| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,572,404 | T→C | intergenic (‑359/+3) | gadB ← / ← pqqL | glutamate decarboxylase B/putative zinc peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,572,404 | 0 | T | C | 97.4% | 270.1 / ‑2.5 | 77 | intergenic (‑359/+3) | gadB/pqqL | glutamate decarboxylase B/putative zinc peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (39/36); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
TATCACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGTTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCA > NC_000913/1572272‑1572539 | tATCACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCGCTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTattatt < 2:757460/140‑1 (MQ=255) aTCACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTAttt > 2:668636/1‑140 (MQ=255) tCACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTAtttt > 2:92148/1‑140 (MQ=255) tCACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTAtttt < 1:618388/140‑1 (MQ=255) ccACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAACAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTAtttt < 2:546798/139‑1 (MQ=255) aaaTCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCaataa < 1:569736/140‑1 (MQ=255) cAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACt < 1:388908/140‑1 (MQ=255) aGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTc < 1:92148/140‑1 (MQ=255) gACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACGTAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTcc > 2:822922/1‑140 (MQ=255) gACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTcc > 1:376842/1‑140 (MQ=255) gACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTcc > 1:14214/1‑140 (MQ=255) aCCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTgg > 1:305245/1‑127 (MQ=255) aCCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTgg < 2:305245/127‑1 (MQ=255) ttAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGta < 1:229601/140‑1 (MQ=255) tAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGtat < 2:225145/140‑1 (MQ=255) tAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGtat < 1:415959/140‑1 (MQ=255) aaaaTATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGtata > 1:175822/1‑140 (MQ=255) cACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTAttt > 1:616090/1‑140 (MQ=255) aGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGAt < 1:822922/140‑1 (MQ=255) aGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGAt < 1:2402/140‑1 (MQ=255) cTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATgaga > 1:879027/1‑140 (MQ=255) tGATTATTATTTTGAACGCTTTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGaaa > 1:88717/1‑140 (MQ=255) tGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGaaa > 1:124371/1‑140 (MQ=255) tGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGaaa > 1:838789/1‑140 (MQ=255) tGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGaaa > 2:344022/1‑140 (MQ=255) attattattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGa > 2:470475/1‑140 (MQ=255) attattattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGa > 2:526442/1‑140 (MQ=255) attattattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGa > 2:890530/1‑140 (MQ=255) attattattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGa > 2:112748/1‑140 (MQ=255) attattattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGa > 1:207690/1‑140 (MQ=255) tattattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGata < 1:452588/140‑1 (MQ=255) attattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGatat > 2:443575/1‑140 (MQ=255) ttattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATAtt > 1:722686/1‑140 (MQ=255) ttattTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATAtt > 1:333988/1‑140 (MQ=255) ttttGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGtt > 2:702627/1‑140 (MQ=255) tGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTaa > 2:743154/1‑140 (MQ=255) tGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTaa > 2:430268/1‑140 (MQ=255) tGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTaa > 2:357762/1‑140 (MQ=255) aaCGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACg > 2:730964/1‑140 (MQ=255) aCGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACgg < 2:722686/140‑1 (MQ=255) cGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGc < 2:616090/140‑1 (MQ=255) cGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGc < 1:112748/140‑1 (MQ=255) gCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCa < 1:890530/140‑1 (MQ=255) cATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAg < 2:75778/140‑1 (MQ=255) cATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAg < 2:75911/140‑1 (MQ=255) aTTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGatat > 1:849602/1‑126 (MQ=255) aTTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGatat < 2:849602/126‑1 (MQ=255) aTTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAgt > 2:217029/1‑140 (MQ=255) ataAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTa < 2:14214/140‑1 (MQ=255) ttaCATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTctct > 1:583006/1‑140 (MQ=255) aCATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTGTTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTAc > 2:155651/1‑140 (MQ=255) aaaTAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCAt > 2:753637/1‑140 (MQ=255) aaaTAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCAt > 2:245863/1‑140 (MQ=255) tatTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTcaac > 1:120627/1‑140 (MQ=255) tGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAAt < 2:879027/140‑1 (MQ=255) tGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAAt < 2:708979/140‑1 (MQ=255) tGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAAt < 1:668636/140‑1 (MQ=255) aaaTCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTc < 1:357762/140‑1 (MQ=255) aaaTCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTc < 2:583006/140‑1 (MQ=255) aaaTCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTc < 1:753637/140‑1 (MQ=255) ccccGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGc < 1:165832/140‑1 (MQ=255) cGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCa > 2:78069/1‑140 (MQ=255) cGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCa > 1:312604/1‑140 (MQ=255) gCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGTTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAAt > 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2:731471/1‑140 (MQ=255) tgtTGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCAtgctgc < 2:376842/140‑1 (MQ=255) ttGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCa < 1:618756/132‑1 (MQ=255) ttGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCa > 2:618756/1‑132 (MQ=255) tGACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAgg < 2:312604/140‑1 (MQ=255) gACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTGTTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGa < 1:155651/140‑1 (MQ=255) gACGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGa < 1:743154/140‑1 (MQ=255) aCGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGAt > 2:906929/1‑140 (MQ=255) aCGGGGCTGCTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGAt > 2:330144/1‑140 (MQ=255) gctgctATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCa > 1:144938/1‑140 (MQ=255) | TATCACGTAAAAATCAGACCTTAAAATATCACTATTAGTACTTGATTATTATTTTGAACGCATTTATAAAATTATTACATAAAAATAGCGAATATTGCTAAAATCCCCGCCAACGATGTGTTGACGGGGCTGTTATTATTTTGGCAATAATACTCCGGTATAAGTATTTACCGGATGAGAAAGATATTGTTTAACGGCAGTGTTAACATTCTCTACCGTCATTTGTTTCAACAATTGCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCA > NC_000913/1572272‑1572539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |