| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,027,312 | A→G | A64A (GCA→GCG) | ghxQ → | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,027,312 | 0 | A | G | 98.6% | 252.2 / ‑4.3 | 70 | A64A (GCA→GCG) | ghxQ | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (36/33); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
GGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGC > NC_000913/3027174‑3027445 | ggATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAg < 2:584627/140‑1 (MQ=255) aTAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCt > 1:322922/1‑140 (MQ=255) aTAATTATTTTAAAATTACCGCTAGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCt < 1:994560/140‑1 (MQ=255) ttattTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTgtgt < 2:1161233/140‑1 (MQ=255) tttAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGtgtttgt < 1:867332/140‑1 (MQ=255) ttAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGtgtttgtt > 2:285878/1‑140 (MQ=255) ttAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGtgtttgtt > 2:474316/1‑140 (MQ=255) aaaaTTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGc < 1:1211436/140‑1 (MQ=255) aTTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCAc < 1:992070/140‑1 (MQ=255) cGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCg < 2:301570/140‑1 (MQ=255) cGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCg < 1:285878/140‑1 (MQ=255) ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc > 1:69171/1‑140 (MQ=255) ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc > 2:360710/1‑140 (MQ=255) ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc > 1:889447/1‑140 (MQ=255) ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc < 1:360710/140‑1 (MQ=255) tCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCt < 2:322922/140‑1 (MQ=255) cAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGTCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGtt < 2:551431/140‑1 (MQ=255) cAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGtt > 2:384189/1‑140 (MQ=255) cAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGtt > 2:885903/1‑140 (MQ=255) aGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTg < 2:828134/140‑1 (MQ=255) aGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTg < 2:399279/140‑1 (MQ=255) aaGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCGCCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTg < 2:209908/140‑1 (MQ=255) ctggctggCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATggg > 1:1114744/1‑140 (MQ=255) gctggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGAtt > 1:1121761/1‑140 (MQ=255) tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 1:398559/1‑140 (MQ=255) tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 1:1152992/1‑140 (MQ=255) ctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATggg > 2:999002/1‑140 (MQ=255) 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ggTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGcc > 2:334104/1‑129 (MQ=255) ggTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGcc < 1:334104/129‑1 (MQ=255) ggTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTg > 1:242696/1‑140 (MQ=255) gTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTgg > 1:843446/1‑140 (MQ=255) gTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTgg > 1:793839/1‑140 (MQ=255) tttATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTCTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGt < 2:843446/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGAttt > 2:662028/1‑140 (MQ=255) gtcgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCtt > 2:915156/1‑140 (MQ=255) gtcgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCtt > 1:293543/1‑140 (MQ=255) gtcgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCtt > 1:421923/1‑140 (MQ=255) cgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGa < 2:1013130/140‑1 (MQ=255) cgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGa < 1:915156/140‑1 (MQ=255) cgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGa < 1:662028/140‑1 (MQ=255) gtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGAc < 2:889447/140‑1 (MQ=255) gtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGAc < 1:885903/140‑1 (MQ=255) ttCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACg > 2:600391/1‑140 (MQ=255) gCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCg > 1:97741/1‑140 (MQ=255) gCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCg > 2:431715/1‑140 (MQ=255) ggCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCAtt > 2:587656/1‑140 (MQ=255) ggCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCAtt < 2:793839/140‑1 (MQ=255) ggCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCAtt < 2:1114744/140‑1 (MQ=255) gCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTc < 2:293543/140‑1 (MQ=255) cAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCa < 2:398559/140‑1 (MQ=255) aGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTc > 2:480358/1‑140 (MQ=255) ttCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTc > 1:481578/1‑140 (MQ=255) tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg < 2:634229/140‑1 (MQ=255) tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg > 1:634229/1‑140 (MQ=255) tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg < 1:384189/140‑1 (MQ=255) tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg < 2:97741/140‑1 (MQ=255) cctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCgg > 2:407414/1‑140 (MQ=255) tccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGc < 2:481578/140‑1 (MQ=255) | GGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGC > NC_000913/3027174‑3027445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |