New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
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GCACCTTCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCAT > 1:1341286/1‑140 CTTCCCTAATGTTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAA > 2:2643395/1‑140 CTTCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATGTTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAA < 1:995697/140‑1 CTTCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAA < 1:2826230/140‑1 CTTCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAA > 2:1063994/1‑140 TTCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAAT > 2:727798/1‑140 TCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATT > 1:2326716/1‑140 TCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAG‑GTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTG > 1:529606/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3653092‑3653230 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTT‑CCACCATTTTGTCAATGCTTTT‑‑‑GCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTG < NC_000913/3766089‑3765952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |