| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,661,656 | T→C | K159R (AAG→AGG) | iscR ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator IscR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,661,656 | 0 | T | C | 98.8% | 289.0 / ‑4.8 | 82 | K159R (AAG→AGG) | iscR | DNA‑binding transcriptional dual regulator IscR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (45/36); total (46/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAATTTCATTGCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACTTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGG > NC_000913/2661523‑2661787 | tAATTTCATTGCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGt > 1:226273/1‑140 (MQ=255)tAATTTCATTGCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGt > 1:507756/1‑140 (MQ=255) aTTTCATTGCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCg < 1:797093/140‑1 (MQ=255) tttCATTGCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACTTAACGTCGa > 2:699325/1‑140 (MQ=255) gCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTc < 2:477772/140‑1 (MQ=255) gCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTc < 2:557549/140‑1 (MQ=255) tataAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGTCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTc < 2:43535/136‑1 (MQ=255) tataAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGTCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTc > 1:43535/1‑136 (MQ=255) tataAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTtgt > 1:68212/1‑140 (MQ=255) taAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGAt < 1:533711/128‑1 (MQ=255) taAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGAt > 2:533711/1‑128 (MQ=255) taAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTtgtgt > 2:623428/1‑140 (MQ=255) taAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTtgtgt > 1:423572/1‑140 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCggg > 2:252829/1‑140 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCggg > 1:331451/1‑140 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCggg > 2:413958/1‑140 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCggg > 2:907883/1‑140 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCggg > 1:980124/1‑140 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCg < 2:495577/138‑1 (MQ=255) tCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCg > 1:495577/1‑138 (MQ=255) ccGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCtt < 1:470362/130‑1 (MQ=255) ccGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCtt > 2:470362/1‑130 (MQ=255) ccGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGt > 1:636782/1‑140 (MQ=255) cGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTg > 2:560222/1‑140 (MQ=255) cGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTg > 1:69169/1‑140 (MQ=255) gTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGc > 2:185307/1‑140 (MQ=255) gTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGc > 1:31837/1‑140 (MQ=255) gTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGAGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGc > 2:434031/1‑140 (MQ=255) aCATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGt < 1:623428/140‑1 (MQ=255) aCATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGt > 2:437916/1‑140 (MQ=255) aCATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGt > 1:533118/1‑140 (MQ=255) aCATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGt > 1:878657/1‑140 (MQ=255) aCATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGt > 1:235434/1‑140 (MQ=255) aTCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTgg < 2:31837/140‑1 (MQ=255) cACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGgcg < 2:423572/140‑1 (MQ=255) cTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGcgcg > 2:286897/1‑140 (MQ=255) tCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGcgt < 1:185307/140‑1 (MQ=255) tCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGcgt < 2:980124/140‑1 (MQ=255) aTGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGcgtcgt < 2:235434/140‑1 (MQ=255) tGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTg > 1:279939/1‑140 (MQ=255) aaGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGt < 2:226273/140‑1 (MQ=255) aaGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGt < 2:533118/140‑1 (MQ=255) cAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGgcgc < 2:944592/124‑1 (MQ=255) cAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGgcgc > 1:944592/1‑124 (MQ=255) cAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGt < 2:294355/133‑1 (MQ=255) cAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGt > 1:294355/1‑133 (MQ=255) ggCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTgacg > 2:887022/1‑140 (MQ=255) ccGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAg > 1:136005/1‑140 (MQ=255) ccGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAg < 2:68212/140‑1 (MQ=255) ccGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAg > 2:537077/1‑140 (MQ=255) ccGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAg > 2:529009/1‑140 (MQ=255) ccGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAg > 2:435255/1‑140 (MQ=255) cGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGa < 1:907883/140‑1 (MQ=255) ggCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGac < 2:643934/140‑1 (MQ=255) ggCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGac < 2:331451/140‑1 (MQ=255) gCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGaca > 1:21602/1‑140 (MQ=255) ggATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACAt > 2:564460/1‑140 (MQ=255) aCGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCa < 1:537077/140‑1 (MQ=255) gtgtTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCt < 1:413958/140‑1 (MQ=255) tgtTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTg > 2:401781/1‑140 (MQ=255) ggAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCt > 1:69524/1‑132 (MQ=255) ggAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCt < 2:69524/132‑1 (MQ=255) aTTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAg < 2:21602/140‑1 (MQ=255) tttAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGt < 1:549771/140‑1 (MQ=255) gCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGAGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGc < 1:434031/140‑1 (MQ=255) cTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTa < 1:280480/140‑1 (MQ=255) cGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAg > 2:352779/1‑140 (MQ=255) cGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAg > 1:111747/1‑140 (MQ=255) cGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAg > 2:441651/1‑140 (MQ=255) ccTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTaa > 2:423647/1‑140 (MQ=255) aaTTCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTgag > 2:693139/1‑140 (MQ=255) ttCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGaa < 1:435255/140‑1 (MQ=255) tCTTTTTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGaaa < 2:111747/140‑1 (MQ=255) tCTTATTATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGaaa < 2:937189/140‑1 (MQ=255) tttttATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTa < 1:943044/124‑1 (MQ=255) tttttATTAAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTa > 2:943044/1‑124 (MQ=255) attaAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTg > 2:333261/1‑140 (MQ=255) ttaAGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTga < 2:279939/140‑1 (MQ=255) aGCGCGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGAc < 2:507756/140‑1 (MQ=255) gcgcGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACg > 1:615396/1‑140 (MQ=255) gcgcGTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACg < 1:887022/140‑1 (MQ=255) cgcgTAACCTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACgg < 1:529009/140‑1 (MQ=255) | TAATTTCATTGCTCTATAAACTCCGTACATCACTCAATGCAAGGAATCAGGCTACCGGCTGGATGTACGACCGTGTTTACGGAGTATTTAGCACTCCGGCCTGATTCTGAATTCTTTTTATTAAGCGCGTAACTTAACGTCGATCGCGTCTTGTGTGCGGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGG > NC_000913/2661523‑2661787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |