| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 511,273 | A→G | V36A (GTG→GCG) V36A (GTG→GCG) |
copA ← copA ← |
Cu(+) exporting P‑type ATPase Cu(+) exporting P‑type ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 511,273 | 0 | A | G | 100.0% | 308.2 / NA | 81 | V36A (GTG→GCG) V36A (GTG→GCG) | copA copA | Cu(+) exporting P‑type ATPase Cu(+) exporting P‑type ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (41/40); total (41/40) | |||||||||||
ACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACT > NC_000913/511142‑511407 | aCGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGcc < 1:228671/140‑1 (MQ=255)aCGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGcc < 1:771306/140‑1 (MQ=255) gATTGATGCCTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCt < 2:1192852/140‑1 (MQ=255) gATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCt > 2:1044087/1‑140 (MQ=255) gATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCt > 1:556943/1‑140 (MQ=255) aTTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTc > 1:1133985/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 2:450864/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 1:331401/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 2:353654/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 2:615699/1‑140 (MQ=255) ccGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGa < 1:496075/140‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGa > 2:944712/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGAc > 1:1493398/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGAc > 1:1136399/1‑140 (MQ=255) gCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACg < 2:1367508/140‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACg < 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aGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGAc < 2:943241/140‑1 (MQ=255) tGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGActttctt > 2:1151541/1‑140 (MQ=255) gggTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGActttcttt > 1:1174274/1‑140 (MQ=255) gggTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGActttcttt > 2:924540/1‑140 (MQ=255) tGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAc < 1:755819/140‑1 (MQ=255) tGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAc < 2:1441967/140‑1 (MQ=255) gCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAcgc > 2:779928/1‑140 (MQ=255) gCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAcgc > 1:794600/1‑140 (MQ=255) cTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAcgcg > 1:1066017/1‑140 (MQ=255) tACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGtt > 1:1415155/1‑140 (MQ=255) cAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTa < 1:1574857/140‑1 (MQ=255) aGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTaa < 2:1136399/140‑1 (MQ=255) gCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCa < 1:353654/140‑1 (MQ=255) gCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCa > 2:121970/1‑140 (MQ=255) cGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAg > 1:78440/1‑140 (MQ=255) cGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAg > 1:850759/1‑140 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 1:296346/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 2:1381195/140‑1 (MQ=255) aTAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGAc > 2:247560/1‑140 (MQ=255) aTAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGAc > 1:1044323/1‑140 (MQ=255) cGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAgg > 2:847815/1‑140 (MQ=255) gCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGa < 2:1561946/140‑1 (MQ=255) cTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGAc > 1:377067/1‑140 (MQ=255) tGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAg < 1:1550823/140‑1 (MQ=255) gTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAgg < 1:61450/140‑1 (MQ=255) gTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAgg < 1:615699/140‑1 (MQ=255) tttGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGc < 2:533652/140‑1 (MQ=255) tttGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGc < 1:187455/140‑1 (MQ=255) aTGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTc < 1:450864/140‑1 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cGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTTACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAacac < 2:719025/140‑1 (MQ=255) cGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAacac < 2:914293/140‑1 (MQ=255) tAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTTCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTcc > 2:100765/1‑140 (MQ=255) tAACGTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTcc > 1:32067/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTa > 2:799329/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTTCAGTGATAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTa > 2:1353385/1‑140 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1:179131/1‑140 (MQ=255) tAGACGCATCCGCCTTCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACt < 1:100765/140‑1 (MQ=255) tAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACGCTCCTTTAAGACAGTTGTGACt < 2:850759/140‑1 (MQ=255) tAGACGCATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACt > 2:1071807/1‑140 (MQ=255) | ACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACT > NC_000913/511142‑511407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |