| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,588,201 | A→G | G32G (GGT→GGC) | ydeR ← | putative fimbrial protein YdeR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,588,201 | 0 | A | G | 92.2% | 239.8 / 5.8 | 77 | G32G (GGT→GGC) | ydeR | putative fimbrial protein YdeR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/2); new base G (41/30); total (45/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
GACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGTTGCCG > NC_000913/1588065‑1588337 | gACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCa < 2:779145/140‑1 (MQ=255)gACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGAAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCa > 2:1099079/1‑140 (MQ=255)gACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGAGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCa > 1:764134/1‑140 (MQ=255) cAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCAtt < 1:1175696/140‑1 (MQ=255) aTCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTaa < 2:216978/140‑1 (MQ=255) aTCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTaa < 1:144755/140‑1 (MQ=255) aTCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGAAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTaa < 1:1099079/140‑1 (MQ=255) cGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACa < 1:63445/140‑1 (MQ=255) tAATGACAAAGTAATGTTGTGCCAGCCAGATGCCGAACCAGTCTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGGTAGCGTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTGGCGACTAGCCGGCCATTAACCGTGa > 2:1065208/1‑140 (MQ=255) tAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGa > 2:743119/1‑140 (MQ=255) aaTGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGAt > 1:1382221/1‑140 (MQ=255) aaTAGTGTGCCAGCCAGATGCAGAACGAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGAGTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATcgg < 1:1327212/140‑1 (MQ=255) tatTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATcggcg < 1:431802/140‑1 (MQ=255) gtgCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCt > 2:784334/1‑140 (MQ=255) gccagccaGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTgg > 2:781383/1‑140 (MQ=255) gccagccaGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTgg > 2:538179/1‑140 (MQ=255) ccagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGga > 2:631497/1‑140 (MQ=255) ccagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGga > 2:568839/1‑140 (MQ=255) ccagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGga > 1:80417/1‑140 (MQ=255) ccagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGga > 1:356161/1‑140 (MQ=255) ccagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGga > 1:1447784/1‑140 (MQ=255) gccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGagag > 1:481016/1‑140 (MQ=255) gccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGagag < 2:364494/140‑1 (MQ=255) gccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGagag < 2:1358518/140‑1 (MQ=255) gccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGagag < 2:764134/140‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATa < 1:359998/140‑1 (MQ=255) ggTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAAcgc > 2:742797/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAAcgc > 2:846344/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGCTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAAcgc > 2:399170/1‑140 (MQ=255) tgttgCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACACGCa < 1:634564/140‑1 (MQ=255) gCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAAc > 2:757199/1‑140 (MQ=255) cAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACg < 2:1534461/140‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACg < 2:356161/140‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACg < 2:481016/140‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACg > 1:1349819/1‑140 (MQ=255) aTTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGTTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAg > 1:76482/1‑140 (MQ=255) gTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAg > 1:1015282/1‑140 (MQ=255) tataAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGAGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAgg > 1:229802/1‑140 (MQ=255) cccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGCGTTGCTGTTAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTtgt > 2:984244/1‑140 (MQ=255) cccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTtgt > 1:1207994/1‑140 (MQ=255) ccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTtgtg < 1:610283/140‑1 (MQ=255) ccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTtgtg < 2:279681/140‑1 (MQ=255) ccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTACAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTtgtg > 1:195928/1‑140 (MQ=255) cGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGa < 2:1447784/140‑1 (MQ=255) aTTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTc < 2:186135/140‑1 (MQ=255) aCGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTTGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCtttt > 1:831264/1‑140 (MQ=255) aCGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCtttt > 2:124073/1‑140 (MQ=255) cGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTc < 1:781383/140‑1 (MQ=255) cGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTc < 2:1234365/140‑1 (MQ=255) aGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCatat > 1:356257/1‑140 (MQ=255) gCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATc < 1:905004/140‑1 (MQ=255) cttTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAc > 2:905519/1‑140 (MQ=255) tttGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAct > 1:1361271/1‑140 (MQ=255) tttGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAct < 1:757199/140‑1 (MQ=255) tttGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAct < 1:743119/140‑1 (MQ=255) ttGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGActc > 1:183497/1‑140 (MQ=255) aaTAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGattatt > 2:341306/1‑140 (MQ=255) aaTAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGattatt > 1:386510/1‑140 (MQ=255) tGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAAt > 1:1140183/1‑140 (MQ=255) tGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAAt > 2:234419/1‑140 (MQ=255) tGCAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGGCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAAt > 2:235300/1‑140 (MQ=255) cAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTc < 1:631497/140‑1 (MQ=255) cAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTc < 1:784334/140‑1 (MQ=255) cAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTc < 1:692096/140‑1 (MQ=255) cAGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTc < 2:1382221/140‑1 (MQ=255) aGGGTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCa < 2:183497/140‑1 (MQ=255) ggTTTAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAg > 1:1084047/1‑140 (MQ=255) tttAGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAggg < 2:1361271/140‑1 (MQ=255) aGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 1:1101024/1‑140 (MQ=255) aGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 2:1245668/1‑140 (MQ=255) aGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 1:483439/1‑140 (MQ=255) aGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 2:100360/1‑140 (MQ=255) aGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 1:331021/1‑140 (MQ=255) aGCGACTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 2:774838/1‑140 (MQ=255) aGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTaa > 1:568475/1‑140 (MQ=255) aCTACCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGt < 1:568839/140‑1 (MQ=255) aCCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGGGAGCTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGTTGc > 1:1175606/1‑140 (MQ=255) aCCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGTTGc > 2:884346/1‑140 (MQ=255) aCCCGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGTTGc > 1:72246/1‑140 (MQ=255) ccGGCCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGTTGCCg < 1:742797/140‑1 (MQ=255) | GACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGACTCTGATTATTGAAATTCAAGGGTAAAGGTTGCCG > NC_000913/1588065‑1588337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |