| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,116,287 | G→A | S942S (AGC→AGT) | yghJ ← | putative lipoprotein YghJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,116,287 | 0 | G | A | 97.8% | 307.0 / ‑3.8 | 89 | S942S (AGC→AGT) | yghJ | putative lipoprotein YghJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (46/41); minor base T (1/1); total (47/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCATCATTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGT > NC_000913/3116150‑3116421 | gCATCATTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACact > 2:945695/1‑140 (MQ=255)gCATCATTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACact > 2:566775/1‑140 (MQ=255) atcatTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACactgc > 1:868148/1‑140 (MQ=255) atTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCa > 2:753612/1‑140 (MQ=255) atTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCa > 2:306585/1‑140 (MQ=255) ttGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAg < 1:306585/140‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAg > 1:213311/1‑140 (MQ=255) ggCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGAc < 1:945695/140‑1 (MQ=255) gTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCt < 2:945714/140‑1 (MQ=255) gCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCAc > 1:1006391/1‑140 (MQ=255) cAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCAcc > 1:371473/1‑140 (MQ=255) cAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGc < 2:1006391/140‑1 (MQ=255) cAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGc > 1:296151/1‑140 (MQ=255) gAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGAc > 2:12746/1‑140 (MQ=255) cTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCAt < 1:683336/140‑1 (MQ=255) cTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCAt < 1:12746/140‑1 (MQ=255) tCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCAtt < 2:550440/140‑1 (MQ=255) cGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTg > 1:787554/1‑140 (MQ=255) cGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTg > 1:736106/1‑140 (MQ=255) ggTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTgg > 1:860404/1‑140 (MQ=255) aaCGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCg < 2:213311/140‑1 (MQ=255) aaCGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCg < 2:860404/140‑1 (MQ=255) aCGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCgg < 1:363128/140‑1 (MQ=255) ttAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTa > 2:572703/1‑140 (MQ=255) aaGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTagag < 1:919135/140‑1 (MQ=255) aaGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTagag < 2:367718/140‑1 (MQ=255) gCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCt < 1:566775/140‑1 (MQ=255) cccAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTc > 1:383002/1‑140 (MQ=255) ccAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCgg > 1:859410/1‑128 (MQ=255) ccAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCgg < 2:859410/128‑1 (MQ=255) cTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCt < 2:383002/140‑1 (MQ=255) ttttGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGa < 1:753612/140‑1 (MQ=255) gCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCt < 2:787554/140‑1 (MQ=255) ccTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTg > 2:234602/1‑140 (MQ=255) ttcATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGt < 2:217241/140‑1 (MQ=255) tAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACTCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaa > 1:156564/1‑140 (MQ=255) tAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCTTaa > 2:10527/1‑140 (MQ=255) tAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaa > 1:265657/1‑140 (MQ=255) tAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaa > 1:559396/1‑140 (MQ=255) cTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTg > 1:616132/1‑129 (MQ=255) cTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTg < 2:616132/129‑1 (MQ=255) cTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATc > 2:917168/1‑140 (MQ=255) tCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACTCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATcc < 2:156564/140‑1 (MQ=255) cGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCg < 1:572703/140‑1 (MQ=255) aTCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAg > 1:501729/1‑140 (MQ=255) ttCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTg > 1:607709/1‑140 (MQ=255) ttCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTg > 1:126215/1‑140 (MQ=255) ttCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTg > 2:893221/1‑140 (MQ=255) caGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCa > 2:107545/1‑140 (MQ=255) aGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCAt > 1:785827/1‑140 (MQ=255) ccAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCg > 2:785128/1‑140 (MQ=255) aGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCt > 1:820266/1‑140 (MQ=255) aCCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCttt > 1:3416/1‑140 (MQ=255) ccGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtttt > 1:1004624/1‑140 (MQ=255) aCATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCa > 2:291925/1‑140 (MQ=255) cATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAg > 1:246529/1‑140 (MQ=255) ttCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTc > 2:413368/1‑140 (MQ=255) gTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGt > 1:146333/1‑140 (MQ=255) gTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGt < 2:868148/140‑1 (MQ=255) gTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGt > 1:1017177/1‑140 (MQ=255) gTACAGACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGt > 1:93894/1‑140 (MQ=255) gACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgtgt > 1:856513/1‑129 (MQ=255) gACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgtgt < 2:856513/129‑1 (MQ=255) gACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAgg > 1:660557/1‑140 (MQ=255) gACGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAgg > 2:934089/1‑140 (MQ=255) aCGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGc > 1:609290/1‑140 (MQ=255) aCGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGc > 2:741991/1‑140 (MQ=255) aCGTTCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGc > 1:662584/1‑140 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:660557/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:126215/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 1:291925/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:607709/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:1004624/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:136278/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:1017177/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 1:934089/140‑1 (MQ=255) ttCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:371473/140‑1 (MQ=255) tCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa > 1:879751/1‑139 (MQ=255) tCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:879751/139‑1 (MQ=255) tCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAg < 1:917168/140‑1 (MQ=255) tCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAg < 2:3416/140‑1 (MQ=255) tCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAg > 1:32645/1‑140 (MQ=255) tCCAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAg > 2:479877/1‑140 (MQ=255) ccAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa > 1:154891/1‑138 (MQ=255) ccAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:154891/138‑1 (MQ=255) ccAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGt < 2:736106/140‑1 (MQ=255) ccAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGt < 1:484701/140‑1 (MQ=255) cAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGtt < 2:785827/140‑1 (MQ=255) cAGATCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGtt < 1:413368/140‑1 (MQ=255) tCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGTGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt < 2:26200/140‑1 (MQ=255) tCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa > 1:122423/1‑133 (MQ=255) tCGACACTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTa < 2:122423/133‑1 (MQ=255) | GCATCATTGGCGTAGCAGTTCAGGAACTCGGTGAACGTTTTAAAGCCCAGCTCGTCATTTTTGCCTTCTTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGT > NC_000913/3116150‑3116421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |