| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,240,984 | (G)7→8 | coding (1041/1245 nt) | sstT → | serine/threonine:Na(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,240,977 | 1 | . | G | 97.7% | 156.9 / ‑2.8 | 43 | coding (1034/1245 nt) | sstT | serine/threonine:Na(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base G (3/39); total (3/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.69e-01 | |||||||||||
AATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGC‑GGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTG > NC_000913/3240838‑3241104 | aaTATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGc < 2:1498201/140‑1 (MQ=255) cgggcgCCGCAAACACCATTACCCTGTTGACGCTGGCTGCGGGTTATAAGGCGGGGATTTCCGGCGGTCTGCCCCCCGCGCCCCCCGTGGGGGGGGGGGGTTCTCTGTTTGCCCGTGGGGCCGCCGGCC‑Gggg‑ggggg‑gg > 2:597721/1‑140 (MQ=255) cgggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGC‑ggggg‑gg < 1:1217883/140‑1 (MQ=255) cgcAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGC‑ggggg‑gggtct < 2:933410/140‑5 (MQ=255) cgcAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGC‑GGGGG‑GGtctc < 1:1589198/140‑1 (MQ=255) agcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTctg < 2:745904/140‑1 (MQ=255) aTCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTG‑TGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTctgctgct < 2:665206/140‑1 (MQ=255) tCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTctgctgct < 2:1429354/140‑1 (MQ=255) tCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTctgctgct < 2:91165/140‑1 (MQ=255) tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:228525/140‑1 (MQ=255) tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 2:861151/1‑140 (MQ=255) tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:1309723/140‑1 (MQ=255) tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGGTcccc > 2:1140919/1‑139 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACt > 1:1099768/1‑140 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATcccccc > 2:1026980/1‑137 (MQ=255) cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGGTCTGCTGCTGGTccccccg > 2:602352/1‑136 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTgg < 1:1384707/140‑1 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1516232/140‑1 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1140708/140‑1 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:965192/1‑140 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:94821/140‑1 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 2:736599/1‑140 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACCGGc > 2:1376660/1‑140 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCCCTGCTGCTGGTCCCCCTGGc > 2:630247/1‑140 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTACCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1515698/140‑1 (MQ=255) gtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc < 1:1108042/140‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGGTCTGGTGCTGATCCCCCTCGccc > 2:1469335/1‑139 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGccc > 2:1418046/1‑139 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGccc > 1:1122481/1‑139 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACCGGccc > 1:342988/1‑139 (MQ=255) gACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGt > 1:871592/1‑140 (MQ=255) aCGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTa < 2:44704/140‑1 (MQ=255) aCGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGCCCGTa > 2:1296168/1‑140 (MQ=255) tggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGGAatat > 1:950/1‑140 (MQ=255) ggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCCGATCCCACCGGCCCGTAATATg > 2:1256186/1‑140 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:1217594/129‑1 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:1217594/1‑129 (MQ=255) ctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGGCTGTAATATGtt > 2:490636/1‑140 (MQ=255) gCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCg < 1:292084/140‑1 (MQ=255) tACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 1:602352/140‑1 (MQ=255) cGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaa < 2:1117535/140‑1 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCCCTGCTTCTGATCCCCCCCGCCTGTTATATGGTTGGTGTTTTGAACGat > 2:1235150/1‑140 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTATGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGGTCTCCTGCTGACCCCCCCGGCCCGGAATAAGTTCGGGATTTCGAAAGaa > 2:537690/1‑139 (MQ=255) gTATTCCGGTCGATCTGCCCGCGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGatat < 2:1305073/140‑1 (MQ=255) gTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGatat < 1:899221/140‑1 (MQ=255) tATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATc < 1:499644/140‑1 (MQ=255) aTTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCg < 1:1463779/140‑1 (MQ=255) ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc < 2:1291307/140‑1 (MQ=255) tCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGCCCGTAATATGTTCGGTGTTTCGGACGAGATCGcc > 2:577311/1‑140 (MQ=255) tCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGAGCCCCCTGGCCTGTGATATGTTCGGGGTTTCGGACGACATCGcc > 2:1161134/1‑140 (MQ=255) ggTCGATCTGCCCTGGGCGCTGCTGTTGAGCATGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATGCGGCG‑TGGC‑GGGGGTGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATg < 2:1459599/140‑1 (MQ=255) gTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGc < 2:14497/140‑1 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCCCTGCTGCTGATCCCACCCGCCCGGAATATGTTCGGGGTTTCGAACGATGTCGCCATGCa > 2:956735/1‑140 (MQ=255) aCGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 1:1256186/140‑1 (MQ=255) cGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCCGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGGGGGTGCCgc > 2:944692/1‑139 (MQ=255) tgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGGTCCCCCCGGCCCGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCCTGCAGGGGGGTGCCGTCGGCtt > 2:946587/1‑140 (MQ=255) tGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 2:378357/140‑1 (MQ=255) tGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 2:1256561/140‑1 (MQ=255) tGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 1:1568053/140‑1 (MQ=255) gAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCCGTAATATGTTCGGGATTTTGAACGATATCGCCCTGCAGGGGGGTGCCGTCGGCTTTttcatc > 1:150716/1‑140 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCCTGCAGGGGGGTGCCGGCGGCTTTTTCATCGGc > 1:363600/1‑140 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:1351445/140‑1 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:144381/140‑1 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 2:965192/140‑1 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:1019870/140‑1 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 2:110079/140‑1 (MQ=255) gtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTAt < 1:861151/140‑1 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCa < 1:360078/140‑1 (MQ=255) ctctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGa < 1:1296168/140‑1 (MQ=255) gtgCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGGCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCGGGTGGTTGCCGTCGGCCTTATCATCGGCGGATTGCAGGGCTCTTg > 2:699068/1‑140 (MQ=255) ccTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGGGGGTGCCGTCGGCCTTGTCATCGGCGGATTGCAGGAGGCTTGCgg > 2:894048/1‑139 (MQ=255) tgtgGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGaaa < 1:262550/140‑1 (MQ=255) tgtgGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGaaa < 2:871592/140‑1 (MQ=255) tgtgGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGCCCGTAAAATGTTCGGGATTTCGAACGGTATCGCCATGCAGGGGGGTGCCGTCGGCCTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTTCGaaa > 2:872282/1‑140 (MQ=255) tgGCGCATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGTAATATTTTCGGGATTTTGAACGATATCGCCATGCAGGGGGGTGCCGGCGGCTTTTTCATCGGCGGATTGCAGGGCTCTTGCGAAAcc > 2:630180/1‑140 (MQ=255) cgcATCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACcgcg < 2:1099768/140‑1 (MQ=255) aTCCGGCGTTGCC‑GGGAG‑TGTCTATGCTACTGATCCCACTGGCCTGTACTATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTGTCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTg < 2:880767/140‑1 (MQ=255) aTCCGGCG‑TGGCGGGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTg < 1:854292/140‑1 (MQ=255) | AATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCG‑TGGC‑GGGGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTG > NC_000913/3240838‑3241104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |