Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,894,349 | (A)8→9 | coding (217/300 nt) | yoaC → | DUF1889 domain‑containing protein YoaC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,894,341 | 1 | . | A | 98.8% | 292.1 / ‑3.8 | 83 | coding (209/300 nt) | yoaC | DUF1889 domain‑containing protein YoaC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base A (36/46); total (36/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 |
CGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAT > NC_000913/1894203‑1894474 | cGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑a > 1:813411/1‑140 (MQ=255) tgaaAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑aaaaaaaa > 1:819587/1‑140 (MQ=255) gaaAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑aaaaaaaaa > 1:452067/1‑139 (MQ=255) aaaGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑aaaaaaaaat < 1:820363/140‑3 (MQ=255) aGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑aaaaaaaaatgg > 1:259063/1‑136 (MQ=255) gCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑aaaaaaaaatgga < 1:266212/140‑6 (MQ=255) cACGGCGAAGGGGATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGgag < 1:515112/140‑1 (MQ=255) cACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGgag > 1:1432189/1‑140 (MQ=255) aCGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGgaga < 2:759510/140‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGgaga < 2:813411/140‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGgaga < 2:1081259/140‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGgaga < 2:259063/140‑1 (MQ=255) cGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAgg > 1:978843/1‑140 (MQ=255) cGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAgg > 1:1423296/1‑140 (MQ=255) cGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAgg < 1:1199745/140‑1 (MQ=255) aaGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTg > 1:169133/1‑140 (MQ=255) aTCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGtt < 1:1095111/140‑1 (MQ=255) aTCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGtt < 1:712633/140‑1 (MQ=255) tttAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCtg < 2:1432189/140‑1 (MQ=255) tttAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTaaa > 1:276692/1‑140 (MQ=255) ttAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAAc < 2:1227721/125‑1 (MQ=255) ttAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAAc > 1:1227721/1‑125 (MQ=255) ttAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTaaaa > 2:904453/1‑140 (MQ=255) ttAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTaaaa < 1:3614/140‑1 (MQ=255) tAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTaaaaa > 1:1460673/1‑140 (MQ=255) tAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTaaaaa > 2:515410/1‑140 (MQ=255) tAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTaaaaa > 1:1058772/1‑140 (MQ=255) aGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACttt > 1:498358/1‑140 (MQ=255) gTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACtttt < 1:294559/140‑1 (MQ=255) tACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc < 2:169133/140‑1 (MQ=255) tACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc > 1:1066698/1‑140 (MQ=255) tACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc < 2:1066698/140‑1 (MQ=255) tACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc < 1:1411842/140‑1 (MQ=255) aCCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCATGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCa > 1:124555/1‑140 (MQ=255) aCCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc < 1:1150606/139‑1 (MQ=255) aCCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc > 2:1150606/1‑139 (MQ=255) cccGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCaa < 2:667582/140‑1 (MQ=255) ccGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAAc > 1:1378986/1‑140 (MQ=255) cgAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACata > 2:599670/1‑140 (MQ=255) gAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACatat > 2:181376/1‑140 (MQ=255) gAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACatat > 2:1235917/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCAAAAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACatatat > 2:980461/1‑140 (MQ=255) ccGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCa > 1:381657/1‑140 (MQ=255) ccGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCa > 2:983869/1‑140 (MQ=255) cGCTGATATTACGGCGCGAGCTAACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAg > 2:1196798/1‑140 (MQ=255) gCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAgg < 2:452067/140‑1 (MQ=255) gCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAgg < 2:276692/140‑1 (MQ=255) gCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAgg < 1:181376/140‑1 (MQ=255) cTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc > 2:637811/1‑125 (MQ=255) cTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTc < 1:637811/125‑1 (MQ=255) atatTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGTAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGgaaga < 1:1346203/140‑1 (MQ=255) tACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTaa < 2:819587/140‑1 (MQ=255) aCGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGAGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTaa > 1:1097875/1‑140 (MQ=255) gcgcGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCATGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAg > 1:155306/1‑140 (MQ=255) gcgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCATGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCa < 2:155306/140‑1 (MQ=255) gcgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCa < 2:1097875/140‑1 (MQ=255) gcgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGCTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCa > 1:73266/1‑140 (MQ=255) gcgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTGCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGTATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCa < 2:1298878/140‑1 (MQ=255) cgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCa > 1:998023/1‑139 (MQ=255) cgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCa < 2:998023/139‑1 (MQ=255) cgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCAc > 1:1068879/1‑140 (MQ=255) cgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCAc > 1:1181221/1‑140 (MQ=255) cgAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCAc > 1:838350/1‑140 (MQ=255) cTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCATGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGt < 2:124555/140‑1 (MQ=255) cTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGt < 1:23993/140‑1 (MQ=255) ggAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGtt < 1:781762/140‑1 (MQ=255) ggAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGtt < 1:1167484/140‑1 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2:1324450/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCa > 2:216324/1‑140 (MQ=255) ttCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATaaa < 1:216324/140‑1 (MQ=255) ttCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATaaa < 2:501546/140‑1 (MQ=255) tCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTatat > 1:831308/1‑130 (MQ=255) tCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTatat < 2:831308/130‑1 (MQ=255) cACGGAAAAAATGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATg < 1:599670/140‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCa > 2:506615/1‑140 (MQ=255) aaaaaTGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAg < 1:983869/140‑1 (MQ=255) aaaTGGTTGGATGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGa < 2:381657/140‑1 (MQ=255) aaTGGTTGGATGGGCAAAAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGa < 1:980461/140‑1 (MQ=255) aTGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAt < 1:814265/140‑1 (MQ=255) aTGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAt < 2:1068879/140‑1 (MQ=255) aTGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAt < 2:978843/140‑1 (MQ=255) aTGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAt < 2:1068899/140‑1 (MQ=255) aTGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAt < 1:1337011/140‑1 (MQ=255) aTGGGCA‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAt < 1:1235917/140‑1 (MQ=255) | CGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGAACTGGGAGTACCCGCGAGTGCCGCTGATATTACGGCGCGAGCTGACCAGGAAGGCTGGAACCCTGGGTTCACGGAAAAAATGGTTGGATGGGC‑‑AAAAAAAATGGAGACAGGTGAACGTTCTGTGATTAAAAATCCTGAATACTTTTCAACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAAT > NC_000913/1894203‑1894474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |