Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,892,308 | G→A | G32E (GGG→GAG) | queD → | 6‑carboxy‑5,6,7,8‑tetrahydropterin synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,892,308 | 0 | G | A | 100.0% | 198.9 / NA | 56 | G32E (GGG→GAG) | queD | 6‑carboxy‑5,6,7,8‑tetrahydropterin synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (25/31); total (25/31) |
TTCCGGTACTCTACGGCGGTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGGGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGAT > NC_000913/2892172‑2892441 | ttCCGGTACTCTACGGCGGTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCa < 2:62063/140‑1 (MQ=255) ttCCGGTACTCTACGGCGGTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCa < 1:366029/140‑1 (MQ=255) tCCGGTACTCTACGGCGGTTTTTTCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCAt > 2:729476/1‑140 (MQ=255) aCTCTACGGCGGTTTTTTTGTCCTTTAGAGAAAATATGATGTCCACCACGTTATTTAAAAATTTCACCTTCCAAACCCCTCACCGCTTTCCACACGTCCCCGGAGGGCATAAAATTGGGCGCCCGCACGAGCATTCCttt > 2:381990/1‑140 (MQ=255) cggcggTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCCGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTg < 2:634852/140‑1 (MQ=255) ggcggTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGc < 2:871118/140‑1 (MQ=255) cggTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGa < 1:486461/140‑1 (MQ=255) aTCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGaaa > 1:82838/1‑140 (MQ=255) tGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCgg < 1:564224/140‑1 (MQ=255) gTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCggg > 2:531325/1‑140 (MQ=255) aaaTTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTc > 1:273901/1‑140 (MQ=255) aaaTTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTc > 1:514369/1‑140 (MQ=255) aaaTTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTc > 2:166549/1‑140 (MQ=255) aaaTTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTc > 2:494653/1‑140 (MQ=255) aTTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGa > 1:2046/1‑140 (MQ=255) atgatgTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATcc > 1:515644/1‑140 (MQ=255) atgatgTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATcc > 1:542649/1‑140 (MQ=255) atgTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCa < 1:381990/140‑1 (MQ=255) tgTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCAt < 2:554382/140‑1 (MQ=255) gTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATc < 1:536262/134‑1 (MQ=255) gTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATc > 2:536262/1‑134 (MQ=255) tCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATAc > 1:186338/1‑140 (MQ=255) ccaccaCGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACg < 1:919532/140‑1 (MQ=255) caccacGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACgg > 2:487416/1‑140 (MQ=255) caccacGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACgg > 1:542640/1‑140 (MQ=255) caccacGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACgg > 2:303701/1‑140 (MQ=255) cacGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCt < 2:514369/140‑1 (MQ=255) gTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGa < 1:565962/140‑1 (MQ=255) tATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGAtt > 1:864924/1‑140 (MQ=255) tttAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTAt > 2:303225/1‑140 (MQ=255) tttCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCg < 2:551577/140‑1 (MQ=255) ttCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGc > 1:823485/1‑140 (MQ=255) tCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCt < 1:648634/140‑1 (MQ=255) tCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCt < 2:82838/140‑1 (MQ=255) cTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAAc < 1:143033/140‑1 (MQ=255) gCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAgc < 1:555775/140‑1 (MQ=255) gCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAgcggc > 1:207103/1‑140 (MQ=255) aCCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGttt < 1:318743/140‑1 (MQ=255) cGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATAATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTaa < 2:355566/140‑1 (MQ=255) ttACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAaacc < 1:367626/140‑1 (MQ=255) tCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAg > 2:569984/1‑140 (MQ=255) cccGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAgc < 2:864924/140‑1 (MQ=255) ggAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGcc < 2:823485/140‑1 (MQ=255) gAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCt < 2:186338/140‑1 (MQ=255) gggCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGa < 1:729476/140‑1 (MQ=255) gggCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGa < 1:569984/140‑1 (MQ=255) gggCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGa < 2:2046/140‑1 (MQ=255) ggCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGAt < 2:515644/140‑1 (MQ=255) ggCATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGAt > 1:518668/1‑140 (MQ=255) cATAAATGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCa > 1:745713/1‑140 (MQ=255) aaaTGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCGCCa < 1:494653/140‑1 (MQ=255) aTGTGGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCAtt < 1:303701/140‑1 (MQ=255) tgGTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTCTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTAtc > 2:752356/1‑140 (MQ=255) ggTCGCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTAtct < 2:542640/140‑1 (MQ=255) gCCTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAAt > 2:100837/1‑140 (MQ=255) cTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGa < 1:487416/140‑1 (MQ=255) cTGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGa > 1:145423/1‑140 (MQ=255) tGCACGAGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGat > 1:677816/1‑140 (MQ=255) | TTCCGGTACTCTACGGCGGTTTTATCGTCCTGTAGAGAAATTATGATGTCCACCACGTTATTTAAAGATTTCACCTTCGAAGCCGCTCACCGCTTACCACACGTCCCGGAAGGGCATAAATGTGGTCGCCTGCACGGGCATTCCTTTATGGTGCGACTGGAAATTACCGGGGAAGTCGATCCGCATACGGGCTGGATTATCGATTTCGCTGAACTAAAAGCGGCGTTTAAACCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGAT > NC_000913/2892172‑2892441 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |