Missing coverage evidence...
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ATGGATAATTCAGAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATA  >  NC_000913/3751792‑3751953                                                                                                                                            |                       aTGGATAATTCAGAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTtctc                        <  1:189420/140‑1 (MQ=255) aTGGATAATTCAGAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTtctc                        <  1:256771/140‑1 (MQ=255) aTGGATAATTCAGAAGCAGTTCCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTTACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTtctc                        <  2:964717/140‑1 (MQ=255)       aaTTCAGAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGc                  <  2:144128/140‑1 (MQ=255)             gAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGAtt            <  2:325583/140‑1 (MQ=255)             gAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGAtt            <  2:491269/140‑1 (MQ=255)               aGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCa          <  2:441239/140‑1 (MQ=255)               aGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCa          <  2:717199/140‑1 (MQ=255)                gCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCat         <  1:725531/140‑1 (MQ=255)                  aGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCatat       <  2:683761/140‑1 (MQ=255)                   gTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCa                 >  1:17048/1‑129 (MQ=255)                   gTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCa                 <  2:17048/129‑1 (MQ=255)                   gTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATAtt      >  1:132362/1‑140 (MQ=255)                   gTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATAtt      <  2:879433/140‑1 (MQ=255)                       cgcTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTtata  <  2:132362/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                                            |                       ATGGATAATTCAGAAGCAGTTGCGCTTGCCATAAAAGGCAACGCAAATAACGCCACAATATTGCGATTAATTAACATGTCCGGTATTCCATTTTAAAATAAGATAAAAAAGAGTCGGCATAATAATGCTTACAATTTCTCCGGTGCAAGATTCATATTTATA  >  NC_000913/3751792‑3751953

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑