New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 722725 | 133 (0.770) | 4 (0.020) | 4/274 | 10.4 | 3.0% | coding (1690/2685 nt) | kdpD | sensory histidine kinase KdpD |
? | NC_000913 | 722729 = | 131 (0.770) | coding (1686/2685 nt) | kdpD | sensory histidine kinase KdpD | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CCCGTAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACATT > NC_000913/722585‑722864 | cccGTAGGTTTTCTCGCCGC‑TTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCgg > 2:2198250/1‑140 (MQ=255) ccGTAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCgg < 1:733453/140‑1 (MQ=255) ccGTAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCgg < 1:1946814/140‑1 (MQ=255) gTAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGAt < 2:792194/140‑1 (MQ=255) gTAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGAt < 2:665755/140‑1 (MQ=255) tAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGAtg > 2:545764/1‑140 (MQ=255) tAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGAtg > 2:2355279/1‑140 (MQ=255) tttCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCGGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTa < 1:1739076/140‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTaa > 1:1405739/1‑140 (MQ=255) tctcGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAAc > 1:495260/1‑140 (MQ=255) tcGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACgg < 2:1274867/140‑1 (MQ=255) tcGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACgg < 1:2326097/140‑1 (MQ=255) tcGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACgg < 2:1612698/140‑1 (MQ=255) gccgcTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCt < 2:129913/140‑1 (MQ=255) ttttAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAAtt < 1:545764/140‑1 (MQ=255) ttttAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAAtt < 1:1659804/140‑1 (MQ=255) tttAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAAttt < 2:275719/140‑1 (MQ=255) ggCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGtt < 2:2470013/140‑1 (MQ=255) cAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCCCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTGGt > 2:670850/1‑140 (MQ=255) tCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGGCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCCCGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCg < 2:673669/140‑1 (MQ=255) cTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTTACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg < 1:1567151/140‑1 (MQ=255) cTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg < 2:1698210/140‑1 (MQ=255) ggtacACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCAt < 1:2544353/130‑1 (MQ=255) ggtacACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGACAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGc < 1:27719/135‑1 (MQ=255) tacACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAacaaca > 2:2881462/1‑140 (MQ=255) tacACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAacaaca > 1:1470176/1‑140 (MQ=255) tacACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAacaaca > 1:312649/1‑140 (MQ=255) cGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGa > 1:2481901/1‑140 (MQ=255) ggTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCG‑‑‑GTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCg > 1:1999612/1‑140 (MQ=255) gTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTg < 2:1641292/140‑1 (MQ=255) gTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTg < 1:145981/140‑1 (MQ=255) gTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTg < 1:2881828/140‑1 (MQ=255) gaCGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAACACTCCACTGCGCGATGGCGTCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGATGTCATCGGGCAACAACAGCTGAATGCg > 2:2608567/2‑140 (MQ=255) aaCGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCg > 1:2813431/1‑140 (MQ=255) aaCGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCg > 1:1301104/1‑140 (MQ=255) gtgtCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGc < 1:76772/140‑1 (MQ=255) gtgtCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGc > 1:1169271/1‑140 (MQ=255) gtgtCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGc > 1:1500050/1‑140 (MQ=255) gtCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCAt > 1:1993823/1‑140 (MQ=255) gtCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCAt > 1:2606251/1‑140 (MQ=255) cGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGa > 1:2162931/1‑140 (MQ=255) cGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGa > 2:143825/1‑140 (MQ=255) cGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGa > 2:2426836/1‑140 (MQ=255) cGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGCCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGa > 1:1842144/1‑140 (MQ=255) ggTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGaa > 1:1826838/1‑140 (MQ=255) ggTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGaa > 1:2195193/1‑140 (MQ=255) tGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAAc < 1:2681201/140‑1 (MQ=255) cccgcgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATg > 2:2798602/1‑134 (MQ=255) cccgcgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATg < 1:2798602/134‑1 (MQ=255) cccgcgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGt > 1:613770/1‑140 (MQ=255) cccgcgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGt > 2:115393/1‑140 (MQ=255) cgcgtccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATTGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTgg < 2:1236925/140‑1 (MQ=255) cgcgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTgg > 2:2624878/1‑140 (MQ=255) cgcgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTgg < 1:2661138/140‑1 (MQ=255) cgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAg < 2:495260/140‑1 (MQ=255) cgcccgcAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCG‑‑‑GTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCa > 2:1924471/1‑140 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aaaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGc > 2:2337725/1‑140 (MQ=255) aaaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGc > 2:2731211/1‑140 (MQ=255) aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCa > 2:767781/1‑140 (MQ=255) aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCa > 2:2489131/1‑140 (MQ=255) ctcACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCg < 1:2739725/138‑1 (MQ=255) aCTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGata > 2:2918429/1‑140 (MQ=255) cTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGatat < 2:2813431/140‑1 (MQ=255) gATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCg < 2:1826838/140‑1 (MQ=255) tCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGcc > 2:257034/1‑140 (MQ=255) tCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGcc > 2:2632340/1‑140 (MQ=255) cccACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGccc < 1:2918429/140‑1 (MQ=255) ccACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGC‑GCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCAc < 1:1621975/140‑1 (MQ=255) aCGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCAcc > 1:1171414/1‑140 (MQ=255) cggcggCATTCCTTGCG‑‑‑GTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGTTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCa < 2:1999612/140‑1 (MQ=255) cGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCa < 1:2489131/140‑1 (MQ=255) cGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCa < 1:618111/140‑1 (MQ=255) cATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCagag > 1:1096452/1‑140 (MQ=255) cATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCagag > 1:2120055/1‑140 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCttt < 1:2624878/140‑1 (MQ=255) cTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTc < 2:2841921/140‑1 (MQ=255) ttGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCg < 1:2881462/140‑1 (MQ=255) ttGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCg < 2:2313905/140‑1 (MQ=255) tGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCGGAGCTTTCg < 1:2656320/139‑1 (MQ=255) tGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGa < 2:2643156/140‑1 (MQ=255) tGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGa < 2:2481901/140‑1 (MQ=255) tGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGa < 1:2731211/140‑1 (MQ=255) tGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGa > 2:1125552/1‑140 (MQ=255) tGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCCGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGa > 1:1078064/1‑140 (MQ=255) gCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGG‑GGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACa < 2:1312820/140‑1 (MQ=255) cGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACa < 2:271924/140‑1 (MQ=255) cGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACa > 1:946351/1‑140 (MQ=255) cGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACa < 1:115393/140‑1 (MQ=255) gATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACAtt < 1:1799004/140‑1 (MQ=255) | CCCGTAGGTTTTCTCGCCGCTTTTTAGCGGCAAAATCTGGTACGGTACACCGGGTAACGTGTCGGTGCCCGCGCCCGCAGGCAGGCCTTTATCAAAACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGGGCAACAACACCTGACTGCGGGCATGAAACGTGGAGGCAATAAATTGTTCGCTGGTGGCAGCGATATCCTGCGGACTGCGGCCCACCGCCAGAGCTTTCGACATT > NC_000913/722585‑722864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |