Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	2,799	A→G	*821W (TGA→TGG)	thrA →	fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	2,799	0	A	G	100.0%	358.0 / NA	96	*821W (TGA→TGG)	thrA	fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (57/39);  total (57/39)

CCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGT  >  NC_000913/2667‑2935                                                                                                                                     |                                                                                                                                         ccTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGtt                                                                                                                                   >  2:506275/1‑140 (MQ=255)     gCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAg                                                                                                                               >  2:910087/1‑140 (MQ=255)       cTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGtt                                                                                                                             <  1:783208/140‑1 (MQ=255)                ccACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCg                                                                                                                    >  2:800538/1‑140 (MQ=255)                  aCTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGc                                                                                                                  >  2:666989/1‑140 (MQ=255)                   cTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCt                                                                                                                 >  2:380225/1‑140 (MQ=255)                     attatCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTc                                                                                                               <  2:975228/140‑1 (MQ=255)                     attatCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTc                                                                                                               <  1:739253/140‑1 (MQ=255)                     attatCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTc                                                                                                               <  2:919365/140‑1 (MQ=255)                     attacCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCTGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTc                                                                                                               <  1:928568/140‑1 (MQ=255)                       tatCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCa                                                                                                             <  2:1457182/140‑1 (MQ=255)                       tatCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCa                                                                                                             <  1:1153081/140‑1 (MQ=255)                       tatCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCa                                                                                                             <  1:42936/140‑1 (MQ=255)                        atCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAg                                                                                                            >  2:1176889/1‑140 (MQ=255)                         tCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGt                                                                                                           <  1:951700/140‑1 (MQ=255)                         tCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGt                                                                                                           <  2:855419/140‑1 (MQ=255)                          cAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTg                                                                                                          >  2:73821/1‑140 (MQ=255)                             ccGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCa                                                                                                       >  2:622758/1‑140 (MQ=255)                              cGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCaa                                                                                                      >  2:571263/1‑140 (MQ=255)                              cGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCaa                                                                                                      >  2:1310181/1‑140 (MQ=255)                              cGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACACTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTAGGCCCCGGCTTCCAGTGCCaa                                                                                                      >  2:653445/1‑140 (MQ=255)                                       tGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGt                                                                                             <  2:166353/140‑1 (MQ=255)                                             tGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGtt                                                                                       >  1:600045/1‑140 (MQ=255)                                             tGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGtt                                                                                       >  1:465320/1‑140 (MQ=255)                                               cgcgGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTg                                                                                     >  2:1138579/1‑140 (MQ=255)                                                 cgGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGAt                                                                                   <  1:125052/140‑1 (MQ=255)                                                   gATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGAtgt                                                                                 >  2:1219384/1‑140 (MQ=255)                                                      atGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCt                                                                              <  1:73821/140‑1 (MQ=255)                                                         gTGCGGGCAATGACGATACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGCTAGTTAGGAGACTGGCCTGGCTAAAGCCTAAACCCCGGCTTCCAGCGCCAATATGAGCGTTGGGATCGATATGCTCgg                                                                           >  2:770535/1‑140 (MQ=255)                                                          tGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCggg                                                                          <  2:156271/140‑1 (MQ=255)                                                            cGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGACTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggc                                                                        >  2:9330/1‑140 (MQ=255)                                                             gggCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcg                                                                       <  2:745610/140‑1 (MQ=255)                                                              ggCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcgg                                                                      >  1:1363707/1‑140 (MQ=255)                                                               gCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcggc                                                                     <  1:910087/140‑1 (MQ=255)                                                                  aTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGt                                                                  >  1:761321/1‑140 (MQ=255)                                                                  aTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGt                                                                  <  1:11091/140‑1 (MQ=255)                                                                  aTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGt                                                                  <  2:119757/140‑1 (MQ=255)                                                                   tGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg                                                                 >  1:659305/1‑140 (MQ=255)                                                                   tGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg                                                                 >  1:683084/1‑140 (MQ=255)                                                                   tGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg                                                                 >  1:917175/1‑140 (MQ=255)                                                                         tACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGGGTCACCt                                                           >  2:1122759/1‑140 (MQ=255)                                                                                accGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATg                                                    >  2:708437/2‑140 (MQ=255)                                                                                  cGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATggg                                                  >  2:182343/1‑139 (MQ=255)                                                                                   ggTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTg                                                 <  2:455284/140‑1 (MQ=255)                                                                                   ggTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTg                                                 <  1:878869/140‑1 (MQ=255)                                                                                   ggTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTg                                                 >  2:1361714/1‑140 (MQ=255)                                                                                   ggTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTg                                                 <  1:380225/140‑1 (MQ=255)                                                                                     tgtCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa                                               <  1:1310181/140‑1 (MQ=255)                                                                                     tgtCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa                                               <  1:1431192/140‑1 (MQ=255)                                                                                     tgtCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa                                               <  1:145001/140‑1 (MQ=255)                                                                                     tgtCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa                                               <  1:1520085/140‑1 (MQ=255)                                                                                     tgtCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa                                               <  1:571263/140‑1 (MQ=255)                                                                                      gtCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCAt                                              >  1:36654/1‑140 (MQ=255)                                                                                          ttGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCt                                          <  1:800538/140‑1 (MQ=255)                                                                                          ttGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCt                                          <  1:1219384/140‑1 (MQ=255)                                                                                            gCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGACTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCg                                        <  1:9330/140‑1 (MQ=255)                                                                                               gATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGgag                                     <  1:1345611/140‑1 (MQ=255)                                                                                                aTCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGgaga                                    >  1:553367/1‑140 (MQ=255)                                                                                                 tCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGAt                                   >  1:1334364/1‑140 (MQ=255)                                                                                                  cTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCGCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATg                                  <  1:770535/140‑1 (MQ=255)                                                                                                   tGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGt                                 >  2:527063/1‑140 (MQ=255)                                                                                                     cTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAg                               >  2:1399316/1‑140 (MQ=255)                                                                                                     cTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAg                               >  2:360749/1‑140 (MQ=255)                                                                                                        cGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGACGtgacta                            <  2:761321/140‑6 (MQ=255)                                                                                                          tACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACg                          >  2:829750/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACg                          >  2:823226/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACg                          >  2:562494/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACg                          >  1:1219052/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACg                          >  1:1162438/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATGGCTCGGGGAAGTAGCCACg                          >  2:93070/1‑140 (MQ=255)                                                                                                            cccTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGt                        >  1:1352595/1‑140 (MQ=255)                                                                                                             ccTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGtt                       >  2:103011/1‑140 (MQ=255)                                                                                                             ccTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGtt                       >  1:680734/1‑140 (MQ=255)                                                                                                             ccTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGtt                       >  2:1005441/1‑140 (MQ=255)                                                                                                             ccTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGCTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGCCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGAGCATTGCTCGGAACTGTAGTCACGGtt                       >  2:608533/1‑140 (MQ=255)                                                                                                               tctcATGGAAGTTAGGAGTCTTGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGa                     >  2:1111499/1‑140 (MQ=255)                                                                                                               tctcATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGa                     >  1:1325689/1‑140 (MQ=255)                                                                                                               tctcATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGa                     >  2:148505/1‑140 (MQ=255)                                                                                                               tctcATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGa                     >  1:608030/1‑140 (MQ=255)                                                                                                               tctcATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGGTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGa                     >  2:673608/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                ctcATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAg                    <  2:582733/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                ctcATGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAg                    >  1:110787/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                   aTGGAAGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGAGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAggcg                 >  1:616419/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                       aaGTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCag             >  2:1293916/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                         gTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACGCCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCagag           <  2:917175/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                         gTTAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCagag           <  2:659305/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                           tAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGAc         >  1:1015589/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                           tAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGAc         >  1:200267/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                           tAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGAc         >  1:91714/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                           tAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGAc         >  2:1497239/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                           tAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGAc         >  2:197874/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                           tAGGAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCGCGGAGATGTAGGCACGGTATAGGCGGCAGAGAc         >  2:1534308/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                              gAGTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACAtt      <  2:600045/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                                gTCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCa    <  1:1023950/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                                 tCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAg   <  1:197874/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                                 tCTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAg   >  2:526030/1‑140 (MQ=255)                                                                                                                                  cTGGCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGt  <  1:1275993/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                                     |                                                                                                                                         CCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGT  >  NC_000913/2667‑2935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑