Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,745,237 | T→C | S35G (AGC→GGC) | trmD ← | tRNA m(1)G37 methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,745,237 | 0 | T | C | 97.1% | 234.0 / ‑2.0 | 69 | S35G (AGC→GGC) | trmD | tRNA m(1)G37 methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (38/29); total (40/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.20e-01 |
CACCCGCCGCGGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCTCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGTTTATCCGGTGGTTTA > NC_000913/2745102‑2745372 | cccccGCCGCGGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTgg < 1:960481/138‑1 (MQ=255) cACCCGCCGCGGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTgg > 2:1050217/1‑140 (MQ=255) cACCCGCCGCGGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTgg > 1:746714/1‑140 (MQ=255) cgGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTcagc > 1:60813/1‑140 (MQ=255) cgGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTcagc > 2:144551/1‑140 (MQ=255) cTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAgg < 2:73403/140‑1 (MQ=255) tGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGcc < 2:1033428/140‑1 (MQ=255) ggCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGccc > 2:812933/1‑140 (MQ=255) gTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGc > 1:109664/1‑140 (MQ=255) tCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGcc > 1:243976/1‑140 (MQ=255) tCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGcc > 2:626951/1‑140 (MQ=255) cGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGt < 2:852610/140‑1 (MQ=255) cGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGt > 2:329625/1‑140 (MQ=255) cGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGt < 2:746714/140‑1 (MQ=255) aGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTAcc < 1:335130/140‑1 (MQ=255) gTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCg < 2:243976/140‑1 (MQ=255) gTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCg < 1:224062/140‑1 (MQ=255) gTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCg < 1:144551/140‑1 (MQ=255) gCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTaa > 1:491639/1‑140 (MQ=255) catTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTaa < 2:491639/140‑1 (MQ=255) aTCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGcgcg > 2:858417/1‑140 (MQ=255) aTCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGcgcg > 1:327830/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 1:619413/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 1:726143/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 2:515115/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 1:487027/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 2:709616/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 2:831534/1‑140 (MQ=255) ccccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGa > 1:942181/1‑140 (MQ=255) cccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGaa < 2:284457/140‑1 (MQ=255) cccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGaa > 1:1038694/1‑140 (MQ=255) cccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGaa < 1:1050217/140‑1 (MQ=255) cccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGaa > 1:464913/1‑140 (MQ=255) ccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAAc > 2:991273/1‑140 (MQ=255) ccGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAAc > 2:825119/1‑140 (MQ=255) cGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACa < 1:460091/140‑1 (MQ=255) ggTCCGCCGCCGTAAGGACAATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACAt > 2:986362/1‑140 (MQ=255) cgccgccgTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCa < 2:60813/140‑1 (MQ=255) gccgTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGaa < 2:487027/140‑1 (MQ=255) aaGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAgg < 1:825119/140‑1 (MQ=255) aaGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAgg < 2:109664/140‑1 (MQ=255) aGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTA‑CCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCt > 2:603591/1‑140 (MQ=255) aTCGTCCACGGTACGGTGCCTGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTa < 1:1023520/140‑1 (MQ=255) cGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATg < 1:812933/140‑1 (MQ=255) cGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATg < 2:327830/140‑1 (MQ=255) cGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATg < 1:592639/140‑1 (MQ=255) tCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGcc > 1:655545/1‑140 (MQ=255) tacggtGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCcac > 1:245078/1‑140 (MQ=255) tacggtGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCcac > 1:392080/1‑140 (MQ=255) tacggtGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCcac > 1:627827/1‑140 (MQ=255) tacggtGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCcac > 1:846866/1‑140 (MQ=255) tGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAgc > 1:821421/1‑140 (MQ=255) gCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAgcg < 1:991273/140‑1 (MQ=255) ccGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAgcgc > 1:959055/1‑140 (MQ=255) cGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGcc > 1:857355/1‑140 (MQ=255) gTCATGCGTGAAGTCGCGAGGCCTCCAGCTCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGt > 1:936935/1‑140 (MQ=255) gTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCTGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGt > 2:598155/1‑140 (MQ=255) gTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGt > 1:158087/1‑140 (MQ=255) gTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGt > 2:674968/1‑140 (MQ=255) tGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCttt < 1:858417/140‑1 (MQ=255) gCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAgcg < 1:536133/131‑1 (MQ=255) gCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAgcg > 2:536133/1‑131 (MQ=255) cGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTa < 2:464913/140‑1 (MQ=255) gTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTAc < 2:821421/140‑1 (MQ=255) aaGTCGCGAGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGt < 2:619413/140‑1 (MQ=255) aGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGTTTATCCgg < 2:392080/140‑1 (MQ=255) aGGACTCCAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATATTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATACCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGTTTATCCgg < 2:959055/140‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGTTTATCCGGTGGTTTa > 1:793401/1‑140 (MQ=255) cAGCCCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGTTTATCCGGTGGTTTa > 2:215550/1‑140 (MQ=255) | CACCCGCCGCGGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCTCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCCACATAGCGCCGTCTTTTACCGTTTATCCGGTGGTTTA > NC_000913/2745102‑2745372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |