Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,027,458 | T→C | V113A (GTT→GCT) | ghxQ → | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,027,458 | 0 | T | C | 98.7% | 250.1 / ‑6.3 | 78 | V113A (GTT→GCT) | ghxQ | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (38/39); total (38/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTT > NC_000913/3027321‑3027593 | tgttgCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTc < 2:449667/140‑1 (MQ=255) gttgCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTcc > 2:1090146/1‑140 (MQ=255) cACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCg > 1:68309/1‑140 (MQ=255) ccTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCa > 2:1277134/1‑140 (MQ=255) ccTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGAGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCa < 1:1367740/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGgcg < 1:816079/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGgcg < 1:606860/140‑1 (MQ=255) gTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGgcgc < 1:1090146/140‑1 (MQ=255) gTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGgcgc < 1:646492/140‑1 (MQ=255) gTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGgcgc < 1:1281295/140‑1 (MQ=255) gTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTCCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGgcgc < 1:598929/140‑1 (MQ=255) cgcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCgg < 1:1255577/140‑1 (MQ=255) cgcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCgg < 2:1307138/140‑1 (MQ=255) gcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGcgcg < 2:162955/138‑1 (MQ=255) gcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGcgcg > 1:162955/1‑138 (MQ=255) gcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGt > 1:1532432/1‑140 (MQ=255) gcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGt > 1:743856/1‑140 (MQ=255) gcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGt > 1:1177357/1‑140 (MQ=255) gggCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTAt > 1:1079510/1‑140 (MQ=255) tCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTg > 1:255009/1‑140 (MQ=255) gTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCg > 1:464676/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGAt > 1:766330/1‑134 (MQ=255) ttGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGAt < 2:766330/134‑1 (MQ=255) tGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTc < 1:313338/140‑1 (MQ=255) cTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCAt < 1:817467/140‑1 (MQ=255) tGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTc < 1:1172585/140‑1 (MQ=255) tATGGGTTAATTTGGCAATGGCGATTGTTTGCGCGAGTTCCTTTAGGGCGTTTACCGCATTGAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGGGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCTCCGcc < 2:1283332/140‑1 (MQ=255) tATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGcc < 1:1355452/140‑1 (MQ=255) tATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGcc < 1:114645/140‑1 (MQ=255) tATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGcc < 1:538727/140‑1 (MQ=255) gggCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCa < 2:645573/132‑1 (MQ=255) gggCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCa > 1:645573/1‑132 (MQ=255) gggCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCAtt > 1:1103587/1‑140 (MQ=255) gggCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCAtt < 1:1277134/140‑1 (MQ=255) aaTTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGt > 2:1483475/1‑140 (MQ=255) aTTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTa > 1:943769/1‑140 (MQ=255) tGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAAcc > 2:109971/1‑140 (MQ=255) cAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGgt > 1:245574/1‑140 (MQ=255) tGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGtgtg < 2:943769/140‑1 (MQ=255) gggCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCTTTTCCCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACGGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGtgtg < 2:743856/139‑1 (MQ=255) ggCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAAc > 1:1056167/1‑132 (MQ=255) ggCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAAc < 2:1056167/132‑1 (MQ=255) ggCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGc > 1:1450040/1‑140 (MQ=255) gCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTTTTTCTGATGGGCGTCTTCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCg < 2:68309/140‑1 (MQ=255) gTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTgg < 1:109971/140‑1 (MQ=255) tGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGAt > 1:1445360/1‑140 (MQ=255) tGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGAt < 2:464676/140‑1 (MQ=255) gcgcGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATc > 1:421106/1‑140 (MQ=255) gcgcGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATc > 2:436934/1‑140 (MQ=255) cgATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTa > 2:1023284/1‑140 (MQ=255) cgATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTa > 2:1216375/1‑140 (MQ=255) aCGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGcc > 1:1121950/1‑140 (MQ=255) gCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGAt < 1:1216375/140‑1 (MQ=255) cGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATg > 1:469042/1‑140 (MQ=255) cATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt < 1:1483475/140‑1 (MQ=255) aTTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTc > 2:1220540/1‑140 (MQ=255) ttCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCa < 2:421106/140‑1 (MQ=255) tCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCAc < 1:436934/140‑1 (MQ=255) gTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGt < 1:663689/140‑1 (MQ=255) tCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTa < 1:997314/140‑1 (MQ=255) tCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTa > 1:1442179/1‑140 (MQ=255) cTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTa < 1:547495/139‑1 (MQ=255) cTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTa > 2:547495/1‑139 (MQ=255) tGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACa < 1:1220540/140‑1 (MQ=255) tGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACa < 2:1079510/140‑1 (MQ=255) ggTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAg < 1:24231/140‑1 (MQ=255) gTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTa > 2:684283/1‑124 (MQ=255) gTACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTa < 1:684283/124‑1 (MQ=255) tACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggt > 2:1233866/1‑140 (MQ=255) tACTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggt > 1:1364670/1‑140 (MQ=255) cTCGGGCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtat < 2:414661/140‑1 (MQ=255) gggCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCa > 1:284822/1‑125 (MQ=255) gggCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCa < 2:284822/125‑1 (MQ=255) gggCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcgg > 1:186144/1‑140 (MQ=255) gggCAACAAATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcgg > 1:158181/1‑140 (MQ=255) aacaaATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggtatc > 2:815401/1‑140 (MQ=255) acaaATTAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGgtatcggtatcg > 1:1300722/1‑140 (MQ=255) tAGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGt < 2:438350/140‑1 (MQ=255) aGCGCTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGtt > 1:719236/1‑140 (MQ=255) | TGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTT > NC_000913/3027321‑3027593 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |