| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,522,012 | A→G | F352L (TTC→CTC) | yncD ← | putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,522,012 | 0 | A | G | 98.7% | 271.7 / ‑3.3 | 74 | F352L (TTC→CTC) | yncD | putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (29/44); minor base C (0/1); total (29/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
ATGTTCCACATCAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAACGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGG > NC_000913/1521876‑1522145 | aTGTTCCACATCAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGCAGTTATTGTAGCCCTTGCGGCTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGt > 2:68611/1‑140 (MQ=255) tGTTCCACATCAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTg > 2:1246995/1‑140 (MQ=255) caTCAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGaa > 1:514866/1‑140 (MQ=255) tCAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACg < 1:919983/140‑1 (MQ=255) cAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGc > 1:978492/1‑140 (MQ=255) aGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCGCCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGcc < 2:1184589/140‑1 (MQ=255) aGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGcc < 1:1060587/140‑1 (MQ=255) aGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGcc < 2:305915/140‑1 (MQ=255) aGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGcc < 2:1209447/140‑1 (MQ=255) aGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGcc < 1:1214196/140‑1 (MQ=255) aTTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCa > 1:900108/1‑140 (MQ=255) aTTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCa > 1:1121244/1‑140 (MQ=255) aTTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCa < 2:913115/140‑1 (MQ=255) aTTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGACATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCa < 2:873782/140‑1 (MQ=255) gTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTca > 1:1473204/1‑140 (MQ=255) tcgtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCGGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcacc < 1:1215975/140‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcacc < 1:109467/140‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcacc < 2:530665/140‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACACATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGACCGTGACCGGAACGCCCAGTTcacc < 2:1120445/140‑1 (MQ=255) tcgccgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTTCTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcacc < 2:940111/140‑1 (MQ=255) gtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcaccac > 1:117488/1‑140 (MQ=255) gtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcaccac > 1:317756/1‑140 (MQ=255) gtcgCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCACGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTcaccac > 1:1135051/1‑140 (MQ=255) aCTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAg < 1:1014148/140‑1 (MQ=255) tCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCg < 2:1522681/140‑1 (MQ=255) cACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCgg < 1:765291/140‑1 (MQ=255) cACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCgg < 2:297550/140‑1 (MQ=255) cccTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGc < 2:1306340/139‑1 (MQ=255) ccTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCt < 2:1219679/140‑1 (MQ=255) cTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGCGTGTCCAGCGGCTg > 1:1518009/1‑140 (MQ=255) ttGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTa < 2:401185/140‑1 (MQ=255) tGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTAt < 1:1301016/140‑1 (MQ=255) ccGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTcc < 2:42420/140‑1 (MQ=255) cGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTccc < 2:923082/140‑1 (MQ=255) gTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCt > 2:66304/1‑140 (MQ=255) ggCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATg < 1:1246995/140‑1 (MQ=255) ggCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATg > 1:698159/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGt < 1:87857/140‑1 (MQ=255) tGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGt > 2:961738/1‑140 (MQ=255) gCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGtt > 2:546207/1‑140 (MQ=255) ccGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTg < 1:229717/140‑1 (MQ=255) cGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGc > 2:568645/1‑140 (MQ=255) gCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCa < 1:793030/140‑1 (MQ=255) cTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAg < 2:17290/140‑1 (MQ=255) aGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCAcgccg > 1:538182/1‑140 (MQ=255) aGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCAcgccg > 1:254790/1‑140 (MQ=255) tGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCa < 1:134512/140‑1 (MQ=255) tAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCAtg > 1:1279381/1‑140 (MQ=255) cccTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGa > 1:1478864/1‑140 (MQ=255) cTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAACGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACg > 2:365519/1‑140 (MQ=255) tGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACggg < 2:117488/140‑1 (MQ=255) tGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACggg < 1:521076/140‑1 (MQ=255) tGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACggg > 2:37362/1‑140 (MQ=255) tGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACggg > 1:747007/1‑140 (MQ=255) tGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACggg > 1:639138/1‑140 (MQ=255) gCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCATGCCGCCCGCATGTGACgggg > 2:894945/1‑139 (MQ=255) ttttCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAg < 2:408663/140‑1 (MQ=255) ccATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCCCGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTgtggt < 2:953758/139‑1 (MQ=255) tGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCTGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGcc < 1:280997/140‑1 (MQ=255) gTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCa < 1:703740/140‑1 (MQ=255) gTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCa < 2:660754/140‑1 (MQ=255) gTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCa < 2:627145/140‑1 (MQ=255) gTTTTCGTAGTACAGGCCGTTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCa < 2:98697/140‑1 (MQ=255) ttttCGTAGTTCAGGCCGGTCGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAAGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCAt < 2:784823/140‑1 (MQ=255) ttttCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCAt > 2:940961/1‑140 (MQ=255) tttCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGCCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATg < 2:1518009/140‑1 (MQ=255) ttCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCCGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGCAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATgg > 1:889422/1‑140 (MQ=255) gTAGTTCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTa < 1:568645/140‑1 (MQ=255) ttCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGGTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGa < 2:889422/140‑1 (MQ=255) tgcAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAGCGCCCAGTTCGCCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATGCCCTGGGAGTGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGCCGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGa < 2:698159/138‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGAc < 1:575580/140‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGAc < 1:546207/140‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGAc < 1:361721/140‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGAc < 2:101943/140‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGAc < 2:1509434/140‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGAc < 2:1416449/140‑1 (MQ=255) gCCGGTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGt > 1:1446264/1‑140 (MQ=255) ggTAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACt < 1:68611/140‑1 (MQ=255) tAGTGAGCGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTgg > 1:1079678/1‑140 (MQ=255) | ATGTTCCACATCAGATTGCGTTCGTCGCGACGCAACTCACCTTTTTGCCCGTACTCCGGCATGCCGCTATTCAGGCGGAAGTTATTGTAGCCCTTGCGGTTTTCACTCATGTTTTCGTAGTTCAGGCCGGTAGTGAACGTGACCGGAACGCCCAGTTCACCACGGTGTGTCCAGCGGCTGTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGG > NC_000913/1521876‑1522145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |