Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 1,594,131 | (C)8→6 | pseudogene (3955‑3956/5422 nt) | yneO ← | AIDA‑I family autotransporter YneO |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,594,125 | 0 | C | . | 100.0% | 268.9 / NA | 62 | pseudogene (3962/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
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* | NC_000913 | 1,594,126 | 0 | C | . | 100.0% | 268.9 / NA | 62 | pseudogene (3961/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (30/32); total (30/32) |
AACGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCAC > NC_000913/1593986‑1594258 || aaCGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGc > 1:1422678/1‑140 (MQ=255) tcatcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccc < 1:975874/140‑1 (MQ=255) tcatcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccc < 1:1276528/140‑1 (MQ=255) tcatcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccc < 1:1485208/140‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |