| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 144,096 | Δ2 bp | coding (395‑396/771 nt) | yadH → | putative ABC transporter membrane subunit YadH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 144,094 | 0 | T | . | 100.0% | 211.9 / NA | 51 | coding (393/771 nt) | yadH | putative ABC transporter membrane subunit YadH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (26/25); total (26/25) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 144,095 | 0 | G | . | 100.0% | 211.9 / NA | 51 | coding (394/771 nt) | yadH | putative ABC transporter membrane subunit YadH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (26/25); total (26/25) | |||||||||||
GTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGTTTGCTGAACGGTGTGTTTGCCAAAACGTTCGATGACATCAGCCTGGTGCCAACCTT > NC_000913/143955‑144228 || gTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGtttttt < 1:1000263/140‑1 (MQ=255) gCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTtgc > 1:149340/1‑139 (MQ=255) gCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTtgc < 2:1051779/140‑2 (MQ=255) gCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGAATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTtgc < 2:838018/140‑2 (MQ=255) 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2:119309/1‑140 (MQ=255) agagCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTa < 2:435827/140‑1 (MQ=255) agCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTAtt > 2:737189/1‑140 (MQ=255) ctgctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCg > 2:954448/1‑140 (MQ=255) ctgctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCg > 1:181441/1‑140 (MQ=255) ctgctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCg < 1:896044/140‑1 (MQ=255) 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1:19092/1‑140 (MQ=255) tgtttgttGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGTTTGCTGAACGGTGTGTTTGCCaa < 2:296435/140‑1 (MQ=255) gttgGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGTTTGCTGAACGGTGTGTTTGCCAAAACGt < 2:523090/140‑1 (MQ=255) ttgGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCCTGCGGGTTTGCTGAACGGGGTGTTTTCCCAAACgct > 1:123866/1‑138 (MQ=255) ggCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTTCGGGGTTGCTGAACGGTGTGTTTTCCAAAAAGTTCg > 2:343842/1‑140 (MQ=255) ggCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTT‑‑TGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGGTTTCTTGACGGGGTGTTTTCCAAAAAGTTCg > 2:198060/1‑140 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |