Predicted mutation
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RA	NC_000913	2,818,331	G→T	intergenic (‑57/+142)	argY ← / ← argV	tRNA‑Arg/tRNA‑Arg

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	2,818,331	0	G	T	100.0%	116.7 / NA	35	intergenic (‑57/+142)	argY/argV	tRNA‑Arg/tRNA‑Arg
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (19/16);  total (19/16)

TTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACGT  >  NC_000913/2818301‑2818466                               |                                                                                                                                         atattGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCtt                            >  2:20948/4‑140 (MQ=255)   attGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTcc                          >  1:442408/2‑140 (MQ=255)        tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGcc                                   <  1:1098861/126‑1 (MQ=255)        tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGcc                                   >  2:1098861/1‑126 (MQ=255)        tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATAcc                     >  2:670984/1‑140 (MQ=255)        tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATAcc                     >  2:77706/1‑140 (MQ=255)        tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAACAAC‑GTTATCCACCCTGGTCGCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCGCTAcc                     >  2:1133126/1‑140 (MQ=11)        tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGGTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGGTATTACCGCCACCTCTTCCATAcc                     >  2:1154996/1‑140 (MQ=11)           cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTc                  >  1:698437/1‑140 (MQ=255)                ctaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGc             >  2:806586/1‑140 (MQ=255)                ctaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGc             >  2:403189/1‑140 (MQ=255)                ctaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAA‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGc             >  2:1130496/1‑140 (MQ=255)                 taAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCt            >  1:955503/1‑140 (MQ=255)                   aaGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGa          <  2:795843/140‑1 (MQ=255)                    aGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaa         <  2:191761/140‑1 (MQ=255)                     gCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaaa        <  1:629369/140‑1 (MQ=255)                     gCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaaa        <  2:634407/140‑1 (MQ=255)                     gCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaaa        <  1:1195699/140‑1 (MQ=255)                       catATCAATTAAGAGATGGTGCATCGGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGc             >  1:590468/3‑133 (MQ=255)                       catATCAATTAAGAGATGGTGCATCGGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGc             <  2:590468/131‑1 (MQ=255)                       catATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGt      <  1:1047/138‑1 (MQ=255)                       catATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGt      <  2:829521/138‑1 (MQ=255)                       catATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGt      <  1:806586/138‑1 (MQ=255)                       catATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGt      <  1:1039725/138‑1 (MQ=255)                        atATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTa     >  2:509166/2‑140 (MQ=255)                        atATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCCTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCCCTTCCCTACCTTCATCGCTGAAAgga     >  2:1160582/2‑138 (MQ=14)                         tATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTAc    <  1:509166/140‑1 (MQ=255)                          aTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGGCGTTGCCAAAACAACGGTAATCCTCCCGGGGGCC‑GCGGTTATTACCGCCACCTCTTTCACTCCCTCCTCGCTGcaaagaag   >  2:629369/1‑135 (MQ=9)                          aTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTc                  <  2:601518/125‑1 (MQ=255)                          aTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTc                  >  1:601518/1‑125 (MQ=255)                          aTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTAc    <  1:861954/139‑1 (MQ=255)                          aTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTAc    >  2:861954/1‑139 (MQ=255)                          aTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAAC‑GTTATCCTCCCTGGTGCCCGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACg   >  1:81981/1‑140 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑