| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 396,911 | T→C | T91T (ACT→ACC) | sbmA → | peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 396,911 | 0 | T | C | 98.0% | 173.9 / ‑5.1 | 51 | T91T (ACT→ACC) | sbmA | peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (27/23); total (28/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGATTAGCGCCGCGCGTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACTGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAATTTTACCG > NC_000913/396775‑397045 | cGATTAGCGCCGCGCGTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCa < 1:744952/140‑1 (MQ=255) gATTAGCGCCGCGCGTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCAc < 1:934180/140‑1 (MQ=255) aTTAGCGCCGCGCGTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACt > 1:749950/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCGCGTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGatc < 2:120938/140‑1 (MQ=255) gcgcgTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCtt < 2:654247/140‑1 (MQ=255) tGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTtg > 2:160201/1‑140 (MQ=255) gATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTtggt < 2:118435/140‑1 (MQ=255) aTTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTtggtg < 1:322744/140‑1 (MQ=255) tttttACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCgggg > 1:87236/1‑140 (MQ=255) ttttACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGt < 2:232851/140‑1 (MQ=255) cTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTc < 1:618596/140‑1 (MQ=255) ttGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTgg > 1:54042/1‑140 (MQ=255) ttGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTgg > 1:583711/1‑140 (MQ=255) gTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTTGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTa > 2:396960/1‑140 (MQ=255) gTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTa > 1:216002/1‑140 (MQ=255) gTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTa > 1:172448/1‑140 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCa < 1:869402/128‑1 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCa > 2:869402/1‑128 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGc < 2:375457/132‑1 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGc > 1:375457/1‑132 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATg > 2:977600/1‑140 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATg < 2:54042/140‑1 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATg < 2:583711/140‑1 (MQ=255) ttGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATg > 1:886674/1‑140 (MQ=255) tGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATgc > 2:722278/1‑140 (MQ=255) gCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATgcg < 1:1019720/140‑1 (MQ=255) gCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATgcg < 1:722278/140‑1 (MQ=255) gTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGcc < 2:893152/140‑1 (MQ=255) ggACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGtt < 1:160201/140‑1 (MQ=255) ggTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAAcc < 1:977600/140‑1 (MQ=255) tCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACTGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTGTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGCTTCAAACGgcgcga > 2:50925/1‑138 (MQ=255) tCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTa > 1:324154/1‑140 (MQ=255) aGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTc < 2:216002/140‑1 (MQ=255) aGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTc > 2:835929/1‑140 (MQ=255) gCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTcg > 1:650290/1‑140 (MQ=255) cATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCa > 1:591952/1‑140 (MQ=255) cGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCt > 2:531409/1‑125 (MQ=255) cGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCt < 1:531409/125‑1 (MQ=255) aTACTGGTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCa > 2:428992/1‑140 (MQ=255) ggTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGaa < 2:749950/140‑1 (MQ=255) gTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGt > 2:480849/1‑129 (MQ=255) gTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGt < 1:480849/129‑1 (MQ=255) gTCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAAc > 2:559963/1‑140 (MQ=255) tCAATACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACa > 1:38474/1‑140 (MQ=255) tACTCGGTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAAttt > 1:796320/1‑140 (MQ=255) ggTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAATTTTACcg > 2:593338/1‑140 (MQ=255) ggTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAATTTTACcg > 1:248284/1‑140 (MQ=255) ggTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAATTTTACcg < 1:396960/140‑1 (MQ=255) ggTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAATTTTACcg > 2:832422/1‑140 (MQ=255) gTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGaa > 2:926417/1‑128 (MQ=255) gTACCGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGaa < 1:926417/128‑1 (MQ=255) | CGATTAGCGCCGCGCGTTTCTGGTCGTTGGATTTCCTGATTTTTTACGCTTACTACATTGTTTGCGTAGGACTTTTTGCATTGTTCTGGTTTATCTACAGCCCGCATCGTTGGCAATACTGGTCAATACTCGGTACTGCACTGATCATCTTCGTCACCTGGTTTTTGGTGGAAGTCGGGGTCGCCGTCAACGCCTGGTATGCGCCGTTCTATGATCTGATTCAAACCGCGCTAAGTTCGCCGCATAAAGTCACCATCGAACAATTTTACCG > NC_000913/396775‑397045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |