Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,129,332 | A→G | V498V (GTA→GTG) | murJ → | putative lipid II flippase MurJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,129,332 | 0 | A | G | 96.8% | 101.8 / ‑4.4 | 31 | V498V (GTA→GTG) | murJ | putative lipid II flippase MurJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (1/29); total (1/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 |
TGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTACTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGACCGTTCGCC > NC_000913/1129196‑1129468 | tGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTg < 1:107640/140‑1 (MQ=255) tGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTc < 1:255917/140‑1 (MQ=255) cGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTa < 2:684321/140‑1 (MQ=255) ttACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCccgccg < 2:805854/140‑1 (MQ=255) aCATATCGTGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGa < 1:449124/140‑1 (MQ=255) aCATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGa < 2:110899/140‑1 (MQ=255) aCATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGa < 1:243606/140‑1 (MQ=255) aCATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGa < 2:753103/140‑1 (MQ=255) aCATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGa < 1:566045/140‑1 (MQ=255) aCATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGa < 2:796722/140‑1 (MQ=255) cATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCtgcagtg < 1:823380/140‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCtgcagtgca < 1:205537/140‑1 (MQ=255) ggCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCgg < 2:100899/140‑1 (MQ=255) tAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATccggcctg < 1:391777/140‑8 (MQ=255) ggCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGaa < 2:1258066/140‑1 (MQ=255) ggCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGaa < 1:639553/140‑1 (MQ=255) cGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAAt < 1:187732/140‑1 (MQ=255) ggCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTACTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTAccg < 1:871484/140‑1 (MQ=255) ggATTGCCGCGTACTTCGCTGCCCTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCcgcg < 1:1145865/140‑1 (MQ=255) gCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATggg < 1:607207/140‑1 (MQ=255) gCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATggg < 1:482389/140‑1 (MQ=255) gCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATggg < 1:789169/140‑1 (MQ=255) gCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATggg < 2:1251810/140‑1 (MQ=255) accGCGTCCTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGGCGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATggg < 1:1285141/139‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAg < 1:1470709/140‑1 (MQ=255) tGCACTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGa < 1:973318/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGACCGt < 1:1045822/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGACCGt < 1:615906/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGACCGt < 1:307727/140‑1 (MQ=255) tGGCGGTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGGCGGGGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGGTGTTGAGGTCTGACCGtt > 1:806143/1‑140 (MQ=255) ggTGCTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGACCGTTCGcc < 1:69594/140‑1 (MQ=255) | TGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCGTACTTCGCTGCACTGGCGGTACTGGGCTTCAAAGTTAAAGAATTTGCCCGCCGGACGGTGTAACAATGCATTCCGGCCTGCAGTGCAGGCCGGAGATAATCTTCAGATCGAAATCTTTTTACCGCCGCGATGGGTTGTTGAGGTCTGACCGTTCGCC > NC_000913/1129196‑1129468 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |