| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 892,432 | A→G | T156A (ACG→GCG) | rimK → | ribosomal protein S6 modification protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 892,432 | 0 | A | G | 98.6% | 256.8 / ‑4.8 | 70 | T156A (ACG→GCG) | rimK | ribosomal protein S6 modification protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (27/42); total (27/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
AGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTG > NC_000913/892295‑892564 | aGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGcg > 2:221781/1‑140 (MQ=255) gCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGt < 2:520302/140‑1 (MQ=255) cATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTc < 2:113441/140‑1 (MQ=255) cATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTc < 2:78211/140‑1 (MQ=255) tgcctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGgcggcg > 1:1015187/1‑140 (MQ=255) gcctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGGCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGcggcgg > 2:1195095/1‑140 (MQ=255) cctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGa < 1:131673/140‑1 (MQ=255) cctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGa < 2:1370948/140‑1 (MQ=255) tgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGaaa > 1:1153035/1‑140 (MQ=255) gTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAg < 2:325591/140‑1 (MQ=255) tCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:710463/140‑1 (MQ=255) tCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:306592/140‑1 (MQ=255) tCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:1387546/140‑1 (MQ=255) tCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 1:276785/140‑1 (MQ=255) gCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGAtt > 1:1346297/1‑140 (MQ=255) gCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGAtt > 1:1428580/1‑140 (MQ=255) gCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGAtt > 1:996926/1‑140 (MQ=255) gCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGCCGGTGGAGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGGCGTGCTGGCGGAGGCGCGACAGGCGGCGTAACGCGGGAtt > 2:794247/1‑140 (MQ=255) tGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACg > 1:935475/1‑140 (MQ=255) tGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACg > 1:516923/1‑140 (MQ=255) tGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACg > 2:1088160/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) tCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCTGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 2:1095158/140‑1 (MQ=255) tCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 1:374815/140‑1 (MQ=255) ccGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCgg > 2:7419/1‑140 (MQ=255) cGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGt > 1:1054106/1‑140 (MQ=255) atgatACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTg < 2:656062/140‑1 (MQ=255) atgatACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTg > 1:504090/1‑140 (MQ=255) gatACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGaa < 2:67185/140‑1 (MQ=255) gatACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGaa < 1:1146593/140‑1 (MQ=255) ccAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAAcgcg < 1:79665/140‑1 (MQ=255) tttAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 1:684795/140‑1 (MQ=255) tttAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 2:497589/140‑1 (MQ=255) tttAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 1:1198634/140‑1 (MQ=255) tttAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 2:996926/140‑1 (MQ=255) tttAATCGACATGGTAGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACTCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc > 2:55555/1‑140 (MQ=255) ttAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCt < 1:1431496/140‑1 (MQ=255) cGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGc < 2:1153035/140‑1 (MQ=255) cGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGCGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGc < 2:1428580/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ggTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAat > 1:1339559/1‑140 (MQ=255) gTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAata > 1:1382488/1‑140 (MQ=255) cgcTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGgcg > 1:1515173/1‑140 (MQ=255) cgcTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGgcg < 2:910409/140‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCa > 2:234354/1‑140 (MQ=255) cTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCa < 2:516923/140‑1 (MQ=255) tggtggTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCaa < 2:36043/140‑1 (MQ=255) gtggtCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAgg < 1:789651/140‑1 (MQ=255) aGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGat < 1:1088160/140‑1 (MQ=255) gttgAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCg < 1:234354/140‑1 (MQ=255) tgAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCt < 2:633853/140‑1 (MQ=255) tgAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCt < 2:1256357/140‑1 (MQ=255) tgAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGAGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGAGCACGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGGGCGATATCCGCt > 2:1111185/1‑140 (MQ=255) aGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTc < 2:1080932/140‑1 (MQ=255) ggCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCt < 1:1195095/140‑1 (MQ=255) ggCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCt > 2:79325/1‑140 (MQ=255) gCACGCAGGGAATTGGCGTCGTACTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTg > 1:751330/1‑140 (MQ=255) gCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttg > 2:310493/1‑140 (MQ=255) gAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGc > 2:452856/1‑140 (MQ=255) tcgtGCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTg > 1:819318/1‑140 (MQ=255) gCTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCg < 1:55555/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGc < 2:1292944/140‑1 (MQ=255) ggCGGAGGCGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTg < 1:40888/140‑1 (MQ=255) | AGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTG > NC_000913/892295‑892564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |