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MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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2:307347‑M1/1‑22 (MQ=255) gggAACCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagg > 2:294907‑M1/1‑22 (MQ=255) gggAACCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagg > 1:1470463‑M1/1‑22 (MQ=255) ggAACCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacaggg > 2:272295‑M1/1‑21 (MQ=255) gAACCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggt < 2:390500‑M1/140‑121 (MQ=255) aaCCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggta < 1:294907‑M1/140‑122 (MQ=255) aCCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaa < 2:1550933‑M1/140‑123 (MQ=255) gACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaacc < 2:437187‑M1/140‑127 (MQ=255) cATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccat < 2:539520‑M1/140‑129 (MQ=255) aTAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatg < 2:1038314‑M1/140‑130 (MQ=255) tAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgc < 1:1207641‑M1/140‑131 (MQ=255) aaCCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgcc > 1:1529497‑M1/1‑9 (MQ=255) cATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgccatcta > 1:1481615‑M1/1‑4 (MQ=255) tGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgccatctaca > 2:1098186‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACCAGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGAGTGCAATAGAAAATTTCGACGCCCATACGCCCATGATGCAGCAGTATCTCAGGCTGAAAGCCCAGCATCCCGAGATCCTGCTGTTTTACCGGATGGGTGATTTTTATGAACTGTTTTATGACGACGCAAAACGCGCG > NC_000913/2856959‑2857233 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |