac < 2:83168/140‑1 (MQ=255) aaTTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAac > 1:550858/1‑140 (MQ=255) aaTTAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGAGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAac < 2:882853/140‑1 (MQ=255) ttAAGCGCAGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAacac < 2:806219/140‑1 (MQ=255) aGTGCGTTCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAACACCTCTTCaa > 2:202093/1‑140 (MQ=255) ttCGCTCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAACACCTCTTCAACCCAGc > 2:767545/1‑140 (MQ=255) | AGCTGAACGCAGGCCGGGTAAGGTTTTGCGCGTATCCAACAACTGCGTGTTGGTGCCTTCCAGCAATTCGACATAGTGGCGTACCTTACTGGCAACTCCTGAAAGGGTTTGCACAAAATTAAGCGCAGTGCGTTCGCCCGTTAACAGCACGCGGGATGGGCCTTCAAGTTCGAACAAGGATTGATTGGCATTGATGACATCGCCGTCATCCACATGCCAGATTATGGTGACATCGTCGCCTGCCAGTTGAATAAACACCTCTTCAACCCAGC > NC_000913/118160‑118431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |