| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,529,541 | T→C | pseudogene (1652/2049 nt) | rhsE → | RhsE protein in rhs element |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,529,541 | 0 | T | C | 99.3% | 496.1 / ‑5.1 | 137 | pseudogene (1652/2049 nt) | rhsE | RhsE protein in rhs element |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (61/75); total (62/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGA > NC_000913/1529404‑1529671 | cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCAc > 1:1036032/1‑140 (MQ=255)cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCAc > 2:107177/1‑140 (MQ=255)cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCAc < 1:1165223/140‑1 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCt > 2:684640/1‑140 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCt > 1:1115909/1‑140 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCt > 1:1269742/1‑140 (MQ=255) gACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTgg > 1:38327/1‑140 (MQ=255) gATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattga < 1:567869/140‑1 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 1:969319/1‑140 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 2:1016702/1‑140 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 1:1215409/1‑140 (MQ=255) tGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCa < 2:912646/140‑1 (MQ=255) agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCaaa < 1:1020891/140‑1 (MQ=255) agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCaaa > 2:838672/1‑140 (MQ=255) agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCaaa < 1:735388/140‑1 (MQ=255) agGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 2:1150285/140‑1 (MQ=255) agGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 1:107177/140‑1 (MQ=255) agGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 2:639644/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 1:684640/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 2:240859/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 2:38327/140‑1 (MQ=255) tggatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCa > 1:675216/1‑140 (MQ=255) gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATGTGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCAtt < 1:52033/140‑1 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 1:1098951/140‑1 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 2:591415/140‑1 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 1:217726/140‑1 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 2:1036602/140‑1 (MQ=255) atGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAg > 2:25623/1‑140 (MQ=255) gTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCAtt < 2:1276642/130‑1 (MQ=255) gTATCAGCATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTg > 2:1154134/1‑140 (MQ=255) aTCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 2:1126882/123‑1 (MQ=255) aTCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc > 1:953049/1‑125 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 1:847192/130‑1 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAc > 2:411081/1‑140 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAc > 1:612787/1‑140 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAc > 1:283372/1‑140 (MQ=255) tATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCa > 1:796322/1‑140 (MQ=255) tcagTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATACCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 2:886644/123‑1 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 2:499568/126‑1 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt > 2:1044822/1‑140 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt > 1:382031/1‑140 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt > 2:631248/1‑140 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt > 1:346266/1‑140 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt < 1:928492/140‑1 (MQ=255) ccGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGtt < 1:411081/140‑1 (MQ=255) ttGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCgg > 1:865288/1‑140 (MQ=255) aTCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTAt > 2:777628/1‑140 (MQ=255) aTCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTAt > 1:1087614/1‑140 (MQ=255) ccATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGat < 2:1087614/140‑1 (MQ=255) cATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGata > 1:1275761/1‑140 (MQ=255) aTACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 1:1154134/140‑1 (MQ=255) aTACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 2:68589/140‑1 (MQ=255) aaGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGAt > 1:581360/1‑140 (MQ=255) gTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGc > 1:1218620/1‑140 (MQ=255) gTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCgg < 1:990142/125‑1 (MQ=255) gTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGc > 1:583048/1‑140 (MQ=255) tGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCt < 2:435194/140‑1 (MQ=255) tAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 1:1007917/1‑140 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttg > 2:43654/1‑140 (MQ=255) aaTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTTGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 1:542582/140‑1 (MQ=255) aaTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 2:509164/1‑140 (MQ=255) aaTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 1:777628/140‑1 (MQ=255) aaTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 2:285138/140‑1 (MQ=255) aTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCgg < 2:865288/140‑1 (MQ=255) tGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGa < 1:25623/140‑1 (MQ=255) ggggTTAGATGTGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAg < 1:1065643/140‑1 (MQ=255) ggggTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAg < 1:111690/140‑1 (MQ=255) ggggTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAg < 2:382031/140‑1 (MQ=255) gggTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGc < 2:583048/140‑1 (MQ=255) ttAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCa > 2:174660/1‑140 (MQ=255) ttAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCa > 2:91941/1‑140 (MQ=255) tGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 2:186603/1‑128 (MQ=255) tGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 1:186603/128‑1 (MQ=255) cGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCt < 2:967444/131‑1 (MQ=255) cGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCt > 1:967444/1‑131 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc > 1:1264579/1‑140 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc < 2:1216133/140‑1 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc < 2:374501/140‑1 (MQ=255) tGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCa < 2:1007917/140‑1 (MQ=255) gACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCaa > 2:859174/1‑140 (MQ=255) gACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCaa > 1:893057/1‑140 (MQ=255) tCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgag < 1:43654/140‑1 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga < 1:1221608/140‑1 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga < 1:91941/140‑1 (MQ=255) ggTGGGCTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACa < 1:133415/140‑1 (MQ=255) gTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACAt > 1:310278/1‑140 (MQ=255) tGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACAtt < 2:925376/140‑1 (MQ=255) tGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACAtt < 2:796322/140‑1 (MQ=255) aCTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGtt > 2:304950/1‑140 (MQ=255) tATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAt < 1:509164/140‑1 (MQ=255) tATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAt < 2:1234862/140‑1 (MQ=255) tATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAt < 2:310278/140‑1 (MQ=255) tGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAtgt > 2:592073/1‑140 (MQ=255) gCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAtgtg > 2:1073856/1‑140 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTAc < 1:46770/128‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 2:969319/140‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 1:174660/140‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa > 2:665527/1‑140 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 1:665527/140‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGGTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 1:60500/140‑1 (MQ=255) | CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGA > NC_000913/1529404‑1529671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |