| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,537,490 | A→G | D35D (GAT→GAC) | nanS ← | N‑acetyl‑9‑O‑acetylneuraminate esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,537,490 | 0 | A | G | 98.7% | 253.8 / ‑5.1 | 77 | D35D (GAT→GAC) | nanS | N‑acetyl‑9‑O‑acetylneuraminate esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (40/36); total (41/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
GGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAAT > NC_000913/4537357‑4537623 | ggTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTcc < 1:368029/140‑1 (MQ=255) tAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTc > 2:729267/1‑140 (MQ=255) aaCCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTcc > 1:617444/1‑134 (MQ=255) aaCCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTcc < 2:617444/134‑1 (MQ=255) aCCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCg > 1:335584/1‑140 (MQ=255) ccTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGt < 1:923404/140‑1 (MQ=255) ccTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGt > 1:967697/1‑140 (MQ=255) tGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTaa > 2:672725/1‑140 (MQ=255) gCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAAt > 2:575868/1‑140 (MQ=255) atatCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATgg > 2:926823/1‑140 (MQ=255) ccTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGt > 1:519341/1‑140 (MQ=255) cTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTc > 1:872936/1‑140 (MQ=255) aaCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCtt < 2:90133/140‑1 (MQ=255) aCATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTc > 2:667142/1‑140 (MQ=255) tCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGcc > 2:541314/1‑140 (MQ=255) tCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTAAGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGcc > 2:291172/1‑140 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCtt < 2:158297/135‑1 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCtt > 1:158297/1‑135 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCa > 2:48118/1‑140 (MQ=255) cGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCa > 1:890453/1‑140 (MQ=255) gtgtGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCAt < 2:335584/140‑1 (MQ=255) gtgtGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCAt > 1:154949/1‑140 (MQ=255) tgtgGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATa > 1:512392/1‑140 (MQ=255) ggCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGcc > 2:80776/1‑140 (MQ=255) gCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:575868/140‑1 (MQ=255) gTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCa < 1:679666/137‑1 (MQ=255) gTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCa > 2:679666/1‑137 (MQ=255) tGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGc > 1:836391/1‑140 (MQ=255) tGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGc > 1:394953/1‑140 (MQ=255) gAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCa > 1:373939/1‑140 (MQ=255) aGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGa > 1:807286/1‑140 (MQ=255) aGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGa < 2:646739/140‑1 (MQ=255) aGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGa < 1:353320/140‑1 (MQ=255) gAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGa > 1:887033/1‑140 (MQ=255) gAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGa < 2:154949/140‑1 (MQ=255) ataatGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGAcc > 1:826752/1‑140 (MQ=255) taatGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCa < 1:48118/140‑1 (MQ=255) tGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 1:491606/140‑1 (MQ=255) tGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 2:967697/140‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa > 2:677995/1‑138 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 1:677995/138‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAAc > 2:864789/1‑140 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAAc < 2:519341/140‑1 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAAc > 2:545875/1‑140 (MQ=255) tCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAAc > 1:567063/1‑140 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACggg > 2:710887/1‑139 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGt > 2:307355/1‑140 (MQ=255) ttAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGt < 1:307355/140‑1 (MQ=255) aaaGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTaa > 2:373181/1‑140 (MQ=255) aaaGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTaa < 2:807286/140‑1 (MQ=255) aaGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAg < 1:541314/140‑1 (MQ=255) gTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGaa < 2:909062/140‑1 (MQ=255) tGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAAc < 1:672725/140‑1 (MQ=255) tGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAAc < 2:198871/140‑1 (MQ=255) tGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAAc < 1:864789/140‑1 (MQ=255) tGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAAc < 2:394953/140‑1 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa < 2:127068/126‑1 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCa > 1:127068/1‑126 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGt < 1:165146/131‑1 (MQ=255) cATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGAAGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGt > 2:165146/1‑131 (MQ=255) gCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGtaa > 2:760978/1‑140 (MQ=255) ccGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 1:926823/140‑1 (MQ=255) ccGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 1:729267/140‑1 (MQ=255) ccGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 2:402928/140‑1 (MQ=255) ggATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGa > 2:466543/1‑140 (MQ=255) ggATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCCTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACACCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGa > 2:73761/1‑140 (MQ=255) tGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCg > 1:565740/1‑132 (MQ=255) tGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCg < 2:565740/132‑1 (MQ=255) tGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg < 1:493616/128‑1 (MQ=255) tGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCggg > 2:493616/1‑128 (MQ=255) gcgcAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCg < 2:744862/140‑1 (MQ=255) gcgcAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCg < 2:872936/140‑1 (MQ=255) gcgcAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCg < 2:512392/140‑1 (MQ=255) gcgcAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCg < 1:466543/140‑1 (MQ=255) aGGCGCGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAAt > 2:883360/1‑140 (MQ=255) gcgcGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGaa > 2:572920/1‑129 (MQ=255) gcgcGTCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGaa < 1:572920/129‑1 (MQ=255) | GGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAAT > NC_000913/4537357‑4537623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |