| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→8 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,047 | 1 | . | C | 96.7% | 223.9 / 0.3 | 61 | coding (1286/2526 nt) | ecpC | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base C (31/28); total (33/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
CGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGT > NC_000913/307909‑308181 | cGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑c < 1:1247950/140‑1 (MQ=255) gCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑cc < 2:835199/140‑1 (MQ=255) cAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑ccc > 1:443511/1‑140 (MQ=255) cAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑ccc > 1:679896/1‑140 (MQ=255) tgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑ccccccccaag > 1:451528/1‑136 (MQ=255) tgCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑ccccccccaag > 1:42089/1‑136 (MQ=255) ccAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCg > 1:574972/1‑140 (MQ=255) aTGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCa > 2:127504/1‑140 (MQ=255) aTGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCGCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCa > 1:1110491/1‑140 (MQ=255) tGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATCAGCTATCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCAC‑CCCCCCCAAGCGGGAg > 2:718332/1‑140 (MQ=255) tttttCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGa < 2:843907/140‑1 (MQ=255) ttttCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc < 2:885095/140‑1 (MQ=255) tGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGttt < 2:548617/140‑1 (MQ=255) cccACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccac < 2:340312/140‑1 (MQ=255) cacaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg < 2:237541/140‑1 (MQ=255) cacaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg < 2:930924/140‑1 (MQ=255) aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt < 1:1037225/140‑1 (MQ=255) aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGCTTCACCCACCGCCt > 1:115007/1‑140 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg > 1:1264525/1‑140 (MQ=255) cGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa < 2:1179020/140‑1 (MQ=255) cGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa < 2:628281/140‑1 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt < 2:1295322/140‑1 (MQ=255) aCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa > 1:401139/1‑140 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt < 2:1497690/140‑1 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 2:1158231/140‑1 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTa > 1:192382/1‑140 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGAGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGATGATC‑G‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTAt > 1:504154/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa > 1:452294/1‑140 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat > 1:1466434/1‑140 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc > 1:480495/1‑140 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc > 2:642630/1‑140 (MQ=255) gcgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg < 2:1250192/140‑1 (MQ=255) cgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgc > 2:1107781/1‑140 (MQ=255) cgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgc < 2:787798/140‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc > 1:678831/1‑140 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc > 1:26833/1‑140 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc > 2:741309/1‑140 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTa > 1:1029647/1‑140 (MQ=255) tgctgcTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:1003131/1‑140 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTATCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 2:626642/140‑1 (MQ=255) gctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt > 1:19790/1‑140 (MQ=255) tCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 1:856587/1‑140 (MQ=255) tGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCg > 1:627244/1‑140 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGTAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTc < 2:679896/140‑1 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCg > 1:348132/1‑140 (MQ=255) tGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGc < 2:124671/140‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCa < 2:452294/140‑1 (MQ=255) gCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCAc > 2:13735/1‑140 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGc > 1:1253453/1‑140 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGc > 2:1595838/1‑140 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCt > 2:1246752/1‑140 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCt > 1:1152566/1‑140 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTa < 2:1110491/140‑1 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTa < 2:443511/140‑1 (MQ=255) atTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGc > 2:1439321/1‑140 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCaa < 2:1029647/140‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCaa < 2:528978/140‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCaa < 1:127504/140‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCaa < 1:741309/140‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCaa < 2:42089/140‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCaa < 2:192382/140‑1 (MQ=255) gCAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAAct < 2:627244/140‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAActc > 2:1473769/1‑140 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAActct > 1:1403719/1‑140 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAActct > 1:1188409/1‑140 (MQ=255) tAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCttt > 2:701642/1‑140 (MQ=255) tAACGTTGATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCttt > 2:379952/1‑140 (MQ=255) gATC‑GCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGt < 2:678831/140‑1 (MQ=255) | CGCAATTGATTGCCAATGCGGGTTTTTTCCTGATTAACCCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑G‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGGAGGTCGAGGCACCTGCTAGCCAACTCTCTTTAGCTGGT > NC_000913/307909‑308181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |