Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,923,012 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑572/+42) | atpI ← / ← rsmG | ATP synthase accessory factor/16S rRNA m(7)G527 methyltransferase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 71 (1.060) | 47/274 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3923015 | 0 (0.000) | intergenic (‑575/+42) | atpI/rsmG | ATP synthase accessory factor/16S rRNA m(7)G527 methyltransferase | |||||
* | ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | 38 (0.570) | 29/274 | 1.3 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 3923012 = | 0 (0.000) | intergenic (‑572/+45) | atpI/rsmG | ATP synthase accessory factor/16S rRNA m(7)G527 methyltransferase |
TAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3652171‑3652036 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAC > NC_000913/3923012‑3923137 TAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAA < 2:168527/140‑1 CTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCT > 2:766717/1‑140 GCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTC > 2:283944/1‑140 CTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGAT < 2:175005/140‑1 GGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTG > 1:1133480/1‑140 CTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGAT > 1:682455/1‑140 CTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGAT > 1:720979/1‑140 GATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAA > 2:869886/1‑140 GATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAAAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAA > 1:787752/1‑140 GGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAA > 2:886671/1‑140 TTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTT > 1:726158/1‑140 TACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTA > 2:1093487/1‑140 GGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTG < 2:682455/140‑1 AGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCT < 1:1093487/140‑1 ATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCA > 1:666851/1‑140 CTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACC > 1:999667/1‑140 AAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGA < 2:726158/140‑1 AAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGA < 1:515160/140‑1 GAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCG < 2:186431/140‑1 GAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATCTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCG < 1:283944/140‑1 GAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAAAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCG < 2:787752/140‑1 ACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGC > 1:18248/1‑140 AGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCA > 1:899158/1‑132 AGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCA < 2:899158/132‑1 CCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGA > 2:608431/1‑140 GAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTT > 1:68882/1‑140 GAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTT > 1:743417/1‑140 TTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCA > 2:616085/1‑140 TTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCA < 2:666851/140‑1 CCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGAT > 2:826840/1‑140 CGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATT > 2:714475/1‑140 CTTATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCG > 1:593042/1‑140 TATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAC < 1:714475/140‑1 TATTCGCACCTTCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTCTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAC < 2:999667/140‑1 TCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAC > 2:1106029/1‑129 TCCTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAC < 1:1106029/129‑1 CTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCG > 2:265537/1‑125 CTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCG < 1:265537/125‑1 TAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3652171‑3652036 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAC > NC_000913/3923012‑3923137 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |