Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,927,799 | T→C | intergenic (+127/‑430) | ppnN → / → sdaC | nucleotide 5'‑monophosphate nucleosidase/serine:H(+) symporter SdaC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,927,799 | 0 | T | C | 97.7% | 304.2 / ‑2.5 | 85 | intergenic (+127/‑430) | ppnN/sdaC | nucleotide 5'‑monophosphate nucleosidase/serine:H(+) symporter SdaC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (44/39); total (45/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 |
CACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTGCGC > NC_000913/2927666‑2927934 | cACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCa < 2:1384967/140‑1 (MQ=255) cACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCa < 2:131250/140‑1 (MQ=255) cACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCa < 2:966023/140‑1 (MQ=255) cACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCa > 2:552274/1‑140 (MQ=255) ccGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCAt < 1:1205113/139‑1 (MQ=255) aCGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCAt < 2:1408707/140‑1 (MQ=255) aCGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCAt < 1:1508720/140‑1 (MQ=255) aTCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAAt < 1:769270/140‑1 (MQ=255) ctcCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAAttt > 1:1432349/1‑140 (MQ=255) tcCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTa < 2:242156/140‑1 (MQ=255) ccGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTAt > 1:583452/1‑140 (MQ=255) cGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATg < 1:1519711/140‑1 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTg < 2:494193/140‑1 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTg < 1:1140816/140‑1 (MQ=255) ccccGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCa > 1:137547/1‑140 (MQ=255) gTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCa > 2:1033355/1‑140 (MQ=255) cGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACg < 1:1036129/140‑1 (MQ=255) gTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGt > 2:1485373/1‑140 (MQ=255) gTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGt > 1:495982/1‑140 (MQ=255) gCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTa < 2:1333317/140‑1 (MQ=255) ggTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTCATATGAATGATTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTAtttt > 1:1176170/1‑140 (MQ=255) ttttCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCa < 1:1219443/140‑1 (MQ=255) ctcGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATaaa < 2:876589/140‑1 (MQ=255) ctcGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATaaa < 2:527035/140‑1 (MQ=255) tttGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTAt > 2:253259/1‑140 (MQ=255) ggTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATaaa > 1:530156/1‑131 (MQ=255) ggTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATaaa < 2:530156/131‑1 (MQ=255) cTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGc > 1:748129/1‑140 (MQ=255) ttACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCt < 2:1087524/140‑1 (MQ=255) ttACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCt < 1:60755/140‑1 (MQ=255) catcaACTCATTTCATTTGTTGTATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGaa > 1:194902/1‑140 (MQ=255) caACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGaaaaa > 1:119885/1‑140 (MQ=255) aCTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGa > 1:248420/1‑140 (MQ=255) aCTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGa > 2:248422/1‑140 (MQ=255) atttcatttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAAtt > 1:1478484/1‑140 (MQ=255) atttcatttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAAtt > 1:22827/1‑140 (MQ=255) tttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGcc < 1:223909/140‑1 (MQ=255) tttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGcc < 2:1218773/140‑1 (MQ=255) ttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCa > 1:106059/1‑140 (MQ=255) ttATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGa < 2:495982/140‑1 (MQ=255) ttATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGa > 1:1292167/1‑140 (MQ=255) ttATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGa > 2:1374064/1‑140 (MQ=255) atatGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGAtt > 1:1245250/1‑140 (MQ=255) atatGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGAtt > 2:1188698/1‑140 (MQ=255) atGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTaa > 2:1019036/1‑140 (MQ=255) gTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTaaaa > 1:17452/1‑140 (MQ=255) gTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTaaaa > 2:1434684/1‑140 (MQ=255) tttCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAg > 2:802552/1‑140 (MQ=255) accaccCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGa > 2:8091/1‑140 (MQ=255) accaccCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGa > 1:36256/1‑140 (MQ=255) cccTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGAtttt > 2:624543/1‑140 (MQ=255) cccTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGAtttt > 2:726602/1‑140 (MQ=255) ccTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGAttttt > 2:952445/1‑140 (MQ=255) cTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGAtttttt > 1:961711/1‑140 (MQ=255) cTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATAAAAGTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGAtttttt < 2:1176170/140‑1 (MQ=255) tCACGCGACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTc > 2:102341/1‑140 (MQ=255) cgcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGt > 1:483317/1‑140 (MQ=255) cgcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGt > 2:1154279/1‑140 (MQ=255) cgcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGt < 1:1374064/140‑1 (MQ=255) cgcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGt < 1:402527/140‑1 (MQ=255) gcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGtt < 2:1432349/140‑1 (MQ=255) gcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGtt < 2:1095965/140‑1 (MQ=255) gcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGtt < 1:1378629/140‑1 (MQ=255) gcgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGtt < 2:748129/140‑1 (MQ=255) cgACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTc < 2:106059/140‑1 (MQ=255) gACAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCa < 2:194902/140‑1 (MQ=255) aCAAATATCATCACAGTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCaa < 2:990416/140‑1 (MQ=255) 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1:1195246/1‑140 (MQ=255) gTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTgcg < 2:248420/140‑1 (MQ=255) gTTAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTgcg > 1:672746/1‑140 (MQ=255) ttAACATGTCATACAATTTGTGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTgcgc > 2:1508327/1‑140 (MQ=255) ttAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTgcgc > 2:602826/1‑140 (MQ=255) ttAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTgcgc > 1:539427/1‑140 (MQ=255) ttAACATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTgcgc > 1:1529329/1‑140 (MQ=255) | CACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGATTAACTAAAAGTATTGATTTTTTCAGTTCAACCTACATATATTGCGC > NC_000913/2927666‑2927934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |