| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,138,175 | (G)5→6 | coding (805/942 nt) | flgJ → | putative peptidoglycan hydrolase FlgJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,138,170 | 1 | . | G | 98.8% | 279.0 / ‑3.4 | 81 | coding (800/942 nt) | flgJ | putative peptidoglycan hydrolase FlgJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (34/46); total (35/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
GAAAACGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑GGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACATTGATAAT > NC_000913/1138034‑1138303 | gAAAACGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTCCGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg < 1:980171/140‑1 (MQ=255)gAAAACGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg < 2:1400783/140‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggc < 2:767568/140‑3 (MQ=255) cGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcg > 1:784293/1‑137 (MQ=255) cGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcg > 2:619323/1‑137 (MQ=255) cGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcg > 2:565455/1‑137 (MQ=255) cGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTCCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcg > 1:692594/1‑137 (MQ=255) ggCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgc < 1:619323/140‑5 (MQ=255) ggCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgc < 1:736454/140‑5 (MQ=255) ggCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAACTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgc < 1:1030670/140‑5 (MQ=255) gcgaggcgaaGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgca > 1:43447/1‑135 (MQ=255) gcgaagcgaaGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgca > 1:822571/1‑135 (MQ=255) gcgaagcgaaGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgca > 1:1047842/1‑135 (MQ=255) gaggcgaagAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAgg < 2:43447/137‑1 (MQ=255) gaagcgaagAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAgg < 1:565455/140‑1 (MQ=255) gaagaaAGTAAAAGCGAAGTTCCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTa < 2:692594/140‑1 (MQ=255) agaaAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACa < 2:926504/140‑1 (MQ=255) gTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAGCCGGCGCTCCGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGAcg < 1:548441/140‑1 (MQ=255) gTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGAcg < 1:181830/140‑1 (MQ=255) gTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgca > 2:656758/1‑121 (MQ=255) gTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑ggg‑gggcgca < 1:656758/126‑6 (MQ=255) aaaaGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACa < 1:86163/133‑1 (MQ=255) aaaaGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACa > 2:86163/1‑133 (MQ=255) aaaaGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGAcgcg > 2:981711/1‑140 (MQ=255) aaaGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCgg < 1:1012116/140‑1 (MQ=255) aaGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCggg < 1:1071403/140‑1 (MQ=255) aaGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCggg < 2:1296783/140‑1 (MQ=255) aaGCGAAGTTTCGCGTATACAGCTCGTATGGGGAGGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGGGTAACCGGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCggg < 2:177770/140‑1 (MQ=255) aaGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATg > 1:355070/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATg > 1:933322/1‑140 (MQ=255) aGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGc < 2:1047842/140‑1 (MQ=255) ttCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCAc < 2:933322/140‑1 (MQ=255) gcgTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGa > 2:297516/1‑140 (MQ=255) cgTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGAt < 1:297516/140‑1 (MQ=255) gTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTGGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTACCCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATc < 2:80477/140‑1 (MQ=255) aCAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑Ca < 1:780202/140‑1 (MQ=255) gCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTa < 1:1318194/140‑1 (MQ=255) tATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGccc > 2:575649/1‑140 (MQ=255) aTCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACTCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCg > 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gAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTAt < 2:51834/130‑1 (MQ=255) gCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTa < 2:515601/126‑1 (MQ=255) gCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTa > 1:515601/1‑126 (MQ=255) gCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCa > 1:78862/1‑140 (MQ=255) ccTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCAc < 2:78862/140‑1 (MQ=255) ccTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCAc < 2:590287/140‑1 (MQ=255) ccTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCAc > 1:329396/1‑140 (MQ=255) cTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGTCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCTCACACTATGCCCGCAAACTCa > 2:678884/1‑140 (MQ=255) cTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCAcc > 1:856962/1‑140 (MQ=255) ggATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGTCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCTCACACTATGCCCGCAAACTCACCAACa < 1:678884/140‑1 (MQ=255) ttACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGAtt < 2:556168/140‑1 (MQ=255) aCGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTca > 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(MQ=255) gcgTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATa > 2:850404/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCg < 1:850404/140‑1 (MQ=255) aCCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGa > 2:114629/1‑140 (MQ=255) aCCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGa > 2:10337/1‑140 (MQ=255) aCCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGa > 2:336387/1‑140 (MQ=255) cccGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGAc < 1:1172489/140‑1 (MQ=255) cgcTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAgg > 2:551066/1‑140 (MQ=255) cgcTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAgg < 2:871053/140‑1 (MQ=255) cgcTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAgg > 1:700125/1‑140 (MQ=255) cgccgcCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGc < 2:700125/140‑1 (MQ=255) gccgccGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCa < 2:1291168/140‑1 (MQ=255) ccgTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCa < 1:927677/136‑1 (MQ=255) ccgTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCa > 2:927677/1‑136 (MQ=255) ccgTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAAc > 1:313074/1‑140 (MQ=255) gTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCt < 2:409087/140‑1 (MQ=255) tGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTa < 1:551066/140‑1 (MQ=255) gacCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGt < 2:753038/140‑1 (MQ=255) acCGCCGCGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTa < 1:1192066/140‑1 (MQ=255) cgccgcGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCaa < 1:1124060/127‑1 (MQ=255) cgccgcGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCaa > 2:1124060/1‑127 (MQ=255) cgccgcGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATg > 1:756471/1‑140 (MQ=255) ccgcGAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGaa < 2:856962/140‑1 (MQ=255) cgcgAGTGCGGAACA‑GGGTGGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAAc > 1:1378361/1‑140 (MQ=255) cgAGTGTGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACAt < 2:800135/140‑1 (MQ=255) cgAGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACAt > 1:779857/1‑140 (MQ=255) aGTGCGGAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACATTg < 2:651214/140‑1 (MQ=255) ggAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACATTGATAAt < 2:313074/140‑1 (MQ=255) ggAACAGGGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACATTGATAAt < 1:575649/140‑1 (MQ=255) | GAAAACGGCGAAGCGAAGAAAGTAAAAGCGAAGTTTCGCGTCTACAGCTCGTATCTGGAAGCCTTGTCGGATTACGTTGGGCTGTTAACGCGTAACCCGCGCTACGCCGCCGTGACGACCGCCGCGAGTGCGGAACA‑GGG‑GGCGCAGGCCCTACAGGACGCGGGCTATGCCACCGATCCT‑‑CACTATGCCCGCAAACTCACCAACATGATTCAGCAGATGAAATCGATAAGCGACAAGGTGAGCAAAACCTACAGTATGAACATTGATAAT > NC_000913/1138034‑1138303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |