| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,886,078 | T→C | F335L (TTC→CTC) | yidC → | membrane protein insertase YidC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,886,078 | 0 | T | C | 95.0% | 268.3 / ‑1.0 | 80 | F335L (TTC→CTC) | yidC | membrane protein insertase YidC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/3); new base C (36/40); total (37/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGCCGGTACTGGTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGTTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAGCGCAGTACAC > NC_000913/3885946‑3886208 | cAGCCGGTACTGGTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCAtctc > 2:795651/1‑140 (MQ=255) aGCCGGTACTGGTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCAtctct > 2:830904/1‑140 (MQ=255) ccGGTACTGGTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCa > 2:372672/1‑140 (MQ=255) ccGGTACTGGTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCa > 1:748199/1‑140 (MQ=255) gTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGtt > 2:804496/1‑140 (MQ=255) tCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCa < 1:812876/140‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCa < 1:795651/140‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCa > 2:812876/1‑140 (MQ=255) tgCCTGGTCAGACTGGAGCGATGAAAAGCCCCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGAAAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCCCCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGTTCATCTCTCAGCCGCTGTTCaaa < 2:496143/139‑1 (MQ=255) gCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCg < 1:146971/130‑1 (MQ=255) gCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCg > 2:146971/1‑130 (MQ=255) gCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAAc > 2:461085/1‑140 (MQ=255) gCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAAc > 1:923574/1‑140 (MQ=255) gCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAAc > 1:652957/1‑140 (MQ=255) cTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAActg < 1:804496/140‑1 (MQ=255) gTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGcc < 1:160028/124‑1 (MQ=255) gTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGcc > 2:160028/1‑124 (MQ=255) gTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAActgctg > 2:585058/1‑140 (MQ=255) gTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAActgctg > 1:126905/1‑140 (MQ=255) gTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAActgctg > 2:132257/1‑140 (MQ=255) tCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGa > 1:851996/1‑140 (MQ=255) gACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAAt < 1:479189/140‑1 (MQ=255) gACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAAt < 1:826724/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATgg < 2:748199/140‑1 (MQ=255) cgcgATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATcc > 2:859680/1‑140 (MQ=255) cgcgATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATcc > 2:658518/1‑140 (MQ=255) cgcgATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATcc < 1:543485/140‑1 (MQ=255) gATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATa < 2:923574/140‑1 (MQ=255) tGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGc > 2:206120/1‑140 (MQ=255) gAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCt < 1:202227/140‑1 (MQ=255) gAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCt < 1:658518/140‑1 (MQ=255) aCAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCttt < 1:830904/140‑1 (MQ=255) aCCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTggg < 2:633607/140‑1 (MQ=255) aCCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTggg < 1:206120/140‑1 (MQ=255) tgtgGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAAc > 2:54101/1‑140 (MQ=255) tgtgGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAAc > 2:811606/1‑140 (MQ=255) tgtgGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAAc > 2:706455/1‑140 (MQ=255) gtgGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACt < 1:372672/140‑1 (MQ=255) gTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTgggg < 2:878713/140‑1 (MQ=255) ggCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCtt < 2:851996/140‑1 (MQ=255) ggCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCtt > 1:345670/1‑140 (MQ=255) ggCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCtt > 1:335644/1‑140 (MQ=255) ggCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTAGGGCtt > 2:10622/1‑140 (MQ=255) gCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTtc > 1:744893/1‑140 (MQ=255) cccGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTtct > 2:551060/1‑140 (MQ=255) cccGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTtct > 1:313558/1‑140 (MQ=255) cccGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTtct < 1:706455/140‑1 (MQ=255) cGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGTTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTcc > 2:905919/1‑140 (MQ=255) ggAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCa < 1:811606/140‑1 (MQ=255) gAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCAt > 1:834011/1‑140 (MQ=255) gAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCAt > 2:462850/1‑140 (MQ=255) aaTCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTa < 2:253474/140‑1 (MQ=255) cAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTAtcatcatca < 1:132257/140‑1 (MQ=255) aaTGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCt > 2:810601/1‑140 (MQ=255) ggCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTATCCATTATCATCATCACCTTTa < 1:583177/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGTTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTAt < 1:905919/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTAt < 2:345670/140‑1 (MQ=255) cAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTAtc < 1:585058/140‑1 (MQ=255) cTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTAtcgtt < 2:126905/140‑1 (MQ=255) tGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTg < 1:859680/140‑1 (MQ=255) tGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTg < 2:335644/140‑1 (MQ=255) tGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTg < 1:10622/140‑1 (MQ=255) gCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGTTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGTTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTgg < 2:652957/140‑1 (MQ=255) gCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTgg < 2:313558/140‑1 (MQ=255) cTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGc < 1:461085/140‑1 (MQ=255) cACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGcatcat > 1:129211/1‑140 (MQ=255) ccTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGt > 2:590053/1‑140 (MQ=255) ccGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGcatca > 1:191570/1‑126 (MQ=255) ccGTTGATTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGcatca < 2:191570/126‑1 (MQ=255) aTTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAgcg < 2:502077/140‑1 (MQ=255) aTTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAgcg < 1:462850/140‑1 (MQ=255) aTTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAgcg < 2:744893/140‑1 (MQ=255) aTTACGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAgcg < 2:269701/140‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTTGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAGCGCAg > 2:409338/1‑140 (MQ=255) ggttggttGTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAGCGCAGTa < 2:834011/140‑1 (MQ=255) tggttgTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAGCGCAGTacac < 2:341565/140‑1 (MQ=255) gttgTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATGGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCa > 2:219966/1‑125 (MQ=255) gttgTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATGGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCa < 1:219966/125‑1 (MQ=255) gttgTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCCTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGAc > 2:560389/1‑123 (MQ=255) gttgTGGCTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCCTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGAc < 1:560389/123‑1 (MQ=255) | CAGCCGGTACTGGTTCAGCCTGGTCAGACTGGCGCGATGAACAGCACCCTGTGGGTTGGCCCGGAAATCCAGGACAAAATGGCAGCTGTTGCTCCGCACCTGGATCTGACCGTTGATTACGGTTGGTTGTGGTTCATCTCTCAGCCGCTGTTCAAACTGCTGAAATGGATCCATAGCTTTGTGGGTAACTGGGGCTTCTCCATTATCATCATCACCTTTATCGTTCGTGGCATCATGTACCCGCTGACCAAAGCGCAGTACAC > NC_000913/3885946‑3886208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |