Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,462,897 | (T)7→8 | intergenic (‑237/+157) | nrdD ← / ← treC | anaerobic ribonucleoside‑triphosphate reductase/trehalose‑6‑phosphate hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,462,890 | 1 | . | T | 97.3% | 257.6 / ‑0.9 | 73 | intergenic (‑230/+164) | nrdD/treC | anaerobic ribonucleoside‑triphosphate reductase/trehalose‑6‑phosphate hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base T (50/21); total (51/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
TCGCCATCCGCTTATCCACAACGCCGCACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGC‑TTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTGACAGACAAAACCCCGG > NC_000913/4462753‑4463021 | tCGCCATCCGCTTATCCACAACGCCGCACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGC‑tt < 1:1308075/140‑1 (MQ=255) ccATCCGCTTATCCACAACGCCGCACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGC‑ttttt < 2:812313/140‑1 (MQ=255) aCGCCGCACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAg > 1:1259529/1‑140 (MQ=255) cgccgcACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGt > 1:364176/1‑140 (MQ=255) cgcACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTaaa > 2:224679/1‑140 (MQ=255) cgcACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGC‑TTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTaaaa > 1:489510/1‑140 (MQ=255) cACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTaaaaa > 2:1140907/1‑140 (MQ=255) ccTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGC‑TTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCa < 2:489510/140‑1 (MQ=255) cTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCa < 2:110597/140‑1 (MQ=255) cTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCa < 2:1243054/140‑1 (MQ=255) cTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCa < 1:1365706/140‑1 (MQ=255) ttttCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCt < 2:547253/124‑1 (MQ=255) ttttCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCt > 1:547253/1‑124 (MQ=255) cTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGAc < 1:1422025/140‑1 (MQ=255) gCAATTATAGTCGATTGATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTa > 2:1292854/1‑140 (MQ=255) aTTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAg > 2:1142250/1‑140 (MQ=255) aTTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAg > 1:1310395/1‑140 (MQ=255) tataGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCg > 1:172445/1‑140 (MQ=255) tataGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCg > 1:683886/1‑140 (MQ=255) tataGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCg > 2:972175/1‑140 (MQ=255) tCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATg > 1:1192603/1‑140 (MQ=255) ttAATACAACATATTGGGTTGGGACGCA‑TTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAAt > 2:1093985/1‑140 (MQ=255) aacaTATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTa < 2:1259529/140‑1 (MQ=255) caTATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAAt > 1:1401287/1‑140 (MQ=255) tgggttgggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAAtt > 2:1292914/1‑140 (MQ=255) tgggttgggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAAtt > 2:946526/1‑140 (MQ=255) tgggttgggACACGTTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAAtt > 1:1287186/1‑140 (MQ=255) tgggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTg > 1:351729/1‑140 (MQ=255) gggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGc < 1:495295/137‑1 (MQ=255) gggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGc > 2:495295/1‑137 (MQ=255) gggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTgg > 2:279827/1‑140 (MQ=255) gggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTgg > 1:1158221/1‑140 (MQ=255) ggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGt > 2:1073576/1‑140 (MQ=255) ggACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGt > 1:541183/1‑140 (MQ=255) aTTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGaaaa > 1:677889/1‑140 (MQ=255) tAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATca < 1:279827/140‑1 (MQ=255) aaGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATcaac < 2:33450/140‑1 (MQ=255) aaGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATcaac < 2:683886/140‑1 (MQ=255) gTCTATATATAGTGCTTCGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATcaacaa < 2:1310395/140‑1 (MQ=255) atatataGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAaac < 2:33884/140‑1 (MQ=255) aGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGGCGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTG‑AAAATCAACAAAAACAACATAc > 1:458184/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACaaa > 1:331713/1‑130 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACaaa < 2:331713/130‑1 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 2:567913/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 2:708026/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 2:741532/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 2:795918/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 1:1159778/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 1:111413/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 2:977367/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 1:647645/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATAc > 1:35963/1‑140 (MQ=255) tGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACt > 1:733484/1‑140 (MQ=255) cTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATcaac < 2:1276344/124‑1 (MQ=255) cTTTGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATcaac > 1:1276344/1‑124 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 2:615380/1‑140 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 1:1223446/1‑140 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 2:784933/1‑140 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 1:674837/1‑140 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 1:1416221/1‑140 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 1:423795/1‑140 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac < 2:351729/140‑1 (MQ=255) tttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgac > 2:20350/1‑140 (MQ=255) ttGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgaca < 1:708026/140‑1 (MQ=255) tGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgacag > 2:531325/1‑140 (MQ=255) tGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgacag > 2:13877/1‑140 (MQ=255) tGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgacag > 2:958023/1‑140 (MQ=255) tGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTga > 2:533718/1‑137 (MQ=255) tGCATCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTga < 1:533718/137‑1 (MQ=255) aTCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgacagaca < 2:677889/140‑1 (MQ=255) aTCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgacagaca < 2:364176/140‑1 (MQ=255) aTCAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTgacagaca < 2:172445/140‑1 (MQ=255) cAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAaac > 2:791538/1‑122 (MQ=255) cAAGGATGTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAaac < 1:791538/122‑1 (MQ=255) gTTTGAGCTTTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTGACAGACAAAACCCCgg > 2:1098308/1‑140 (MQ=255) | TCGCCATCCGCTTATCCACAACGCCGCACCTTTTTCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTCTATATATAGTGCTTTGCATCAAGGATGTTTGAGC‑TTTTTTTGATGTAGCTCAAAGTAAAAAGCAGAGCGTACGGATGACGGGCGCTACAGCGATATGTAAATTTTTTAATGAATTTGCTGGTTGAAAAATCAACAAAAACAACATACTGACAGACAAAACCCCGG > NC_000913/4462753‑4463021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |