| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,795,090 | T→C | A54A (GCT→GCC) | waaF → | ADP‑heptose‑‑LPS heptosyltransferase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,795,090 | 0 | T | C | 98.3% | 433.0 / ‑1.9 | 117 | A54A (GCT→GCC) | waaF | ADP‑heptose‑‑LPS heptosyltransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (64/51); minor base A (1/1); total (65/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTC > NC_000913/3794954‑3795225 | gTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTAt < 1:465512/140‑1 (MQ=255) gTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTAt < 2:659636/140‑1 (MQ=255) gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct > 1:556288/1‑140 (MQ=255) gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct > 1:739755/1‑140 (MQ=255) gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct > 1:8544/1‑140 (MQ=255) gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct < 2:670129/140‑1 (MQ=255) gCGACATGATGATGTCGCAAAGCCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct < 1:650813/140‑1 (MQ=255) gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGTCATTCCTATGCctct < 2:732977/140‑1 (MQ=255) gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct < 1:1137199/140‑1 (MQ=255) gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct < 1:727868/140‑1 (MQ=255) gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct < 2:760344/140‑1 (MQ=255) gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGCGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct > 2:27578/1‑140 (MQ=255) tCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAgc > 2:1160281/1‑140 (MQ=255) cAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCt > 1:1228584/1‑140 (MQ=255) tctcTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGaaa < 1:798126/140‑1 (MQ=255) ctctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAAt < 2:711522/140‑1 (MQ=255) tctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATc > 2:399393/1‑140 (MQ=255) tATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCgg > 2:1428112/1‑140 (MQ=255) tCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCg > 2:1534894/1‑140 (MQ=255) gCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGaa < 2:1333865/140‑1 (MQ=255) gCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGaa < 2:1152859/140‑1 (MQ=255) gCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGaa < 2:779781/140‑1 (MQ=255) cACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAc > 2:932256/1‑140 (MQ=255) aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 2:190950/1‑140 (MQ=255) aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 1:1012110/1‑140 (MQ=255) aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 1:199822/1‑140 (MQ=255) aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 1:122827/1‑140 (MQ=255) cGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgc < 2:790440/140‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgccgc > 2:1273502/1‑140 (MQ=255) gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 1:1069454/140‑1 (MQ=255) gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 1:280223/140‑1 (MQ=255) gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 1:1145323/140‑1 (MQ=255) gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 2:597614/140‑1 (MQ=255) gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 2:619346/140‑1 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 1:1481050/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:475384/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:512029/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:1406480/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:325126/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 1:405091/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:734474/1‑140 (MQ=255) cTATCCCCAGACGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGCTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCCCGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:884330/1‑140 (MQ=255) ccccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAg < 1:802674/140‑1 (MQ=255) cccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACCGGGTCATAGc > 2:1107770/1‑140 (MQ=255) ccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGcc < 2:616980/140‑1 (MQ=255) cGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGt < 1:302457/140‑1 (MQ=255) aTAATCGATGTGATGACACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGa > 2:650573/1‑140 (MQ=255) tAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaa > 1:1044072/1‑140 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa > 1:796201/1‑140 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 1:173265/140‑1 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 1:712911/140‑1 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 1:1000495/140‑1 (MQ=255) aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 2:663485/140‑1 (MQ=255) aTGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgcgc > 2:1109187/1‑140 (MQ=255) aTGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgcgc < 1:589210/140‑1 (MQ=255) gATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACg > 1:1468432/1‑140 (MQ=255) ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAGCGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc < 1:98806/140‑1 (MQ=255) ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc < 1:1428112/140‑1 (MQ=255) ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc < 1:1317273/140‑1 (MQ=255) ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc > 2:346396/1‑140 (MQ=255) ccGGCATGGTGCCGTCCATTATTATTGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCgcgc > 1:158332/1‑140 (MQ=255) ccGGCATAGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCgcgc > 1:277781/1‑140 (MQ=255) ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt < 1:1160281/140‑1 (MQ=255) ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt < 1:140392/140‑1 (MQ=255) ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt < 2:1010332/140‑1 (MQ=255) ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCCCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt > 1:1018979/1‑140 (MQ=255) cATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTAc > 1:1083331/1‑140 (MQ=255) ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGTCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc > 1:375137/1‑140 (MQ=255) ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc < 1:234424/140‑1 (MQ=255) ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc < 2:1539558/140‑1 (MQ=255) ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc < 1:190950/140‑1 (MQ=255) gTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTAccc > 1:579471/1‑140 (MQ=255) tCCATTATTATTGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa > 1:1193771/1‑140 (MQ=255) tCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa > 2:745791/1‑140 (MQ=255) tCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa > 1:532671/1‑140 (MQ=255) tCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa < 1:505855/140‑1 (MQ=255) cagtattatCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGGGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 2:1071855/137‑1 (MQ=255) cATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 2:250334/140‑1 (MQ=255) cATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 2:1228584/140‑1 (MQ=255) tatCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTc < 1:1161401/140‑1 (MQ=255) tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa > 1:1276212/1‑140 (MQ=255) tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa > 1:1329117/1‑140 (MQ=255) tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa < 1:898805/140‑1 (MQ=255) tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa > 2:9499/1‑140 (MQ=255) gcgGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAAt > 2:9732/1‑140 (MQ=255) gcgGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAAt > 2:647284/1‑140 (MQ=255) cgGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATc > 2:1297089/1‑140 (MQ=255) gATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTg > 2:567014/1‑140 (MQ=255) tGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCa > 1:1182364/1‑140 (MQ=255) tGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCa > 1:510892/1‑140 (MQ=255) tGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCa > 1:260012/1‑140 (MQ=255) gCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCAt < 1:692671/140‑1 (MQ=255) cGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTa > 1:950000/1‑140 (MQ=255) ggAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCGTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAg < 2:468738/140‑1 (MQ=255) ttAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCt < 2:8544/140‑1 (MQ=255) aaCGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCttt > 2:713701/1‑140 (MQ=255) aCGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttc < 1:1351347/140‑1 (MQ=255) cGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttct > 1:1313548/1‑140 (MQ=255) aaGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttcttc < 2:1468432/140‑1 (MQ=255) aaGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttcttc < 1:647284/140‑1 (MQ=255) | CTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTC > NC_000913/3794954‑3795225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |